LGR5剪切體在結(jié)直腸癌中的臨床意義和功能研究
【圖文】:
LGR5蛋白屬于G蛋白偶聯(lián)受體家族成員,由一個(gè)較長(zhǎng)的胞外段,一個(gè)七次逡逑跨膜區(qū)和一個(gè)較短的胞內(nèi)段組合而成。全長(zhǎng)ZG欠5由18?jìng)(gè)外顯子編碼,共有四種逡逑剪切體(splice邋variant,邋SPY),在此我們分別簡(jiǎn)稱為邋SPV1、SPV2、SPV3、SPV4逡逑(困1)。其中SPV1為全長(zhǎng)蛋白,SPV2缺失第263至286位氨基酸(第8外顯子),逡逑SPV3缺失第143至214位氨基酸(第5外顯子),SPV4缺失第143至2%位氨基逡逑酸(第5至第8外顯子)。只有SPV4因剪切后移碼,導(dǎo)致無法正常翻譯為蛋白產(chǎn)逡逑物,在此不納入我們的巧究范圍。由于剪切體之間缺失特定的外顯子序列而其余逡逑序列相同,因此制備特異性抗體非常困難。另外,我們也沒有找到商業(yè)化的IG化5逡逑剪切體特異性抗體,因此無法進(jìn)行免疫印跡或免疫組化分析,而只能通過設(shè)計(jì)特逡逑異性引物,使用qPC民對(duì)其豐度進(jìn)行檢測(cè)。為了能正確無誤地設(shè)計(jì)特異性引物,本逡逑部分首先克隆并構(gòu)建了邋SPV1、SPV2和SPV3的質(zhì)粒,,用于檢測(cè)引物的正確性。逡逑隨后在93對(duì)腸癌樣本中檢測(cè)不同剪切體的豐度,結(jié)合樣本的臨床數(shù)據(jù),探究其臨逡逑床意義。逡逑LGR5邋全長(zhǎng)邋SPV1逡逑
浙江大學(xué)巧N學(xué)位論文邐第一部分實(shí)驗(yàn)方法逡逑例:首先W上一步獲得的IG化SPV1為模板,分別用引物IG化5F2和SPV21inker逡逑民,W及引物IGi?5R2和SPV2邋1inkerF擴(kuò)增出剪切位點(diǎn)前后兩個(gè)片段,并分別切逡逑膠回收得到fragmentl和fragment],然后將50ng的兩種片段等物質(zhì)的量比例混合逡逑作為模扳,WIG欠5F2和ZG化5民2為引物進(jìn)行擴(kuò)增,即獲得ZG化5SPV2。同理可逡逑得邐化5SPV3。逡逑2.2.3.1邐SPV1-3邋引物設(shè)計(jì)逡逑NCBI邋Reference邋Sequence;邋NM_003667.3邐BamHI邐.逡逑
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R735.34
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):2534968
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