本文選題：結(jié)腸癌 + 長(zhǎng)鏈非編碼RNA��； 參考：《中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院》2015年博士論文

【摘要】：結(jié)腸癌是我國(guó)常見(jiàn)的惡性腫瘤,因發(fā)病隱匿,進(jìn)展迅速,多數(shù)病人就診時(shí)已處于晚期。在全世界范圍內(nèi),每年超過(guò)12萬(wàn)人診斷為結(jié)腸癌,死亡率超過(guò)33%,嚴(yán)重威脅人類健康。結(jié)腸癌的發(fā)生是個(gè)復(fù)雜的過(guò)程,包含了遺傳學(xué)及表觀遺傳學(xué)變化,闡明腫瘤發(fā)生及進(jìn)展的分子機(jī)制,進(jìn)而尋找早期診斷,預(yù)后判斷及治療療效評(píng)估的新的分子標(biāo)記物,具有重要意義。長(zhǎng)鏈非編碼RNA是長(zhǎng)度超過(guò)200nt,無(wú)蛋白編碼能力的RNA分子,可定位于細(xì)胞漿或細(xì)胞核。長(zhǎng)鏈非編碼RNA多由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,但沒(méi)有開(kāi)放閱讀框,具有和編碼蛋白基因相似的表觀遺傳學(xué)特征,如在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)有H3K4me3,轉(zhuǎn)錄區(qū)有H3K36me3的結(jié)合。根據(jù)GENCODE V19報(bào)道,人類基因組中含有多達(dá)13870個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼RNA基因,產(chǎn)生超過(guò)23898條lncRNA。長(zhǎng)鏈非編碼RNA參與調(diào)節(jié)多個(gè)過(guò)程,其表達(dá)和功能異�？蓪�(dǎo)致多種疾病,包括腫瘤。長(zhǎng)鏈非編碼RNA在腫瘤中可發(fā)揮癌基因或抑癌基因的功能,參與調(diào)控腫瘤的增殖,轉(zhuǎn)移,自噬,凋亡等多個(gè)方面。已有文獻(xiàn)報(bào)道,多種長(zhǎng)鏈非編碼RNA的異常和結(jié)腸癌的進(jìn)展密切相關(guān)。雖然有些腫瘤相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA在不同的腫瘤中有類似的表達(dá)和功能,但部分長(zhǎng)鏈非編碼RNA存在腫瘤的特異性,需要描繪結(jié)腸癌特異的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜,并篩選新的結(jié)腸癌特異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,以期發(fā)現(xiàn)結(jié)腸癌診斷和治療的新的標(biāo)記物。在本課題中,我們收集了3例結(jié)腸癌組織樣本及對(duì)應(yīng)的正常組織,病理學(xué)分析確認(rèn)組織類型。分別提取了RNA,質(zhì)檢合格后應(yīng)用Agilent Human lncRNA Microarray。在完成基因芯片制作后進(jìn)行了原始分析,分別采用箱線圖、矩陣圖、主成分分析圖-PCA進(jìn)行芯片質(zhì)量評(píng)估,驗(yàn)證芯片質(zhì)量合格后,對(duì)基因芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行了差異篩選和分析,共發(fā)現(xiàn)了2377個(gè)差異mRNA和4315個(gè)差異lncRNA,其中上調(diào)的mRNA 1461個(gè),下調(diào)的mRNA916個(gè),上調(diào)的lncRNA2137個(gè),下調(diào)的lncRNA2178個(gè),結(jié)果顯示lncRNA在正常結(jié)腸組織樣本和結(jié)腸癌組織樣本中存在明顯的差異表達(dá)。采用生物信息學(xué)、數(shù)學(xué)建模的方法,對(duì)正常結(jié)腸組織樣本和結(jié)腸癌樣本中差異表達(dá)的lncRNA進(jìn)行分析,具體包括：1、GO分析和KEGG分析；2、lncRNA和mRNA共表達(dá)分析；3、lncRNA cis基因共表達(dá)分析；4、lncRNA與其臨近編碼基因的基因組共表達(dá)分析,來(lái)預(yù)測(cè)差異lncRNA可能影響的生物學(xué)通路。結(jié)果顯示差異的lncRNA參與結(jié)腸癌的多種生物學(xué)過(guò)程,如腫瘤的代謝,血管生成,腫瘤的浸潤(rùn)轉(zhuǎn)移,細(xì)胞凋亡等。差異表達(dá)的lncRNA可以通過(guò)GABPA、MYC、ZEB1、MAX、TFAP2C、KAT2A、E2F4、SIN3A等轉(zhuǎn)錄因子來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因的調(diào)控。通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR對(duì)差異基因進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)和芯片結(jié)果完全一致。在本課題中,我們建立了結(jié)腸癌的長(zhǎng)鏈非編碼RNA的差異表達(dá)譜,篩選到多條在結(jié)腸癌中異常表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,并通過(guò)生物信息學(xué)分析初步探討了其可能的分子機(jī)制。對(duì)特定的兩個(gè)lncRNA進(jìn)行了驗(yàn)證,確定其在腫瘤中的高表達(dá),為今后以lncRNA為切入點(diǎn)的結(jié)腸癌診斷和治療奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Long - chain non - coding RNA is a complex process . It can be used to regulate the proliferation , metastasis , autophagy and apoptosis of colon cancer . The expression of lncRNA in normal colon tissue samples and colon cancer tissue samples was analyzed by bioinformatics and mathematical modeling .
2 銆，

本文編號(hào)：1803660