本文關(guān)鍵詞：KRT81及KIAA0423和MicroRNA結(jié)合位點單核苷酸多態(tài)性與結(jié)腸癌發(fā)生的關(guān)系　出處：《河北醫(yī)科大學》2015年碩士論文　論文類型：學位論文

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【摘要】：目的:Micro RNA(mi RNA)是一類高度保守的小型非編碼RNA,長度為22個核苷酸,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控m RNA的表達。它通過與靶m RNA的3'非翻譯區(qū)(3'untranslated region,3'UTR)序列按照堿基互補的原則結(jié)合,降解靶m RNA或抑制其翻譯,從而實現(xiàn)對靶m RNA的負向調(diào)控。mi RNA調(diào)控大約30%的蛋白編碼基因,在分化、增殖、凋亡等細胞的生物學過程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。近年來越來越多的研究表明,某些miRNA在人類腫瘤細胞中出現(xiàn)異位表達,并且與多種腫瘤的發(fā)生及預后息息相關(guān)。單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是指在基因組水平上由于單個核苷酸的變異導致DNA序列的多樣化,單核苷酸多態(tài)性的存在影響mi RNA與其靶m RNA的互補結(jié)合,進而影響基因的表達。已有研究表明SNP位點的存在與腫瘤的易感性相關(guān),然而關(guān)于miRNA結(jié)合位點的SNP與結(jié)腸癌(colon cancer)發(fā)病關(guān)系的研究有限。已有研究篩選出12個與腫瘤發(fā)生相關(guān)單核苷酸多態(tài)性位點,這些位點均為mi RNA的結(jié)合位點,我們前期研究發(fā)現(xiàn),其中六個多態(tài)性位點因低頻率等位基因出現(xiàn)率小(5%),不適宜進行分析,予以剔除,其余正在研六個位點中,已進行SET8基因上rs16917496位點的單核苷酸多態(tài)性與結(jié)腸癌的關(guān)系的研究,因此本研究擬對KRT81(rs3660),RYR3(rs1044129),KIAA0423(rs1053667),C14orf101(rs4901706)及GOLGA7(rs11337)這五個多態(tài)性位點基因型進行分析,結(jié)合病例-對照研究,以期鑒定出與結(jié)腸癌發(fā)生相關(guān)的SNP位點,對篩查易患結(jié)腸癌的高危人群具有重要意義。方法:1標本采集:病例組的靜脈血標本來自2006年7月至2008年9月間在河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院外科行手術(shù)治療的166名結(jié)腸癌患者,并且詳細記錄結(jié)腸癌患者的臨床特征(性別、年齡等),233例健康對照組的靜脈血來自2011年10月至2012年5月期間在河北醫(yī)科大學第四醫(yī)院體檢的健康人,健康對照組無與結(jié)腸癌相關(guān)的疾病。2基因組DNA的提取、目的片段的擴增及mi RNA結(jié)合位點的單核苷酸多態(tài)性的篩查:用天根DNA純化試劑盒提取血標本的基因組DNA,提取后置于4?C冰箱保存?zhèn)溆�。在NCBI數(shù)據(jù)庫中查找上述5個mi RNA結(jié)合的SNP位點對應(yīng)的目的基因,設(shè)計PCR擴增上下游引物,進行PCR擴增,產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳證實后,送往上海捷瑞生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司,采用聚合酶鏈反應(yīng)-連接酶檢測反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction-Ligase Detection Reaction,PCR-LDR)進行基因型分析。3統(tǒng)計學分析:采用t檢驗(student t-test)比較計量資料,χ2檢驗(Pearson Chi-Square test)或Fisher確切概率法比較計數(shù)資料。非條件Logistic回歸方法計算相對風險度比值比(odds ratio,OR)及95%可信區(qū)間(Confidence Interval,CI)。實驗數(shù)據(jù)均采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學分析,P0.05被認為有統(tǒng)計學意義。結(jié)果:1 KRT81基因上的rs3660位點的G/G基因型與C/G+C/C基因型在結(jié)腸癌組與健康對照組之間的分布頻率存在差異(OR:1.583,95%CI:1.029-2.436,p=0.036);攜帶G/G基因型發(fā)生結(jié)腸癌的風險是攜帶C/G+C/C基因型的1.583倍。KIAA0423基因上的rs1053667位點的T/T基因型與C/T+C/C基因型在結(jié)腸癌組與健康對照組之間的分布頻率存在差異(OR:3.077,95%CI:2.095-6.454,p=0.000)。攜帶T/T基因型發(fā)生結(jié)腸癌的風險是攜帶C/T+C/C基因型的3.077倍。2 rs1044129、rs4901706、rs11337這三個多態(tài)性位點的基因型分布頻率在結(jié)腸癌組與對照組之間無明顯差異(P0.05)。3對結(jié)腸癌組中rs3660及rs1053667位點基因型與各臨床特征進行分析顯示,基因型分布頻率與患者臨床特征(性別、年齡、腫瘤位置、腫瘤長徑、Dukes分期)無相關(guān)性(P0.05)。結(jié)論:1 KRT81基因的rs3660位點和KIAA0423基因的rs1053667位點的基因型分布頻率在結(jié)腸癌組與對照組之間存在差異,提示rs3660、rs1053667這兩個mi RNA結(jié)合位點可以作為預測結(jié)腸癌發(fā)生風險有價值的標志。2尚不能認為KRT81基因的rs3660位點和KIAA0423基因的rs1053667位點的基因型分布頻率與結(jié)腸癌患者的臨床特征(性別、年齡、腫瘤位置、腫瘤長徑、Ducks分期)有相關(guān)性。3 Micro RNA結(jié)合位點的單核苷酸多態(tài)性可以作為預測結(jié)腸癌發(fā)病風險的分子標志物。
【學位授予單位】：河北醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R735.35

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 Faraz Bishehsari;Mahboobeh Mahdavinia;Michele Vacca;Reza Malekzadeh;Renato Mariani-Costantini;;Epidemiological transition of colorectal cancer in developing countries: Environmental factors, molecular pathways, and opportunities for prevention[J];World Journal of Gastroenterology;2014年20期

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1 吳忱思;MicroRNA結(jié)合位點單核苷酸多態(tài)性與原發(fā)性肝癌發(fā)生及其預后的關(guān)系[D];河北醫(yī)科大學;2010年

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本文編號：1319350