microRNA在三陰乳腺癌細(xì)胞株MDA-MB-231腫瘤干細(xì)胞中的表達(dá)譜研究
發(fā)布時間:2017-12-18 00:15
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【摘要】:目的:應(yīng)用miRNA芯片技術(shù)篩選干細(xì)胞培養(yǎng)基成球培養(yǎng)法(spheroid)及貼壁細(xì)胞培養(yǎng)法(attachment)兩種方式培養(yǎng)的細(xì)胞系MDA-MB-231差異表達(dá)的microRNAs(miRNAs),發(fā)現(xiàn)三陰乳腺癌(TNBC)干性相關(guān)的miRNAs。材料與方法:應(yīng)用spheroid培養(yǎng)法篩選TNBC干細(xì)胞,應(yīng)用miRNA芯片技術(shù)篩選spheroid及attachment兩種方式培養(yǎng)細(xì)胞系MDA-MB-231差異表達(dá)的mi RNAs。運用靶基因預(yù)測軟件預(yù)測差異表達(dá)miRNAs可能調(diào)控的靶基因。結(jié)果:1.通過miRNA的芯片檢測及SAM軟件,MDA-MB-23l細(xì)胞系在無血清培養(yǎng)條件下形成的懸浮球體細(xì)胞與貼壁細(xì)胞之間有157個miRNAs的表達(dá)存在程度不等的差異,其中差異在兩倍以上的miRNAs有111個,且皆在懸浮球細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),46個miRNAs在懸浮球細(xì)胞中低表達(dá),而在貼壁細(xì)胞中表達(dá)增高,但是差異倍數(shù)皆≤0.5。2.將基因芯片檢測結(jié)果進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)有5個miRNAs(hsa-miR-297、hsa-miR-3188、hsa-miR-4793-3p、hsa-mi R-34a-5p、hsa-mi R-6768-5p)表達(dá)差異非常明顯,而且這些miRNAs廣泛參與腫瘤細(xì)胞的生長、增殖、凋亡等各種生物學(xué)功能。每一個miRNA都對應(yīng)幾十甚至數(shù)百個靶基因,而且許多靶基因與干性相關(guān)的信號通路有關(guān)系,這些信號通路有Wnt/b-catenin、MAPK、NOTCH等。結(jié)論:1.通過miRNA的芯片檢測及生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)并確定了三陰乳腺癌CSC中hsa-miR-297、hsa-miR-3188、hsa-miR-4793-3p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-6768-5p基因呈差異表達(dá)并發(fā)揮重要作用,進(jìn)一步的分析提示其可能參與了干細(xì)胞調(diào)控的相關(guān)信號通路。2.miRNA在MDA-MB-23l細(xì)胞系腫瘤干細(xì)胞中存在特異性的表達(dá)譜,研究miRNA在MDA-MB-23l細(xì)胞系中特異性的表達(dá)譜將為深入研究TNBC的發(fā)生、發(fā)展以及制定針對TNBC干細(xì)胞的治療策略提供新的方法。
【學(xué)位授予單位】:遼寧中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.9
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本文編號:1302103
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