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乳腺癌發(fā)生的特征基因篩選及模式識別

發(fā)布時間:2019-02-26 19:08
【摘要】:本文選取癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫的乳腺癌樣本作為數(shù)據(jù)集,在全基因組的水平上研究乳腺癌病人從正常到發(fā)、衿诨虮磉_(dá)的變化,尋找與乳腺癌發(fā)病密切相關(guān)的特征基因,建立乳腺癌發(fā)生的模式識別分類方法,為乳腺癌預(yù)防及早期診斷提供理論支持.研究中,綜合利用相關(guān)性、t檢驗、置信區(qū)間等統(tǒng)計學(xué)方法,建立乳腺癌發(fā)生特征基因篩選方法,獲得與乳腺癌發(fā)生具有顯著性差異的特征基因336個.通過機(jī)器學(xué)習(xí)方法建模,得到的分類準(zhǔn)確率能達(dá)到98%以上,與之前乳腺癌相關(guān)的研究相比,準(zhǔn)確率更高.同時采用KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析得到與基因顯著相關(guān)(P0.05)的通路有8個,GO(gene ontology)基因功能富集分析顯示與基因顯著相關(guān)(P0.05)的功能有18個.最后對映射在8個通路中的一部分基因進(jìn)行簡要功能分析,說明了其在調(diào)控水平上的密切關(guān)系,表明識別的特征基因在乳腺癌的發(fā)生過程中有重要的作用,這對了解乳腺癌發(fā)病機(jī)理以及乳腺癌的早期診斷非常重要.
[Abstract]:In this paper, breast cancer samples from the cancer genome map database were selected as data sets to study the changes of gene expression from normal to stage 鈪,

本文編號:2431062

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