基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的男性肺腺癌患者代謝組學(xué)研究
發(fā)布時間:2019-08-10 06:59
【摘要】:目的運用代謝組學(xué)方法對男性肺腺癌患者血漿代謝譜進行研究,為前期診斷提供依據(jù)。方法采用基于液相色譜-質(zhì)譜(LC-MS)聯(lián)用技術(shù)的代謝組學(xué)方法對20例健康者和17例肺腺癌患者血中小分子代謝產(chǎn)物進行分析,利用主成分分析法(PCA)和偏最小二乘法(PLS-DA)進行數(shù)據(jù)模式識別,根據(jù)組間代謝群組的差異探討肺腺癌患者的代謝特征。結(jié)果多變量統(tǒng)計分析結(jié)果顯示,健康者與肺腺癌患者樣本存在明顯差異,根據(jù)t檢驗結(jié)果在血漿中找到了16個差異代謝產(chǎn)物。結(jié)論結(jié)合代謝通路分析,肺腺癌患者血漿中溶血磷脂酰膽堿、酯酰肉堿、脂肪酸等代謝通路出現(xiàn)紊亂,經(jīng)鑒定的差異代謝物可作為肺腺癌早期診斷的參考。
【圖文】:
釯縞?個差異代謝產(chǎn)物。其中亞油酸(linoleicacid)、油酸(oleicacid)、棕櫚油酸(palmitoleicacid)、次黃嘌呤(hypoxanthine)、乳酸(lacticacid)、丙酮酸(pyruvicacid)通過與相應(yīng)標準品比對進行鑒定;LysoPC(16:0)、LysoPC(18:1)、LysoPC(18:2)、LysoPC(22:4)、Linoleylcarnitine(carnitine18:2)、脯氨酸甜菜堿(prolinebetaine)通過與A:controlgroupinnegativeionmode;B:lungadenocarcinomagroupinnegativeionmode;C:controlgroupinpositiveionmode;D:lungadenocarcinomagroupinpositiveionmode圖1健康對照組與肺腺癌組血漿樣本的基峰強度色譜圖Figure1Basepeakintensity(BPI)chromatogramsobtainedfromnegativeandpositiveionRRLC-Q-TOF-MSanalysesofhealthycontrolgroupandlungadenocarcinomagroupA:positiveionmode;B:negativeionmode;▲:controlgroup;■:lungadenocarcinomagroup圖2區(qū)分健康對照組與肺腺癌組的3D-PCA得分圖Figure23D-PCAscoreplotsofhealthycontrolandlungadenocarcinomagroups
腫瘤防治研究2017年第44卷第9期CancerResPrevTreat,2017,Vol.44,No.9·609·2.3數(shù)據(jù)分析結(jié)果2.3.1單變量統(tǒng)計結(jié)果通過AgilentMassHunterWorkstation的MPP軟件處理,在正離子模式下獲得了11805個化合物,經(jīng)t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物共有75個;在負離子模式下獲得了9761個化合物,經(jīng)t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物共有63個。2.3.2多變量統(tǒng)計結(jié)果PCA通過多維空間對樣品進行差異篩選,正離子和負離子模式下對照組和肺腺癌組的PCA得分圖,見圖2,圖中每一個圖標代表一個樣本在二維平面的投影,每個樣本的位置由自身所含有的化合物所決定,所含化合物種類及含量相似的樣本距離較近。從圖中可以看出,正離子和負離子模式下,對照組樣本與肺腺癌組樣本均有較好的分離,表明與健康者相比,肺腺癌患者的血漿代謝物譜發(fā)生了明顯的變化。2.3.3差異代謝產(chǎn)物的篩選與鑒定運用PCA將對照組和肺腺癌組的血漿代謝產(chǎn)物進行區(qū)分,正離子和負離子模式下的載荷圖,見圖3,圖中每一個圖標代表一個化合物,距離中心點越遠的化合物對分組的貢獻越大,作為潛在的差異代謝產(chǎn)物,,通過生物標志物在LC-MS/MS下的精確分子量和串聯(lián)質(zhì)譜中裂解譜圖特征與相應(yīng)的標準品或權(quán)威數(shù)據(jù)庫進行比較,根據(jù)比較結(jié)果對可能的潛在生物標志物進行鑒定。運用PLS-DA方法對所有樣本數(shù)據(jù)進行分析,將PCA分析結(jié)果中t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物作為分析對象,擬合參數(shù)為R2Y=0.853,Q2=0.914,結(jié)果表明肺腺癌模型的穩(wěn)定性和預(yù)測率較高。最終在正離子模式下,共鑒定了11個差異代謝產(chǎn)物;負離子模式下,共鑒定了5個差異代謝產(chǎn)物。其中亞油酸(linoleicacid)、油酸(oleicacid)、棕櫚油酸(palmitoleicacid)、次黃嘌呤
【作者單位】: 吉林省腫瘤醫(yī)院中西醫(yī)結(jié)合科;吉林省中醫(yī)院老年病2內(nèi)科;
【基金】:吉林省科技計劃項目(20130102099JC) 吉林省衛(wèi)生科研計劃項目(20132102)
【分類號】:R734.2
【圖文】:
釯縞?個差異代謝產(chǎn)物。其中亞油酸(linoleicacid)、油酸(oleicacid)、棕櫚油酸(palmitoleicacid)、次黃嘌呤(hypoxanthine)、乳酸(lacticacid)、丙酮酸(pyruvicacid)通過與相應(yīng)標準品比對進行鑒定;LysoPC(16:0)、LysoPC(18:1)、LysoPC(18:2)、LysoPC(22:4)、Linoleylcarnitine(carnitine18:2)、脯氨酸甜菜堿(prolinebetaine)通過與A:controlgroupinnegativeionmode;B:lungadenocarcinomagroupinnegativeionmode;C:controlgroupinpositiveionmode;D:lungadenocarcinomagroupinpositiveionmode圖1健康對照組與肺腺癌組血漿樣本的基峰強度色譜圖Figure1Basepeakintensity(BPI)chromatogramsobtainedfromnegativeandpositiveionRRLC-Q-TOF-MSanalysesofhealthycontrolgroupandlungadenocarcinomagroupA:positiveionmode;B:negativeionmode;▲:controlgroup;■:lungadenocarcinomagroup圖2區(qū)分健康對照組與肺腺癌組的3D-PCA得分圖Figure23D-PCAscoreplotsofhealthycontrolandlungadenocarcinomagroups
腫瘤防治研究2017年第44卷第9期CancerResPrevTreat,2017,Vol.44,No.9·609·2.3數(shù)據(jù)分析結(jié)果2.3.1單變量統(tǒng)計結(jié)果通過AgilentMassHunterWorkstation的MPP軟件處理,在正離子模式下獲得了11805個化合物,經(jīng)t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物共有75個;在負離子模式下獲得了9761個化合物,經(jīng)t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物共有63個。2.3.2多變量統(tǒng)計結(jié)果PCA通過多維空間對樣品進行差異篩選,正離子和負離子模式下對照組和肺腺癌組的PCA得分圖,見圖2,圖中每一個圖標代表一個樣本在二維平面的投影,每個樣本的位置由自身所含有的化合物所決定,所含化合物種類及含量相似的樣本距離較近。從圖中可以看出,正離子和負離子模式下,對照組樣本與肺腺癌組樣本均有較好的分離,表明與健康者相比,肺腺癌患者的血漿代謝物譜發(fā)生了明顯的變化。2.3.3差異代謝產(chǎn)物的篩選與鑒定運用PCA將對照組和肺腺癌組的血漿代謝產(chǎn)物進行區(qū)分,正離子和負離子模式下的載荷圖,見圖3,圖中每一個圖標代表一個化合物,距離中心點越遠的化合物對分組的貢獻越大,作為潛在的差異代謝產(chǎn)物,,通過生物標志物在LC-MS/MS下的精確分子量和串聯(lián)質(zhì)譜中裂解譜圖特征與相應(yīng)的標準品或權(quán)威數(shù)據(jù)庫進行比較,根據(jù)比較結(jié)果對可能的潛在生物標志物進行鑒定。運用PLS-DA方法對所有樣本數(shù)據(jù)進行分析,將PCA分析結(jié)果中t檢驗后差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)的化合物作為分析對象,擬合參數(shù)為R2Y=0.853,Q2=0.914,結(jié)果表明肺腺癌模型的穩(wěn)定性和預(yù)測率較高。最終在正離子模式下,共鑒定了11個差異代謝產(chǎn)物;負離子模式下,共鑒定了5個差異代謝產(chǎn)物。其中亞油酸(linoleicacid)、油酸(oleicacid)、棕櫚油酸(palmitoleicacid)、次黃嘌呤
【作者單位】: 吉林省腫瘤醫(yī)院中西醫(yī)結(jié)合科;吉林省中醫(yī)院老年病2內(nèi)科;
【基金】:吉林省科技計劃項目(20130102099JC) 吉林省衛(wèi)生科研計劃項目(20132102)
【分類號】:R734.2
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本文編號:2525044
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