本文選題：甲狀腺乳頭狀癌　切入點(diǎn)：整合分析　出處：《重慶醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的:通過發(fā)現(xiàn)潛在的與甲狀腺乳頭狀癌相關(guān)的基因,為研究其發(fā)病機(jī)理及尋找、識別診斷的標(biāo)志物打下基礎(chǔ)。方法:通過整合分析基因芯片數(shù)據(jù)庫去識別甲狀腺乳頭狀癌與正常甲狀腺組織之間的差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs)。GO(Gene Ontology)功能聚類分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)代謝通路聚類分析去發(fā)掘差異表達(dá)基因的功能。然后建立差異表達(dá)基因間的蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。最后篩選出11個差異表達(dá)基因進(jìn)行q RT-PCR驗證。結(jié)果:本研究獲得了5個GEO(Gene Expression Omnibus)數(shù)據(jù)庫。通過分析,154個差異表達(dá)基因被識別,包括26個上調(diào)基因和128個下調(diào)基因。在蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)中,MLLT1、DLG2和EFEMP1是樞紐蛋白質(zhì),其中DLG2和EFEMP1與腫瘤的進(jìn)程有關(guān)。在選擇的11個上調(diào)和下調(diào)基因中,失調(diào)的TPO、MPPED2和CDH16基因有可能是與甲狀腺乳頭狀癌最相關(guān)的腫瘤基因。結(jié)論:通過整合分析多基因的表達(dá)譜與我們驗證的結(jié)果,本研究推斷下調(diào)的TPO和MPPED2將會成為診斷甲狀腺乳頭狀癌最有可能的診斷標(biāo)志物。
[Abstract]:Objective: to find the potential genes associated with papillary thyroid carcinoma, for studying its pathogenesis and lay a foundation for marker identification and diagnosis. Methods: through the integration analysis of gene chip database to identify the differences between papillary thyroid carcinoma and normal thyroid tissue gene expression (differentially expressed genes DEGs (.GO) Gene Ontology) function cluster analysis and KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway cluster analysis to explore the functions of differentially expressed genes. Then a differentially expressed gene interaction protein (protein-protein interaction PPI) network. Finally screened 11 differentially expressed genes were verified by RT-PCR Q. The results obtained in this study: 5 GEO (Gene Expression Omnibus) database. Through the analysis, identified 154 differentially expressed genes, including 26 up-regulated genes and 128 Down regulated genes. MLLT1 in protein interaction network, DLG2, and EFEMP1 is the hub of proteins, including DLG2 and EFEMP1 and tumor related process. In the 11 up-regulated and down regulated genes selection, dysregulation of TPO MPPED2 and CDH16 gene may be associated with the gene in papillary carcinoma of thyroid tumor. Conclusion through the integrated analysis of multiple gene expression profiles and we validated the results of the study concluded that down-regulation of TPO and MPPED2 will be the diagnosis of papillary thyroid cancer most likely marker.

【學(xué)位授予單位】：重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R736.1

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本文編號：1642405