凍融循環(huán)對肝癌新鮮凍存組織RNA完整性的影響
發(fā)布時(shí)間:2018-05-16 22:23
本文選題:凍融 + RNA提取時(shí)間。 參考:《東南大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版)》2017年01期
【摘要】:目的:評估新鮮凍存組織解凍后RNA降解動(dòng)力學(xué)變化,探討反復(fù)凍融對肝癌組織樣本質(zhì)量的影響。方法:將15例肝癌患者術(shù)后組織標(biāo)本各分11份,其中1份用于組織形態(tài)學(xué)驗(yàn)證,另外10份于-80℃保存,取4份標(biāo)本分別在凍融0、1、3、6次后提取RNA,剩余6份標(biāo)本分別在室溫下放置0 min(T0)、5 min(T5)、15min(T15)、30 min(T30)、45 min(T45)及1 h(T60)后進(jìn)行RNA提取,采用微芯片凝膠電泳技術(shù)分析RNA完整性。結(jié)果:切片中腫瘤組織面積均超過85%,壞死組織面積均小于15%,符合國際腫瘤基因組聯(lián)盟制定的標(biāo)準(zhǔn),且與術(shù)后病理學(xué)結(jié)果符合率達(dá)100%。不同凍融次數(shù)組織RNA完整性(RNA integrity number,RIN值)比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001),而且凍融次數(shù)越多,RIN值越低(凍融循環(huán)0、1、3、6次后RIN分別為8.27±0.42、6.38±0.61、5.08±0.61、4.32±0.62)。隨解凍后RNA提取時(shí)間的延長,RNA完整性也不斷降低(T0:RIN=8.33±0.52;T5:RIN=7.95±0.48;T15:RIN=7.09±0.40;T30:RIN=5.88±0.39;T45:RIN=5.06±0.39;T60:RIN=4.40±0.30),與T0時(shí)提取RNA比較,解凍后T30、T45、T60后提取RNA的RIN平均值顯著下降,且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.001)。結(jié)論:當(dāng)研究對RNA質(zhì)量要求比較高時(shí),肝癌組織解凍不應(yīng)超過3次,并且在30 min內(nèi)提取RNA,以保證RNA的完整性。
[Abstract]:Aim: to evaluate the degradation kinetics of RNA after thawing fresh frozen tissue and to investigate the effect of repeated freezing and thawing on the quality of liver cancer tissue. Methods: 15 patients with liver cancer were divided into 11 tissues, one of them was used for histomorphology verification, the other 10 were preserved at -80 鈩,
本文編號:1898677
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