【摘要】：前期研究發(fā)現(xiàn)多肽9R-P201抑制肝癌HepG2細(xì)胞的存活、增殖、遷移并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。長非編碼RNAs (lncRNAs)是一類長度大于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA,研究已證實(shí)lncRNAs通過在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá)從而參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程。然而,多肽 9R-P201 對肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC) HepG2細(xì)胞的mRNA和lncRNA表達(dá)譜的作用以及機(jī)制尚不清楚。本研究通過對9R-P201處理的肝癌HepG2細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析,共篩選出顯著差異表達(dá)的mRNAs 1557個(gè)以及l(fā)ncRNA881個(gè)。結(jié)構(gòu)特征比較分析表明差異表達(dá)mRNAs和lncRNAs在基因長度、轉(zhuǎn)錄本長度、ORF長度、外顯子個(gè)數(shù)和轉(zhuǎn)錄本個(gè)數(shù)等方面存在顯著差異。GO功能和KEGG信號通路富集分析結(jié)果顯示差異表達(dá)mRNAs和lncRNAs顯著地參與了與腫瘤相關(guān)的生物學(xué)進(jìn)程與信號通路。基于轉(zhuǎn)錄因子(transcription factor,TF)結(jié)合位點(diǎn)分析和蛋白間相互作用分析,我們通過中間中心度篩選得到相互作用關(guān)系富集度高的轉(zhuǎn)錄因子33個(gè)、lncRNA 273個(gè)以及靶基因94個(gè),并構(gòu)建了 TFs-lncRNAs-靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖。此外,我們發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)mRNAs間存在相互作用關(guān)系634條,并構(gòu)建了差異表達(dá)mRNAs間的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖。差異表達(dá)mRNAs和lncRNAs的qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果表明mRNAs和lncRNAs表達(dá)變化情況與測序結(jié)果趨勢一致。我們選擇感興趣并在肝細(xì)胞癌中未曾研究過的差異表達(dá)lncRNA RP11-224019.2進(jìn)行后續(xù)的功能研究。經(jīng)過分析發(fā)現(xiàn)RP11-224019.2在肝癌組織中上調(diào)并與腫瘤大小相關(guān)。通過轉(zhuǎn)染siRNA下調(diào)RP11-224019.2的表達(dá)顯著地抑制HepG2細(xì)胞的增殖、克隆形成、遷移和侵襲并誘導(dǎo)凋亡。最后通過RP11-224019.2共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)和靶基因預(yù)測分析,我們發(fā)現(xiàn)TGFB2的表達(dá)量與 RP11-224019.2 成相關(guān),并且TGFB2與RP11-224019.2屬于antisense 關(guān)系。此外,TGFB2的表達(dá)量在RP11-224019.2被干擾后下調(diào)了88%,這些結(jié)果表明TGFB2可能是RP11-224019.2的潛在靶基因。
【圖文】：

染特別是乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）或丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染是導(dǎo)致肝癌發(fā)生的最關(guān)鍵逡逑病因；此外肝硬化、長期酗酒、食物污染、肥胖、糖尿病、代謝紊亂等也是重要的致病逡逑原因［６］（圖１－１）。除此之外，，一些信號通路、原癌或抑癌基因以及ｍｉＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ逡逑等的異常也是導(dǎo)致肝癌發(fā)生發(fā)展的重要原因［７］。逡逑Ｈｅｐａｔｉｔｉｓ邋Ｂ邋＆邋Ｃ邋Ａｌｃｏｈｏｌ逡逑ＡＨａｔｏｘｉｎ－ｉｎｔａｋｅ逡逑ｉ邐．邐？Ｈｅｐａｔｏｃｅｌ邋丨邋ｕｌａｒ－邋—邋．邋Ｔ＞ｐｃ邋ＩＩ邋ｄｉａｂｅｔｅｓ，逡逑Ｃｉｒｒｈｏｓｉｓ邐Ｃａｒｃｉｎｏｍａ邐Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ邋Ｄｉｓｏｒｄｅｒ，逡逑Ｌｉｖｅｒ邐Ｌｉｖｅｒ邋Ｆｉｂｒｏｓｉｓ邐Ｏｂｅｓｉｔｙ，ＮＡＳＨ／ＮＡＦＬＤ逡逑圖１－１肝細(xì)胞癌發(fā)生的原因ｍ逡逑由Ｘ開放閱讀框編碼的ＨＢｘ蛋白通過激活ＭＡＰＫ和ＪＡＫ／ＳＴＡＴ信號通路來促進(jìn)由逡逑ＨＢＶ感染導(dǎo)致的肝癌的發(fā)展⑷。斑蝥素作用于肝癌細(xì)胞后能增加細(xì)胞內(nèi)Ｐ５３、ｃｙｃｌｉｎＡｌ逡逑和ｃｙｄｉｎＢｌ等基因的表達(dá)，進(jìn)而誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯和細(xì)胞凋亡并使腫瘤的生長停滯［９］。逡逑

IneRNA的起源m
【學(xué)位授予單位】：西南交通大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R735.7

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

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本文編號：2573209