發(fā)布時(shí)間：2017-12-10 22:30

  本文關(guān)鍵詞：腫瘤相關(guān)基因3’UTR單核苷酸多態(tài)性與瀘州地區(qū)人群結(jié)直腸癌易感性相關(guān)研究

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【摘要】：研究背景及目的:結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)是人類第3大常見惡性腫瘤,在中國,惡性腫瘤已躍居主要疾病死亡率的首位,且結(jié)直腸癌排在危害最大的惡性腫瘤第5位,由于腫瘤發(fā)生的隱匿性,往往發(fā)現(xiàn)時(shí)已是中晚期,對(duì)患者的生存率和生存質(zhì)量都有不可挽回的影響。因此,研究結(jié)直腸癌的發(fā)病機(jī)制,尋找其早期診斷、預(yù)防以及預(yù)后的分子標(biāo)志就顯得尤為重要。結(jié)直腸癌是一個(gè)多基因參與、多因素作用的復(fù)雜疾病。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是廣泛分布于人類基因組中的穩(wěn)定的多態(tài)性位點(diǎn),其最低等位基因頻率0.1,能夠較好的反映個(gè)體遺傳背景及個(gè)體差異。近年來,生物信息技術(shù)的發(fā)展和人類基因組計(jì)劃的成功進(jìn)行,提供了大量的SNPs遺傳信息及實(shí)現(xiàn)對(duì)SNPs快速化、自動(dòng)化、規(guī)�；瘷z測(cè)的技術(shù)手段,使得SNPs在腫瘤的預(yù)后評(píng)估方面具有廣闊的應(yīng)用前景。目前,人類基因組中已發(fā)現(xiàn)超過1000萬個(gè)SNPs位點(diǎn),其中有相當(dāng)一部分多態(tài)性位點(diǎn)落在了3’端非翻譯區(qū)(3’Untranslated Region,3’UTR)。最近的研究已經(jīng)證實(shí),這些位于3’端非翻譯區(qū)的SNPs可能會(huì)通過影響micro RNA(mi RNA)在內(nèi)的多種binding蛋白與m RNA的結(jié)合及改變m RNA的空間構(gòu)象等方式影響m RNA的穩(wěn)定性,從而參與靶基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。本項(xiàng)研究的目的是篩選并探討結(jié)直腸癌相關(guān)基因3’UTR單核苷酸多態(tài)性,分析其與結(jié)直腸癌臨床病理特征的相關(guān)性,為結(jié)直腸癌預(yù)防、早期發(fā)現(xiàn)、早期診斷提供實(shí)用可靠的理論,為進(jìn)一步結(jié)直腸癌發(fā)病的分子機(jī)制及基因表達(dá)調(diào)控研究提供理論基礎(chǔ)。材料及方法:本研究采用“病例-對(duì)照”實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),(1)研究對(duì)象為經(jīng)病理診斷證實(shí)的瀘州及周圍地區(qū)漢族人群結(jié)直腸癌病例371例,同時(shí)收集患者一般個(gè)人資料,包括姓名、性別、年齡、吸煙狀況、飲酒情況和家族史等;患者手術(shù)史;臨床病理資料(病理分型,分化程度,臨床分期)。同時(shí)收集同期、同地區(qū)健康體檢者246例作為對(duì)照,性別、年齡與病例組相匹配。(2)數(shù)據(jù)庫使用美國國立環(huán)境健康科學(xué)研究所(National Institute of Environmental Health Sciences,NIEHS),美國國立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI),國際人類基因組單體型圖計(jì)劃(The International Hap Map Project,Hapmap)等數(shù)據(jù)庫提供的SNPs公共數(shù)據(jù)庫資源平臺(tái)網(wǎng)站對(duì)結(jié)直腸癌相關(guān)基因APC、KRAS、VEGF、TGFBR1的3’UTR單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行初步的生物信息學(xué)篩選及功能預(yù)測(cè)。(3)利用i MLDR法對(duì)617份DNA樣本進(jìn)行相關(guān)基因SNPs基因型檢測(cè)。(4)通過卡方檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)探討候選位點(diǎn)多態(tài)性與結(jié)直腸癌患病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)以及與結(jié)直腸癌患者的臨床病理參數(shù)(腫瘤部位、大小、大體類型、組織學(xué)類型、浸潤深度、分化程度、TNM分期)的關(guān)系,以明確候選位點(diǎn)與結(jié)直腸癌易感性的關(guān)系。擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)(Goodness-of-fit Chi-square test)分析病例及對(duì)照組基因型頻率的分布是否符合H-W平衡;連鎖不平衡和單倍體型分析:應(yīng)用Haploview 4.0及SHEsis-online軟件分析單倍體型及每種單倍體型在病例組和對(duì)照組之間的分布差異。結(jié)果:(1)流行病學(xué)資料分析:結(jié)直腸癌組和健康對(duì)照組之間年齡、性別分布、吸煙情況和飲酒情況無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,差異不顯著(p0.05)。(2)H-W平衡檢驗(yàn):候選SNPs位點(diǎn)在病例組和對(duì)照組分布均符合H-W平衡,差異不顯著(p0.05)。(3)SNPs位點(diǎn)等位基因多態(tài)性分析結(jié)果:rs334348、rs334349、rs3025039、rs3025040和rs1804197位點(diǎn)等位基因頻率分布與結(jié)直腸癌組和健康對(duì)照組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,差異顯著(p0.05)。(4)SNPs位點(diǎn)基因型多態(tài)性分析結(jié)果:rs3025040 CC/CT+TT基因型OR=0.696(0.489~0.992),rs1804197 CC/AA+AC基因型OR=1.584(1.130~2.220)。(5)基因單體型分析結(jié)果:本研究候選基因未找到結(jié)直腸癌易感性相關(guān)單倍體。結(jié)論:(1)KRAS基因上rs1137188與rs9266位點(diǎn)、TGFBR1基因上rs334348與rs334349位點(diǎn)、VEGF基因上rs3025039與rs3025040位點(diǎn)存在完全連鎖不平衡。(2)TGFBR1基因3’UTR多態(tài)性位點(diǎn)rs334348、rs334349與結(jié)直腸癌易感性相關(guān)。其中rs334348位點(diǎn)攜帶A等位基因及rs334349位點(diǎn)攜帶G等位基因個(gè)體,結(jié)直腸癌患病風(fēng)險(xiǎn)高。(3)VEGF基因3’UTR多態(tài)性位點(diǎn)rs3025039、rs3025040與結(jié)直腸癌易感性相關(guān)。攜帶T等位基因個(gè)體結(jié)直腸癌患病風(fēng)險(xiǎn)高。rs3025039位點(diǎn)TT+CT基因型個(gè)體患病風(fēng)險(xiǎn)較CC基因型個(gè)體高。(4)VEGF基因3’UTR多態(tài)性位點(diǎn)rs10434、rs3025053與結(jié)直腸癌易感性無相關(guān)性。(5)APC基因3’UTR多態(tài)性位點(diǎn)rs41116與結(jié)直腸癌易感性無相關(guān)性。rs1804197與結(jié)直腸癌易感性相關(guān),該位點(diǎn)攜帶C等位基因及CC基因型個(gè)體,結(jié)直腸癌患病風(fēng)險(xiǎn)高。(6)KRAS基因3’UTR多態(tài)性位點(diǎn)rs1137188、rs9266與結(jié)直腸癌易感性無相關(guān)性。
【學(xué)位授予單位】：四川醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R735.34

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 王敬慧;張權(quán);張卉;王群慧;楊新杰;顧艷斐;張樹才;;ERCC1基因多態(tài)性與晚期非小細(xì)胞肺癌患者鉑類化療療效的關(guān)系[J];中國肺癌雜志;2010年04期

2 劉偉;王麗;余英豪;王旭洲;武一曼;吳在增;歐陽學(xué)農(nóng);王烈;;k-ras基因在中國結(jié)直腸癌患者中的突變狀態(tài)[J];世界華人消化雜志;2011年13期

3 雷宇鵬;陳紅霞;周曉東;;miR-126調(diào)控胃癌細(xì)胞VEGFA及其下游靶蛋白Akt、mTOR、Erk1/2的表達(dá)[J];世界華人消化雜志;2013年36期

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本文編號(hào)：1276168