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CSN5在胃癌中的表達(dá)及與患者預(yù)后的相關(guān)性

發(fā)布時(shí)間:2019-07-09 09:33
【摘要】:目的探討CSN5在胃癌中的表達(dá)及與患者預(yù)后的關(guān)系。方法運(yùn)用cBioportal分析工具,分析CSN5在胃癌中基因水平的改變情況;運(yùn)用qRT-PCR方法檢測(cè)CSN5 mRNA在永生化的正常胃黏膜細(xì)胞株及不同胃癌細(xì)胞株中的表達(dá);運(yùn)用Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)(DErrico、Chen胃癌數(shù)據(jù)集)和TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)(375例胃癌組織和32例癌旁組織),分析CSN5 mRNA在胃癌組織與正常胃黏膜表達(dá)的差異性;運(yùn)用生存期分析軟件Kaplan-Meier plotter,分析CSN5對(duì)876例胃癌患者預(yù)后的影響;運(yùn)用Chen胃癌數(shù)據(jù)集,分析胃癌患者5年生存狀態(tài)與CSN5表達(dá)的關(guān)系。結(jié)果在胃癌中CSN5主要的基因改變形式為擴(kuò)增;CSN5 mRNA在多種胃癌細(xì)胞株中的表達(dá)水平顯著高于正常胃黏膜細(xì)胞株;CSN5 mRNA在胃癌中的表達(dá)顯著高于正常胃黏膜。生存分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),CSN5高表達(dá)的患者總生存期較長(zhǎng),CSN5低表達(dá)的患者總生存期較短。結(jié)論 CSN5在胃癌組織中高表達(dá),且其表達(dá)水平與胃癌患者的預(yù)后呈正相關(guān),即CSN5高表達(dá)的患者,預(yù)后較好。
文內(nèi)圖片:CSN5mRNA在1種正常胃黏膜細(xì)胞株及6種胃癌細(xì)胞株中的相對(duì)表達(dá)情況
圖片說明:CSN5mRNA在1種正常胃黏膜細(xì)胞株及6種胃癌細(xì)胞株中的相對(duì)表達(dá)情況
[Abstract]:Objective to investigate the expression of CSN5 in gastric cancer and its relationship with prognosis. Methods the changes of CSN5 gene level in gastric cancer were analyzed by cBioportal analysis tool, the expression of CSN5 mRNA in immortalized normal gastric mucosa cell lines and different gastric cancer cell lines was detected by qRT-PCR, and the difference of CSN5 mRNA expression between gastric cancer tissues and normal gastric mucosa was analyzed by using Oncomine database (DErrico,Chen gastric cancer dataset) and TCGA database (375 gastric cancer tissues and 32 paracancerous tissues). Survival time analysis software Kaplan-Meier plotter, was used to analyze the effect of CSN5 on the prognosis of 876 patients with gastric cancer, and Chen gastric cancer data set was used to analyze the relationship between 5-year survival status and CSN5 expression in patients with gastric cancer. Results the main gene changes of CSN5 in gastric cancer were amplification, the expression level of CSN5 mRNA in various gastric cancer cell lines was significantly higher than that in normal gastric mucosa cells, and the expression of CSN5 mRNA in gastric cancer was significantly higher than that in normal gastric mucosa. The results of survival analysis showed that the overall survival time of patients with high expression of CSN5 was longer than that of patients with low expression of CSN5. Conclusion the expression of CSN5 is highly expressed in gastric cancer, and its expression level is positively correlated with the prognosis of patients with gastric cancer, that is, the prognosis of patients with high expression of CSN5 is better.
【作者單位】: 山東大學(xué)附屬濟(jì)南市中心醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(81000869,31671468) 山東省自然科學(xué)基金(ZR2016HM15)
【分類號(hào)】:R735.2

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本文編號(hào):2512060

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