DNA錯(cuò)配修復(fù)基因多態(tài)性與原發(fā)性肝癌的關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時(shí)間:2019-03-29 08:21
【摘要】:原發(fā)性肝癌(primary hepatocellular carcinoma,PHC,以下簡(jiǎn)稱肝癌)是最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,在我國(guó)已處于惡性腫瘤死亡率的第二位,其惡性程度極高、預(yù)后極差,嚴(yán)重威脅人們的生命健康。流行病學(xué)和實(shí)驗(yàn)研究均表明,肝癌屬于多因素復(fù)雜疾病,是病毒因素、環(huán)境因素和機(jī)體的遺傳因素交互作用,經(jīng)過(guò)多個(gè)階段的發(fā)展而產(chǎn)生的。目前已揭示的病毒和環(huán)境因素包括乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)或丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染、黃曲霉毒素的攝入、飲水污染(如微囊毒素)、嗜酒和長(zhǎng)期吸煙等。但僅有小部分暴露于這些危險(xiǎn)因素的人群發(fā)生肝癌,究其原因可能與人群或個(gè)體的腫瘤易感性有關(guān),即不同人群或個(gè)體對(duì)致癌物的易感性不同。遺傳因素在肝癌的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮了十分重要的作用。廣泛存在于基因中的多態(tài)性,即單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)作為第3代分子遺傳標(biāo)記,是人類遺傳變異最普遍的形式,具有明顯的個(gè)體差異性。研究顯示,SNP不但與腫瘤的易感性有顯著性關(guān)聯(lián),用于判斷疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),還與腫瘤患者的預(yù)后顯著相關(guān),能作為反映疾病進(jìn)展以及預(yù)后的重要指標(biāo)。DNA錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repair,MMR)基因主要功能是修復(fù)DNA復(fù)制過(guò)程中的單堿基或短序列的錯(cuò)配,對(duì)保持遺傳信息的完整性和穩(wěn)定性,避免遺傳突變的產(chǎn)生具有重要作用。MMR基因的單核苷酸多態(tài)性是個(gè)體DNA錯(cuò)配修復(fù)能力差異的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ),可影響個(gè)體的腫瘤易感性和腫瘤患者的預(yù)后。研究發(fā)現(xiàn),MMR基因與結(jié)腸癌、胃癌、肺癌等腫瘤相關(guān),但MMR基因的多態(tài)性與肝癌的易感、預(yù)后是否存在關(guān)聯(lián),目前尚未見(jiàn)文獻(xiàn)報(bào)道。本研究將探討MMR基因中與腫瘤相關(guān)的15個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),在中國(guó)北方漢族人群中肝癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及預(yù)后的關(guān)聯(lián)性;不同因素對(duì)肝癌患者生活質(zhì)量的影響及EORTC QLQ-C30量表的應(yīng)用。以期闡明MMR基因多態(tài)性在肝癌發(fā)生和疾病進(jìn)展中的作用,對(duì)肝癌易感人群進(jìn)行有針對(duì)性的預(yù)防措施,降低肝癌的發(fā)病率,提高患者的生活質(zhì)量。第一部分DNA錯(cuò)配修復(fù)基因多態(tài)性與原發(fā)性肝癌的易感因素研究目的:本研究擬探討MSH5(rs1150793,rs2075789,rs3117582和rs3131379);MSH3(rs26279和rs184967);MSH4(rs5745549和rs5745325);MSH2(rs1800152和rs1802577);MLH1rs1799977;MLH3rs175080;MSH6rs1042821;PMS1rs5742933及PMS2rs1059060這9個(gè)基因的15個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與原發(fā)性肝癌(PHC)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系。方法:采用以醫(yī)院為基礎(chǔ)的病例-對(duì)照研究,選擇符合條件的研究對(duì)象508例,分成病例組和對(duì)照組。以問(wèn)卷形式收集研究對(duì)象的一般情況、詳細(xì)的臨床資料,并收集肝組織,于-80°C低溫冰箱中保存。使用Qiagen基因組DNA提取試劑盒(德國(guó)Hilden,Qiagen公司)抽提組織DNA,應(yīng)用Sna Pshot實(shí)驗(yàn)平臺(tái)對(duì)已提取的DNA進(jìn)行SNP分型。先進(jìn)行單因素分析,再用非條件Logistic回歸分析校正混雜因素,分析SNP位點(diǎn)與PHC易感性關(guān)聯(lián),最后由SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和分析。結(jié)果: 1 MLH3多態(tài)性位點(diǎn)rs175080與肝癌易感性的關(guān)系MLH3基因的rs175080位點(diǎn)與肝癌的易感性有關(guān),攜帶AA基因型增加了PHC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR值為3.424,95%CI為1.097-10.689)。調(diào)整性別與年齡后,攜帶AA基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶GG基因型的3.424(1.097,10.689)倍(P=0.034),在隱性模型中也存在同樣的關(guān)聯(lián),攜帶AA基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶GG和AG基因型的3.380(1.090,10.481)倍(P=0.035),因此rs175080A為肝癌易感性的危險(xiǎn)因素。2 MSH3多態(tài)性位點(diǎn)rs26279與肝癌易感性的關(guān)系MSH3基因的rs26279位點(diǎn)與肝癌的易感性有關(guān),MSH3rs26279AG和GG基因型增加了PHC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR值分別為1.644和3.300,95%CI分別為1.112-2.428和1.765-6.168)。調(diào)整性別與年齡后,攜帶AG基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶AA基因型的1.644(1.112,2.428)倍(P=0.013),攜帶GG基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶AA基因型的3.300(1.765,6.168)倍(P0.001),在顯性模型和隱性模型中也存在同樣的關(guān)聯(lián),攜帶GG和AG基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶AA基因型的1.913(1.328,2.756)倍(P0.001),攜帶GG基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶AA和AG基因型的2.666(1.463,4.858)倍(P=0.001),rs26279G為肝癌易感性的危險(xiǎn)因素。3 MSH5多態(tài)性位點(diǎn)rs2075789與肝癌易感性的關(guān)系MSH5基因的rs2075789位點(diǎn)與肝癌的易感性有關(guān),MSH5rs2075789AA基因型增加了PHC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR值為9.229,95%CI為1.174-72.535),MSH6(rs1042821)CT基因型降低了PHC的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR值為0.629,95%CI為0.428-0.924)。調(diào)整性別與年齡后,攜帶AA基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶GG基因型9.229(1.174,72.535)倍(P=0.035),在隱性模型中也存在同樣的關(guān)聯(lián),攜帶AA基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶GG和AG基因型的8.829(1.126,69.214)倍(P=0.038),rs2075789A為肝癌易感性的危險(xiǎn)因素。4 MSH6多態(tài)性位點(diǎn)rs1042821與肝癌易感性的關(guān)系MSH6基因的rs1042821位點(diǎn)與肝癌的易感性有關(guān),調(diào)整性別與年齡后,攜帶CT基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶CC基因型0.629(0.428,0.924)倍(P=0.018),在顯性模型中也存在同樣的關(guān)聯(lián),攜帶CT和TT基因型的個(gè)體患肝癌的可能性為攜帶CC基因型的0.677(0.470,0.974)倍,rs1042821T為肝癌易感性的保護(hù)因素。5尚未發(fā)現(xiàn)MSH5基因的rs1150793位點(diǎn),PMS1基因的rs5742933位點(diǎn)和PMS2基因的rs1059060位點(diǎn)與PHC的發(fā)生相關(guān)聯(lián)。結(jié)論: 1在中國(guó)北方漢族人群中,MLH3基因的rs175080位點(diǎn)、MSH3基因的rs26279位點(diǎn)、MSH5基因的rs2075789和MSH6基因的rs1042821位點(diǎn)與肝癌易感性的發(fā)生有關(guān)系。2 MLH3基因的rs175080位點(diǎn)、MSH3基因的rs26279位點(diǎn)、MSH5基因的rs2075789是肝癌發(fā)生的危險(xiǎn)因素,攜帶rs175080A、rs26279G和rs2075789A等位基因的個(gè)體為肝癌發(fā)病高風(fēng)險(xiǎn)人群。3 MSH6基因的rs1042821位點(diǎn)是肝癌發(fā)生的保護(hù)因素,攜帶rs1042821T等位基因的個(gè)體不容易發(fā)生肝癌。4本研究未發(fā)現(xiàn)MSH5基因的rs1150793位點(diǎn),PMS1基因的rs5742933位點(diǎn)和PMS2基因的rs1059060位點(diǎn)與肝癌的發(fā)生相關(guān)聯(lián)。第二部分DNA錯(cuò)配修復(fù)基因多態(tài)性與原發(fā)性肝癌的預(yù)后關(guān)系研究目的:本研究擬探討MSH5(rs1150793,rs2075789,rs3117582和rs3131379);MSH3(rs26279和rs184967);MSH4(rs5745549和rs5745325);MSH2(rs1800152和rs1802577);MLH1rs1799977;MLH3rs175080;MSH6rs1042821;PMS1rs5742933及PMS2rs1059060這9個(gè)基因的15個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)與原發(fā)性肝癌(PHC)根治術(shù)后患者的預(yù)后生存關(guān)系。方法:選擇符合條件的研究對(duì)象250例,以問(wèn)卷形式收集研究對(duì)象的一般情況、詳細(xì)的臨床及預(yù)后生存資料,并收集肝組織,于-80°C低溫冰箱中保存。使用Qiagen基因組DNA提取試劑盒(德國(guó)Hilden,Qiagen公司)抽提組織DNA,應(yīng)用Sna Pshot實(shí)驗(yàn)平臺(tái)對(duì)已提取的DNA進(jìn)行SNP分型。統(tǒng)計(jì)方法采用單因素和多因素Cox回歸模型分析多態(tài)性位點(diǎn)與PHC患者生存期的關(guān)系,并計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)比(Hazard ritiao,HR)和95%置信區(qū)間(95%confidence intervals,95%CI),以P0.05為差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,檢驗(yàn)水準(zhǔn)均為雙側(cè),采用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和分析。結(jié)果: 1 MSH3基因多態(tài)性位點(diǎn)rs26279與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期的關(guān)系經(jīng)單因素分析,在共顯性模型中,攜帶AG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA基因型個(gè)體的1.507(1.101,2.062)倍(P=0.010);在隱性模型中,攜帶GG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA+AG基因型個(gè)體的0.544(0.330,0.898)倍(P=0.017)。以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,結(jié)果與單因素分析一致。2 MSH6基因多態(tài)性位點(diǎn)rs1042821與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期關(guān)系經(jīng)單因素分析,在共顯性模型中,攜帶CT基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶CC基因型個(gè)體的1.518(1.097,2.101)倍(P=0.012),攜帶TT基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶CC基因型個(gè)體的3.067(1.888,4.985)倍(P0.001);在顯性模型中,攜帶CT+TT基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶CC基因型個(gè)體的1.738(1.289,2.344)倍(P0.001);在隱性模型中,攜帶TT基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶CC+CT基因型個(gè)體的2.661(1.665,4.254)倍(P0.001);以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,結(jié)果與單因素分析一致。3 PMS1基因多態(tài)性位點(diǎn)rs5742933與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期關(guān)系經(jīng)單因素分析,在共顯性模型中,攜帶CG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶GG基因型個(gè)體的1.494(1.088,2.051)倍(P=0.013);在顯性模型中,攜帶CG+CC基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶GG基因型個(gè)體的1.499(1.114,2.017)倍(P=0.008);在隱性模型中,尚未發(fā)現(xiàn)Rs5742933與PHC患者生存期有關(guān)。以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,在共顯性模型中,攜帶CC基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶GG基因型個(gè)體的1.941(1.135,3.319)倍(P=0.015);在顯性模型中,尚未發(fā)現(xiàn)Rs5742933與PHC患者生存期有關(guān);在隱性模型中,攜帶CC基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶GG+CG基因型個(gè)體的1.823(1.096,3.033)倍(P=0.021)。4 PMS2基因多態(tài)性位點(diǎn)rs1059060與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期關(guān)系經(jīng)單因素分析,在共顯性模型中,攜帶AG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA基因型個(gè)體的2.176(1.598,2.964)倍(P0.001);在顯性模型中,攜帶AG+GG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA基因型個(gè)體的1.698(1.260,2.289)倍(P=0.001);在隱性模型中,攜帶GG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA+AG基因型個(gè)體的0.445(0.235,0.843)倍(P=0.013);以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,在共顯性模型中,攜帶AG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA基因型個(gè)體的2.123(1.476,3.053)倍(P0.001);在顯性模型中,攜帶AG+GG基因型的個(gè)體死亡風(fēng)險(xiǎn)為攜帶AA基因型個(gè)體的1.563(1.122,2.179)倍(P=0.008);在隱性模型中,尚未發(fā)現(xiàn)rs1059060與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期有關(guān)。5 MLH3基因的多態(tài)性位點(diǎn)rs175080與MSH5基因的多態(tài)性位點(diǎn)rs1150793、rs2075789與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期的相關(guān)性。單因素分析與多因素分析均未發(fā)現(xiàn)rs175080、rs1150793、rs2075789與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期的關(guān)聯(lián)。6各位點(diǎn)對(duì)PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期的聯(lián)合作用將與PHC根治術(shù)后患者生存期有關(guān)的位點(diǎn)聯(lián)合分析,以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,結(jié)果顯示,具有三個(gè)危險(xiǎn)基因型的個(gè)體死亡的風(fēng)險(xiǎn)為無(wú)危險(xiǎn)基因型個(gè)體的4.114(2.210,7.659)倍(P0.001),具有四個(gè)危險(xiǎn)基因型的個(gè)體死亡的風(fēng)險(xiǎn)為無(wú)危險(xiǎn)基因型個(gè)體的10.066(2.927,34.618)倍(P0.001),尚未發(fā)現(xiàn)具有一個(gè)和兩個(gè)危險(xiǎn)基因型個(gè)體與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期的關(guān)聯(lián)。7根據(jù)各位點(diǎn)聯(lián)合作用的分析結(jié)果,將具有兩個(gè)及以下危險(xiǎn)基因型的個(gè)體分為一組,將具有三個(gè)和四個(gè)基因型的個(gè)體分為一組,以性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤類型、Child-Pugh分級(jí)、門脈瘤栓、TNM及基因分型為自變量,以生存時(shí)間為因變量做多因COX回歸分析,結(jié)果顯示,具有三個(gè)以上危險(xiǎn)基因型的個(gè)體死亡的風(fēng)險(xiǎn)為具有兩個(gè)及以下危險(xiǎn)基因型個(gè)體的2.010(1.471,2.747)倍(P0.001)。結(jié)論: 1 MSH3基因多態(tài)性位點(diǎn)rs26279與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后患者生存期有關(guān)。2 MSH6基因多態(tài)性位點(diǎn)rs1042821與PHC患者生存期有關(guān),rs1042821T為影響生存期的危險(xiǎn)等位基因。3 PMS1基因多態(tài)性位點(diǎn)rs5742933與PHC患者生存期有關(guān),rs5742933C為影響生存期的危險(xiǎn)等位基因。4 MSH3基因多態(tài)性位點(diǎn)rs1059060與PHC根治術(shù)后患者預(yù)后生存期有關(guān),rs1059060T為影響生存期的危險(xiǎn)等位基因。5尚未發(fā)現(xiàn)rs175080、rs1150793和rs2075789與PHC患者生存期的相關(guān)性。6腫瘤大小、門脈瘤栓、TNM為影響生存期的獨(dú)立影響因素,腫瘤越大、有門脈血栓、TNM分級(jí)越高,患者死亡風(fēng)險(xiǎn)越高。第三部分中國(guó)北方漢族人群原發(fā)性肝癌的影響因素研究目地:用流行病學(xué)的方法,研究影響中國(guó)北方漢族人群肝癌發(fā)生的危險(xiǎn)因素、不同因素對(duì)肝癌患者生活質(zhì)量的影響及EORTC QLQ-C30量表的應(yīng)用。對(duì)肝癌易感人群進(jìn)行有針對(duì)性的預(yù)防措施,降低肝癌的發(fā)病率,提高患者的生活質(zhì)量。方法:以問(wèn)卷調(diào)查和量表的形式收集符合條件的研究對(duì)象資料。采用病例對(duì)照研究,通過(guò)非條件logistic回歸分析,對(duì)中國(guó)北方漢族人群PHC的易感因素進(jìn)行分析;用多元線性回歸分析,研究不同因素對(duì)肝癌患者生活質(zhì)量的影響;用t檢驗(yàn)、方差分析比較不同患者的生活質(zhì)量得分。結(jié)果: 1 BMI增高,男性,吸煙、飲酒,常食用霉變食品、剩飯菜、腌制食品,乙肝家族史,肝癌家族史,糖尿病患病史,HBV感染及HCV感染為原發(fā)性肝癌的危險(xiǎn)因素(P0.05),多吃蔬菜和水果為原發(fā)性肝癌的保護(hù)性因素2肝癌患者的年齡、家庭月收入、婚姻狀況、肝炎病程、營(yíng)養(yǎng)狀況與生活質(zhì)量關(guān)系密切(P0.05),肝癌患者的性別、文化程度、付費(fèi)方式、居住地對(duì)生活質(zhì)量的影響無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。3 EORTC QLQ-C30量表各項(xiàng)目的克朗巴赫系數(shù)值均在0.710以上,兩次測(cè)量的相關(guān)系數(shù)均在0.690以上,提取的公因子及各條目在公因子上的最大載荷值分布與問(wèn)卷結(jié)構(gòu)相一致;性別、年齡、婚姻狀況對(duì)肝癌患者生活質(zhì)量得分的影響有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論: 1改變吸煙、飲酒等不良生活方式,改善飲食習(xí)慣,積極治療糖尿病、HBV感染及HCV等基礎(chǔ)疾病是預(yù)防中國(guó)北方漢族人群PHC的關(guān)鍵。2在對(duì)肝癌進(jìn)行治療時(shí),應(yīng)關(guān)注影響患者生活質(zhì)量的不同因素,有針對(duì)性地采取防治措施。3應(yīng)用EORTC QLQ-C30量表評(píng)價(jià)肝癌患者生活質(zhì)量具有較好的信度和效度,有助于指導(dǎo)臨床治療,提高肝癌患者的生活質(zhì)量。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R735.7
本文編號(hào):2449333
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:河北醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R735.7
【引證文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):2449333
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