發(fā)布時(shí)間：2018-03-27 04:54

  本文選題：肝癌　切入點(diǎn)：CD44　出處：《廣西醫(yī)科大學(xué)》2016年博士論文

【摘要】：第一部分糖蛋白CD44基因多態(tài)性與肝癌遺傳易感性研究目的:CD44是一種分布極其廣泛,具有高度異質(zhì)性的單鏈跨膜糖蛋白粘附分子,在腫瘤細(xì)胞的增殖、分化、侵襲、浸潤以及轉(zhuǎn)移中發(fā)揮著重要的作用。本研究通過檢測CD44基因rs8193、rs10836347和rs13347三個(gè)位點(diǎn)的基因型及等位基因頻率分布情況,探討CD44基因rs8193、rs10836347和rs13347三個(gè)位點(diǎn)的基因多態(tài)性與肝癌(HCC)患病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。方法:本研究共納入204例肝癌患者和210例對照者,采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性技術(shù)及DNA直接測序法,檢測CD44基因rs8193、rs10836347和rs13347三個(gè)位點(diǎn)的基因多態(tài)性。采用擬和優(yōu)度χ2檢驗(yàn)分析各SNP位點(diǎn)在肝癌組和對照組中基因型頻率的分布是否符合哈-溫平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)。采用Binary logstic回歸通過校正性別、年齡、吸煙和飲酒四個(gè)影響因素計(jì)算比值比(Odds ratios,OR)和95%可信區(qū)間(Confidence Intervals,CI),對基因多態(tài)性和肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果:1.CD44基因三個(gè)SNP基因型頻率在肝癌組和對照組中的分布符合哈-溫平衡,P值均大于0.05,說明選擇的樣本具有群體代表性。2.本研究發(fā)現(xiàn)rs8193位點(diǎn)共有CC、CT和TT三種基因型。以CC基因型為參考基因型,未發(fā)現(xiàn)CT和TT基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)有相關(guān)性(P值均大于0.05)。以C等位基因?yàn)閰⒖蓟?T基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性(P0.05)。無論是在顯性模型還是隱性模型分析時(shí),均未發(fā)現(xiàn)有基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)有相關(guān)性(P值均大于0.05)。3.本研究發(fā)現(xiàn)rs10836347位點(diǎn)共有CC、CT兩種基因型。以CC基因型為參考基因,未發(fā)現(xiàn)CT基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)有相關(guān)性(P=0.253)。以C等位基因?yàn)閰⒖蓟?T基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性(P=0.271)。4.本研究發(fā)現(xiàn)rs13347位點(diǎn)共有CC、CT和TT三種基因型。以CC基因型為參考基因,攜帶CT基因型的個(gè)體可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至1.626倍(95%CI:1.057-2.500,P=0.027)。攜帶TT基因型的個(gè)體可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至1.965倍(95%CI:1.043-3.702,P=0.037)。以C等位基因?yàn)閰⒖蓟?T基因型可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至1.461倍(95%CI:1.091-1.956,P=0.011)。在顯性模型分析中,CT+TT與CC基因型相比,可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至1.697倍(95%CI:1.130-2.549,P=0.011)。在分析隱性模型時(shí),未發(fā)現(xiàn)其與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)有相關(guān)性(P=0.549)。5.對性別、年齡、吸煙和飲酒等危險(xiǎn)因素進(jìn)行分層分析時(shí)發(fā)現(xiàn),女性人群中,rs13347位點(diǎn)的CT基因型可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至2.675倍(95%CI:1.004-7.132,P=0.049),TT基因型可以增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至5.922倍(95%CI:1.083-33.164,P=0.040);在年齡≥50歲組中,rs13347位點(diǎn)的CT基因型可以顯著增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至2.157倍(95%CI:1.113-4.181,P=0.023),TT基因型顯著增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至3.405倍(95%CI:1.263-9.178,P=0.015);在飲酒人群中,rs10836347位點(diǎn)的CT基因型顯著增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至4.552倍(95%CI:1.205-17.192,P=0.025),rs13347位點(diǎn)的CT基因型與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性(P=0.179)。TT基因型顯著增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)至4.549倍(95%CI:1.244-16.635,P=0.022)。6.在進(jìn)行單倍型分析時(shí)發(fā)現(xiàn),TTT單倍型顯著增加了肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)(OR=207.16,P=0.014),表明TTT單倍型可能是肝癌的一個(gè)危險(xiǎn)因素。結(jié)論:CD44基因rs8193、rs10836347位點(diǎn)的基因多態(tài)性與肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性。Rs13347位點(diǎn)的T等位基因的基因突變可增加肝癌的患病風(fēng)險(xiǎn)。第二部分肝癌血清糖蛋白聚糖譜 目的:糖基化修飾是蛋白質(zhì)翻譯后最常見的修飾之一。同一蛋白質(zhì)由于糖鏈結(jié)構(gòu)的差異可能會(huì)導(dǎo)致功能的差異。男性肝癌的發(fā)病率明顯高于女性,而女性的預(yù)后生存率卻明顯高于男性。本部分研究通過凝集素芯片技術(shù)對男性和女性在肝癌發(fā)生過程中的血清糖蛋白譜進(jìn)行檢測,旨在研究其糖蛋白糖譜特征性變化,篩選出男女肝癌差異性的糖譜標(biāo)志,為男女肝癌發(fā)病差異研究提供新思路及實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。方法:實(shí)驗(yàn)主要包含以下步驟:(1)血清低豐度蛋白的收集:等體積混合4組(男性對照組、男性肝癌組、女性對照組和女性肝癌組)患者血清,使用高豐度蛋白去除柱收集血清低豐度蛋白;(2)將收集的低豐度蛋白經(jīng)除鹽、超濾、測定濃度后處理為待標(biāo)記緩沖液;(3)待測低豐度蛋白CY5標(biāo)記;(4)凝集素芯片的點(diǎn)制及芯片的雜交;(5)芯片掃描、數(shù)據(jù)提取;(6)數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)采用SPSS 13.0,符合正態(tài)分布且方差齊性的數(shù)據(jù)采用兩獨(dú)立樣本的均數(shù)t檢驗(yàn),方差不齊者采用非參數(shù)秩和檢驗(yàn)。(7)凝集素印跡。結(jié)果:在男性肝癌組和對照組中共篩選出12種差異的凝集素親和信號,它們是AAL、Con A、DSL、ECL、LCA、MNA-G、MNA-M、PHAE、PSA、SNA,EBL、SNA-I、WFA,WFL。提示在男性肝癌的發(fā)生過程中血清糖蛋白聚糖譜中末端核心巖藻糖、雙天線結(jié)構(gòu)、α1,6連接的巖藻糖半乳糖胺、半乳糖、甘露糖殘基、平分型Glc NAc等糖鏈結(jié)構(gòu)增加,β-1,4半乳糖-N-乙酰葡糖胺和Gal NAcα/β-1,3/6Gal結(jié)構(gòu)減少。在女性肝癌組和對照組中共篩選出13種差異的凝集素親和信號,它們是AAL、CALSEPA、Con A、DSL、LCA、LTL、MNA-M、PHA-E、RCA I,RCA120、SNA,EBL、SNA-I、WFA,WFL、WGA,提示在女性肝癌的發(fā)生過程中血清糖蛋白聚糖譜中末端核心巖藻糖、雙天線甘露糖結(jié)構(gòu)、α1,6連接的巖藻糖半乳糖胺、平分型Glc NAc等糖鏈結(jié)構(gòu)增加,高甘露糖、雙天線結(jié)構(gòu)和Gal NAcα/β-1,3/6Gal結(jié)構(gòu)減少。在男性肝癌組和女性肝癌組中共篩選出7種差異的凝集素親和信號,提示男性肝癌患者血清中含有較多的雙天線、N-乙�；�-D-半乳糖胺、半乳糖、甘露糖殘基、唾液酸等結(jié)構(gòu),而平分型結(jié)構(gòu)和Gal NAcα/β-1,3/6Gal結(jié)構(gòu)較女性肝癌患者減少。結(jié)論:不同性別肝癌患者血清蛋白糖譜存在差異,男性肝癌的高發(fā)病率及高病死率可能和糖鏈結(jié)構(gòu)的改變有關(guān)。第三部分血清DKK1糖蛋白對肝癌診斷價(jià)值交META分析目的:系統(tǒng)評價(jià)血清DKK1對肝癌的診斷價(jià)值。方法:計(jì)算機(jī)檢索外文數(shù)據(jù)庫:Pub Med、EMBASE、Science Direct、Elsevier、Springer、EBSCO、Cochran e library。中文數(shù)據(jù)庫:中國期刊網(wǎng)全文數(shù)據(jù)庫(CNKI)、萬方數(shù)據(jù)庫(WF)、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(CMCC)和中文科技期刊全文數(shù)據(jù)庫(VIP),檢索時(shí)間截止至2016年1月。按照改來的文獻(xiàn)進(jìn)行嚴(yán)格的篩選,提取所需要的納入文獻(xiàn)的基本資料信息。使用Meta-Di Sc軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,根據(jù)異質(zhì)性特點(diǎn)選擇相應(yīng)的效應(yīng)模型進(jìn)行計(jì)算合并的敏感度、特異度、陽性似然比、陰性似然比和診斷比值比(DOR),繪制匯總受試者工作曲線(SROC),并計(jì)算曲線下面積(AUC)。結(jié)果:共檢索到452篇相關(guān)文獻(xiàn),最終納入11篇文獻(xiàn),提供了13個(gè)DKK1診斷肝癌的研究結(jié)果。Meta分析數(shù)據(jù)顯示DKK1診斷肝癌的合并敏感度為72%,合并特異度為88%,DOR為25.95,AUC為0.872。其中的6篇文獻(xiàn),提供8個(gè)DKK1聯(lián)合AFP診斷肝癌的研究結(jié)果,匯總DKK1聯(lián)合AFP診斷肝癌的合并敏感度為81%,合并特異度為85%,DKK1聯(lián)合AFP檢測的DOR為31.28,AUC為0.913。結(jié)論:血清DKK1在肝癌的診斷中具有較高的敏感度。采用DKK1聯(lián)合AFP檢測,可顯著提高兩者對肝癌的診斷效能。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R735.7;R730.43

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 章瑜;俞康;;DKK1基因沉默的人多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞培養(yǎng)上清對小鼠前成骨細(xì)胞成骨分化的影響[J];中國病理生理雜志;2013年06期

2 蒙珊;周芙玲;白改改;;Dickkopf(DKK1)在多發(fā)性骨髓瘤骨病中的作用及其靶向治療的研究進(jìn)展[J];腫瘤;2011年03期

3 徐亮;陸奎英;崔素芬;包廣宇;;DKK1真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及表達(dá)產(chǎn)物鑒定[J];國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2012年23期

4 伊諾;李振華;劉敏;解寶江;王曉娟;王士俊;;DKK1對子宮內(nèi)膜癌Ishikawa細(xì)胞侵襲和遷移能力的影響研究[J];中國全科醫(yī)學(xué);2013年42期

5 彭裕輝;許鎰洧;謝劍君;;血清DKK1在腫瘤臨床應(yīng)用的價(jià)值中[J];癌變.畸變.突變;2014年01期

6 沈秋瑾;孔娟;鄧云;蔣華;胡素文;孔潔;倪濤;游海燕;李宗海;屠紅;張志剛;覃文新;;人源DKK1真核懸浮分泌表達(dá)系統(tǒng)的建立及其特異性抗體的制備和鑒定[J];腫瘤;2011年08期

7 ;DKK1蛋白可作為肝癌診斷標(biāo)志物[J];山東中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2012年05期

8 沈秋瑾;覃文新;;DKK1可作為肝癌早查早診的血清蛋白標(biāo)志物[J];藥品評價(jià);2012年21期

9 海娜;劉義;呂立群;鎮(zhèn)瀾;滿奕村;劉娜;廉紅梅;謝偉;;基因轉(zhuǎn)染DKK1對17β-雌二醇促進(jìn)子宮內(nèi)膜異位癥患者在位子宮內(nèi)膜間質(zhì)細(xì)胞VEGF和MMP-9表達(dá)的影響[J];華中科技大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版);2010年06期

10 伊諾;華文浩;付麗華;周明書;許仲婷;李振華;許艷麗;;siRNA干擾的DKK1低表達(dá)對子宮內(nèi)膜癌Ishikawa細(xì)胞侵襲、遷移的影響及機(jī)制研究[J];中華臨床醫(yī)師雜志(電子版);2013年24期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 章瑜;俞康;;DKK1基因沉默的多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞培養(yǎng)上清對鼠成骨細(xì)胞分化的影響[A];2013年國家級“惡性血液系統(tǒng)疾病診治新進(jìn)展”學(xué)習(xí)班暨學(xué)術(shù)年會(huì)資料匯編[C];2013年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前1條

1 岳陽;DKK1蛋白可作為肝癌血清診斷標(biāo)志物[N];中國醫(yī)藥報(bào);2012年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 鄧燕;肝癌的CD44遺傳易感性、血清糖蛋白聚糖譜性別差異和DKK1標(biāo)志物的分析[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2016年

2 李哲海;Dkk1在骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞成骨、成脂分化的分子調(diào)節(jié)機(jī)制的實(shí)驗(yàn)研究[D];中南大學(xué);2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前2條

1 楊杰;糖皮質(zhì)激素調(diào)控DKK1影響骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞的增殖與分化[D];遼寧醫(yī)學(xué)院;2012年

2 曹貴玲;山羊印記基因H19、Dlk1、CLPG和毛囊發(fā)育相關(guān)基因Dkk1的研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

，

本文編號：1670042