【摘要】：目的探討微小RNA(microRNA,miRNA)在胃癌組織中的表達(dá)特征。方法采用Exiqon miRNA芯片檢測3對(duì)胃癌組織及其配對(duì)正常胃黏膜組織中miRNA差異表達(dá)情況,隨機(jī)選取10個(gè)上調(diào)或下調(diào)差異表達(dá)的miRNA應(yīng)用qPCR技術(shù)驗(yàn)證;應(yīng)用生物信息學(xué)分析差異表達(dá)的miRNA及其靶向基因在胃癌發(fā)生、發(fā)展中的作用。結(jié)果芯片結(jié)果顯示,在3對(duì)胃癌組織中有111個(gè)miRNA出現(xiàn)差異表達(dá)(差異倍數(shù)2,P0.05),其中上調(diào)表達(dá)95個(gè),下調(diào)表達(dá)16個(gè)。進(jìn)一步行qPCR驗(yàn)證的10個(gè)miRNA的表達(dá)情況與miRNA芯片結(jié)果一致(P=0.040)。聚類分析顯示胃癌組織與癌旁組織存在明顯的差異表達(dá),基因本體(gene ontology,GO)及pathway分析顯示差異表達(dá)的miRNA涉及胃癌的凋亡、周期轉(zhuǎn)換、分化、侵襲、轉(zhuǎn)移及各種腫瘤通路的激活等。結(jié)論胃癌組織中miRNA存在異常表達(dá),可能涉及胃癌的發(fā)生、發(fā)展。
[Abstract]:Objective to investigate the expression of micro RNA (microRNA,miRNA) in gastric carcinoma. Methods Exiqon miRNA microarray was used to detect the differential expression of miRNA in gastric carcinoma and its matched normal gastric mucosa, and 10 up-regulated or down-regulated miRNA were randomly selected to verify by qPCR technique. The role of differentially expressed miRNA and its target genes in the carcinogenesis and development of gastric cancer was analyzed by bioinformatics. Results the microarray results showed that there were 111 miRNA differentially expressed in 3 pairs of gastric cancer tissues (P 0.05), 95 of which were up-regulated and 16 were down-regulated. The expression of 10 miRNA verified by qPCR was consistent with that of miRNA chip (P0. 040). Cluster analysis showed that there was significant difference between gastric cancer tissues and adjacent tissues. Gene ontology,GO and pathway analysis showed that the differentially expressed miRNA was involved in apoptosis, cycle transition, differentiation, invasion, metastasis and activation of various tumor pathways in gastric cancer. Conclusion there is abnormal expression of miRNA in gastric carcinoma, which may be involved in the occurrence and development of gastric cancer.
【作者單位】： 海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院病理科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81260321)
【分類號(hào)】：R735.2

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本文編號(hào)：2290925