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肺癌中Hsa-miR-98靶基因生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-06-05 05:06

  本文選題:肺鱗癌 + Hsa-miR- ; 參考:《生物技術(shù)》2017年04期


【摘要】:[目的]分析肺鱗癌中Hsa-miR-98的靶基因及參與的生物學(xué)過(guò)程和信號(hào)通路。[方法]分析TCGA中收錄的肺鱗癌患者的Hsa-miR-98及生存數(shù)據(jù),通過(guò)4個(gè)靶基因數(shù)據(jù)庫(kù)和表達(dá)數(shù)據(jù)分析Hsa-miR-98靶基因,利用Bi NGO富集分析靶基因功能,通過(guò)DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)富集分析靶基因信號(hào)通路。[結(jié)果]高表達(dá)Hsa-miR-98延長(zhǎng)肺鱗癌患者總生存率和無(wú)復(fù)發(fā)生存率。綜合4個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果,得到Hsa-miR-98的113個(gè)靶基因,其中82個(gè)在肺鱗癌患者癌與癌旁差異表達(dá)。GO分析表明4個(gè)基因參與細(xì)胞膠原的組成,59個(gè)基因參與細(xì)胞的生命活動(dòng),KEGG通路富集到7條通路,包括腫瘤發(fā)生發(fā)展、阿米巴運(yùn)動(dòng)、胞外基質(zhì)的形成等。[結(jié)論]82個(gè)Hsa-miR-98靶基因通過(guò)7條信號(hào)通路,影響細(xì)胞生命活動(dòng),進(jìn)而調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展,使高表達(dá)Hsa-miR-98患者生存期延長(zhǎng)。
[Abstract]:Objective : To analyze the target gene of Hsa - miR - 98 in lung squamous cell carcinoma and the biological process and signal pathway involved in lung squamous cell carcinoma .
【作者單位】: 天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院天津市腫瘤研究所公共實(shí)驗(yàn)室國(guó)家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心天津市腫瘤防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室天津市惡性腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(“Anxa2介導(dǎo)IL-6誘導(dǎo)的SHP2/Erk和JAK2/STAT3信號(hào)通路激活并促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化的分子機(jī)制研究”,No.81372844)
【分類號(hào)】:Q811.4;R734.2
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本文編號(hào):1980671

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