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miR-146a,miR-196a2和miR-499基因多態(tài)性與肝細(xì)胞癌遺傳易感性的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2019-08-01 10:08
【摘要】:肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上最常見的惡性腫瘤之一,具有較高的發(fā)病率和致死率。據(jù)估計(jì)在2012年全世界新發(fā)病例數(shù)約為78200例,而我國(guó)每年肝癌的發(fā)病總數(shù)超過了世界發(fā)病總數(shù)的一半。根據(jù)1997年對(duì)我國(guó)27個(gè)省、市、自治區(qū)1990-1992年抽樣地區(qū)分析,肝癌死亡率約為20.37/10萬(wàn),其中男性29.01/10萬(wàn),女性11.21/10萬(wàn),死亡率在男性人群中僅次于胃癌,位于惡性腫瘤的第2位,在女性則次于胃癌和食管癌,位于第3位。因而HCC嚴(yán)重威脅著我國(guó)人民的生命健康。大量的流行病學(xué)研究已經(jīng)證實(shí),HCC是多因素、多階段、多基因共同作用的復(fù)雜疾病,不同個(gè)體間的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在較大的差異,大多的研究認(rèn)為HCC發(fā)生的個(gè)體差異性取決于復(fù)雜的環(huán)境因素和自身的遺傳因素兩者間的相互作用。microRNA(miRNA)是長(zhǎng)約22核苷酸的非編碼RNA,廣泛存在于從病毒到人類的各種生物中,廣泛參與各種生命活動(dòng),包括細(xì)胞增殖、細(xì)胞發(fā)育、分化、凋亡及腫瘤的發(fā)生發(fā)展,行使多種重要的生物學(xué)功能。研究顯示miRNA在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起著癌基因或抑癌基因的作用。許多研究表明,miRNA與肝癌的發(fā)生、發(fā)展、侵襲轉(zhuǎn)移以及藥物耐藥等方面有著密切的關(guān)系。大量的研究發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵部位基因的遺傳變異將會(huì)引起基因的結(jié)構(gòu)、表達(dá)以及分子調(diào)控功能的變化,從而導(dǎo)致機(jī)體生物學(xué)功能的改變。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是人類可遺傳變異中最常見的一種,主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸變異所引起的DNA序列多態(tài)性。研究顯示,基因遺傳變異(genetic variation)影響個(gè)體患腫瘤的遺傳易感性,SNPs產(chǎn)生的基因結(jié)構(gòu)或表達(dá)量的變化,發(fā)揮基因?qū)C(jī)體的調(diào)控作用。當(dāng)初級(jí)miRNAs(primary miRNAs)上存在重要的功能學(xué)SNPs,則會(huì)影響前體miRNAs(precursor miRNAs)的生成過程,從而引起成熟miRNAs的結(jié)構(gòu)或者表達(dá)異常;成熟的miRNAs生成過程中有多個(gè)關(guān)鍵調(diào)控基因的參與。miRNAs通過與基因3'非翻譯區(qū)(3'untranslate region)結(jié)合引起靶基因mRNA降解或抑制其翻譯,從而參與肝細(xì)胞癌的發(fā)生發(fā)展。因此,當(dāng)SNPs位于成熟的miRNAs上時(shí),直接參與miRNAs對(duì)靶基因的調(diào)控,進(jìn)而導(dǎo)致肝細(xì)胞癌的發(fā)生。研究發(fā)現(xiàn)miR-146a rs2910164(C/G),miR-196a2 rs11614913(C/T)和miR-499 rs3746444(T/C)單個(gè)或多個(gè)SNPs間的聯(lián)合作用與多種腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。同樣,有一些文獻(xiàn)報(bào)道了它們與肝癌遺傳易感性的關(guān)系,但結(jié)果相互矛盾且不確定。在本研究中,我們通過聯(lián)合檢測(cè)肝細(xì)胞癌組和健康對(duì)照組人群的miR-146a rs2910164(C/G),miR-196a2rs11614913(C/T)和 miR-499rs3746444(T/C)基因型的分布,探討miR-146a,miR-196a2和miR-499遺傳變異與中國(guó)人群肝細(xì)胞癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。在2013年4月至2015年3月間共有175例HCC患者和302例健康對(duì)照人群納入研究。通過應(yīng)用多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性對(duì)miR-146a,miR-196a2和miR-499單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行基因分型分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)HCC患者的miR-146a rs2910164(C/G)和對(duì)照組基因型分布有顯著性差異(X 2 = 17.23,P0.001)。在共顯性模型中,與CC基因型相比,miR-146a中的CG和GG基因型的表達(dá)顯著升高HCC的風(fēng)險(xiǎn),調(diào)整后的OR值分別為3.05(95%可信區(qū)間:1.07-8.70)和4.96(95%可信區(qū)間:1.64-14.97)。在隱性模型中,GG基因型肝細(xì)胞癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)是CG+GG基因型的3.75倍,調(diào)整后的OR值分別為3.75(95%可信區(qū)間:1.39-10.11)。然而,在共顯性,顯性、隱性模型中,均沒有觀察到 miR-196a2 rs11614913(C/T)和 miR-499 rs3746444(T/C)與HCC風(fēng)險(xiǎn)間存在顯著的相關(guān)性。攜帶HBV的肝癌患者,miR-146a rs2910164在共顯性模型中,與CC基因型相比,CG和GG基因型的表達(dá)顯著升高HCC的風(fēng)險(xiǎn),調(diào)整后的OR值分別為2.02(95%可信區(qū)間:1.06-5.07)和3.12(95%可信區(qū)間:1.66-10.77);在顯性模型中,CG+GG基因型發(fā)生肝癌的風(fēng)險(xiǎn)是CC型的1.91倍(95%可信區(qū)間:1.85-3.38);在隱性模型中,GG基因型是CG+GG基因型的1.54倍(95%可信區(qū)間:1.15-6.08)。而在HCV感染和HBV及HCV均陰性的肝癌患者中未發(fā)現(xiàn)miR-146a基因多態(tài)性增加HCC發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)。我們的研究顯示,miR-146a rs2910164中GG和CG基因型增加了中國(guó)人群HCC遺傳易感性,尤其對(duì)HBV感染的病人。而miR-196a2 rs11614913(C/T)和miR-499 rs3746444(T/C)多態(tài)性未增加HCC的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。背景:肝細(xì)胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是世界上最常見的惡性腫瘤之一,具有較高的發(fā)病率和致死率。流行病學(xué)研究已經(jīng)證實(shí),肝細(xì)胞癌是多因素、多階段、多基因共同作用的復(fù)雜疾病,不同個(gè)體間HCC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在較大的差異。研究顯示miRNA通過調(diào)節(jié)原癌基因及抑癌基因在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展起著非常重要的作用。當(dāng)初級(jí)miRNAs(primary miRNAs)上存在重要的功能學(xué)SNPs,則會(huì)影響前體miRNAs(precursormiRNAs)的生成過程,從而引起成熟miRNAs的結(jié)構(gòu)或者表達(dá)異常;成熟的miRNAs生成過程中有多個(gè)關(guān)鍵調(diào)控基因的參與。miRNAs通過與靶基因3'非翻譯區(qū)(3'untranslate region)結(jié)合引起靶mRNA降解或抑制其翻譯,從而參與肝細(xì)胞癌的發(fā)生發(fā)展。因此,當(dāng)SNPs位于成熟的miRNAs上時(shí),直接參與miRNAs對(duì)靶基因的調(diào)控,進(jìn)而導(dǎo)致肝細(xì)胞癌的發(fā)生。廣泛的研究試圖調(diào)查miR-146a的rs2910164多態(tài)性對(duì)HCC易感性是否有促進(jìn)作用。然而,這些結(jié)果仍然不一致和不確定。目的:綜合評(píng)估m(xù)iR-146a的rs2910164多態(tài)性與HCC遺傳易感性的關(guān)系。方法:計(jì)算機(jī)檢索Pubmed、Web of Science、Cochrane、萬(wàn)方醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)以及谷歌學(xué)術(shù)等。查找有關(guān)miR-146a基因多態(tài)性與肝細(xì)胞癌遺傳易感性的病例對(duì)照研究,檢索截止日期為2016年10月以電子論文形式發(fā)表的中文和英文文獻(xiàn),對(duì)搜集到的文獻(xiàn)進(jìn)行篩選,對(duì)符合納入標(biāo)準(zhǔn)的文獻(xiàn)進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估,隨后提取數(shù)據(jù)。采用Statal2.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行異質(zhì)性分析,若I250%,P0.10則采用固定效應(yīng)模型,若I250%,P0.10則采用隨機(jī)效應(yīng)模型合并各研究量。系統(tǒng)評(píng)價(jià)miR-146a的rs2910164多態(tài)性與HCC遺傳易感性的關(guān)系。結(jié)果:最終納入文獻(xiàn)18項(xiàng),共有病例5610例和對(duì)照7531例用于薈萃分析。miR-146a rs2910164多態(tài)性與HCC易感性之間無(wú)明顯關(guān)聯(lián)。5個(gè)遺傳模型的結(jié)果果如下:等位基因模型C vs G(OR=0.96,95%CI=0.88-1.06,P=0.440),雜合子模型 CGvsGG(OR=0.99,95%CI=0.90-1.10,P=0.898),純合子模型 CCvs GG(OR=0.91,95%CI=0.75-1.10,P=0.314),顯性模型 CC+CGvsGG(OR=0.97,95%CI=0.79-1.19,P=0.759),隱性模型 CG+GG vs CC(OR=1.05,95%CI=0.94-1.18,P=0.405)。對(duì)種族、對(duì)照人群來源以及HWE分別在5種遺傳模型中進(jìn)行亞組分析,只在隱性模型CG+GG vs CC對(duì)照人群來源為PB亞組中發(fā)現(xiàn)miR-146a rs2910164 多態(tài)性增加 HCC 易感性(OR=1.20,95%CI=1.02-1.40,P =0.024),其余各模型的亞組均未發(fā)現(xiàn)miR-146a rs2910164多態(tài)性與HCC易感性有什么關(guān)聯(lián)。對(duì)HBV感染進(jìn)行分層分析,結(jié)果顯示miR-146ars2910164多態(tài)性增加了 HBV 陽(yáng)性 HCC 發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.26,95%CI=1.10-1.49,P=0.001)。結(jié)論:miR-146a的rs2910164多態(tài)性與HCC發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)之間無(wú)明顯關(guān)聯(lián),但可能增加HBV陽(yáng)性HCC發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)。需要具有更大樣本量和更多族裔群體的設(shè)計(jì)良好的研究來進(jìn)一步驗(yàn)證結(jié)果的可靠性。
【圖文】:

miR-146a,miR-196a2和miR-499基因多態(tài)性與肝細(xì)胞癌遺傳易感性的相關(guān)性研究


它與信使邋RNA邋(mRNA)的非翻譯區(qū)(3'邋untransl化edregion,邋3'邋UTR邋)逡逑結(jié)合,如果完全配對(duì),則裂解或者切割信使RNA,不完全配對(duì)則起到抑制翻譯的逡逑作用[4,邋6](見圖1.邋1),從而引起相應(yīng)的調(diào)控蛋白質(zhì)的缺失或者減少,嚴(yán)重時(shí)逡逑導(dǎo)致疾病的產(chǎn)生。目前在人類基因組中的miRNA己超過巧00多條,,人類大約1/3逡逑的基因受其調(diào)控;上百甚至上千個(gè)mRNA接受同一條miRNA的調(diào)控,不同的miRNA逡逑也可W同時(shí)調(diào)控同一條mRNA,從而構(gòu)成了復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。研究表明,miRNA逡逑的異常表達(dá),包括上調(diào)或下調(diào)1^^?及miRNA自身的遺傳突變與各種腫瘤的發(fā)生過程逡逑密切相關(guān),比如miRNA在腫瘤的發(fā)生、轉(zhuǎn)化、侵襲和轉(zhuǎn)移過程中都發(fā)揮了關(guān)鍵逡逑的作用,因而miRNA能夠起到類似癌基因或抑癌基因的作用[7]。逡逑—_-邋邋邋^邋'邋!逡逑\邐W竄''邐1逡逑/?JuuL逡逑.邐\邐/邐I逡逑.邐Nucleus邐I逡逑?一-邐邊巧邋NA邐j逡逑Nuclei邋pore邋-導(dǎo):邐!邋jTtTTTTT!TTTT邋^邋J逡逑_邐/邋V邋L邋I逡逑3.苗城皆3■}D拖巧y邐r姐理碼乙s^rna邋|逡逑I邐I

miR-146a,miR-196a2和miR-499基因多態(tài)性與肝細(xì)胞癌遺傳易感性的相關(guān)性研究


雙鏈被裂解形成單鏈具有調(diào)控功能的miRNA,即成熟miRNA。成熟miRNA逡逑與RNA誘導(dǎo)的沉默復(fù)合體結(jié)合形成復(fù)合物,miRNA與mRNA的3'町R結(jié)合,介逡逑導(dǎo)復(fù)合物對(duì)祀介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)沉默,抑制基因表達(dá)巧](如圖1.2)。逡逑IJiX逡逑|rDf0si-^邐J逡逑.?一■-?邐-—V邋-邐-逡逑CylDola^i邐一___邐dsRNA邋-邋i逡逑…?:正:.加,“;出。由句:i逡逑的巧心:務(wù)邐去邋sIRNA邐■■逡逑mfRNA---..扣捕邐由丑邋u—邋duplex邐.逡逑棘私換邐I邋Unc浀模溴澹懾義稀澹苠義希粒螅錚裕運(yùn)疲歟椋邋邇懾澹櫻襄危櫻錚媯艫彥巍桑迉r、逡逑assembly邐■方巧堒馬逡逑^挖邋0邐I邋PASO逡逑HIbDsome邐V邋*逡逑X*邋一邋*.、邐/甲…';瓜邋/好—-逡逑.懰巧嚴(yán)評(píng),3——-邋1''叩一-'r?::邐Target逡逑廣^__?邐—、、—,邐舊瞧邋/逡逑尸、RISC邋RISC邐巧邋SC邐/逡逑TranslatlonaJ邋repression邐mRN眾邋cleavage逡逑圖1.2邋miRNA的生物合成巧]。逡逑9逡逑
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R735.7

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 ;miR-93 suppresses proliferation and colony formation of human colon cancer stem cells[J];World Journal of Gastroenterology;2011年42期

2 ;RNA interference and antiviral therapy[J];World Journal of Gastroenterology;2007年39期



本文編號(hào):2521684

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