代謝產(chǎn)物對(duì)T3期胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)的預(yù)測(cè)
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更多相關(guān)文章: 胃癌 淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 代謝組學(xué) 生物標(biāo)記物
【摘要】:實(shí)驗(yàn)?zāi)康?本實(shí)驗(yàn)針對(duì)胃癌(T3N0)和胃癌(T3N1-3)患者的血液標(biāo)本應(yīng)用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(LC-MS)進(jìn)行檢測(cè),找出胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽(yáng)性和胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陰性的患者之間具有差異的代謝產(chǎn)物,通過(guò)差異代謝產(chǎn)物建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型,研究代謝產(chǎn)物與患者生存與后的關(guān)系。實(shí)驗(yàn)方法:1、樣本處理:將樣本從-80°冰箱中取出,常溫下解凍和處理,加入乙腈、離心,取上清液備用。2、LC-MS分析:采用液相色譜-質(zhì)譜儀對(duì)樣本進(jìn)行檢測(cè),得到胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽(yáng)性和胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陰性患者的血液代謝質(zhì)譜。3、數(shù)據(jù)處理:通過(guò)Marker View軟件對(duì)原始數(shù)據(jù)提取后,進(jìn)一步應(yīng)用主成分分析(principal component analysis,PCA)、t檢驗(yàn)、分層聚類(lèi)分析(hierarchical cluster analysis,HCA)、支持向量機(jī)等統(tǒng)計(jì)方法對(duì)得到的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,找到兩組患者之間有差異的代謝產(chǎn)物,通過(guò)判別分析建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型,進(jìn)一步結(jié)合臨床病理資料和代謝產(chǎn)物建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型,預(yù)測(cè)胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果:第一部分,在116例胃癌患者血液樣本的研究中,通過(guò)整體的總離子流圖可以很直接的得觀(guān)察出兩組樣本代謝產(chǎn)物的差異,主成分分析得分圖能夠?qū)⑽赴┝馨徒Y(jié)轉(zhuǎn)移陽(yáng)性組和胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陰性組區(qū)分開(kāi)來(lái),再經(jīng)過(guò)t檢驗(yàn)獲得69個(gè)差異代謝產(chǎn)物,進(jìn)一步應(yīng)用降維因子分析法得到差異的代謝產(chǎn)物19個(gè),應(yīng)用判別分析法得到8個(gè)差異代謝產(chǎn)物,通過(guò)判別分析建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型,對(duì)訓(xùn)練集和驗(yàn)證集進(jìn)行驗(yàn)證,從而得到模型的精度、特異度和靈敏度。再對(duì)判別分析結(jié)果中預(yù)測(cè)正確的T3N0和預(yù)測(cè)錯(cuò)誤的T3N0進(jìn)行生存分析,結(jié)果預(yù)測(cè)錯(cuò)誤的生存期短且有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。第二部分,應(yīng)用邏輯回歸獲得4個(gè)差異代謝產(chǎn)物和2個(gè)臨床病理參數(shù)建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分險(xiǎn)評(píng)分模型,結(jié)果顯示隨著風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分增加淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率增高。第三部分,將邏輯回歸后獲得4個(gè)差異代謝產(chǎn)物,在人類(lèi)代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)中根據(jù)物質(zhì)質(zhì)核比(M/Z)進(jìn)行結(jié)構(gòu)鑒定,Tyrosyl-Glycine;Cyclic GMP;Homophytanic acid;Farnesyl pyrophosphate.根據(jù)4個(gè)差異代謝產(chǎn)物聚類(lèi)分析,根據(jù)每個(gè)物質(zhì)的響應(yīng)值分組,進(jìn)行生存分析,結(jié)果顯示4個(gè)代謝產(chǎn)物均對(duì)患者生存有影響。結(jié)論:通過(guò)對(duì)胃癌伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陽(yáng)性和胃癌伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移陰性患者的血液標(biāo)本進(jìn)行液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的分析,T3期胃癌不同淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)患者的代謝產(chǎn)物之間存在差異,19種差異代謝產(chǎn)物的聚類(lèi)分析能夠很好區(qū)分T3期胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài),判別分析所建立的判別模型對(duì)患者的生物學(xué)行為有一定預(yù)測(cè)能力,基于代謝產(chǎn)物和臨床病理參數(shù)建立胃癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移預(yù)測(cè)模型有良好的預(yù)測(cè)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的能力,結(jié)果發(fā)現(xiàn)2組患者之間有4種明顯差異的代謝產(chǎn)物:Tyrosyl-Glycine;Cyclic GMP;Homophytanic acid;Farnesyl pyrophosphate。4種代謝產(chǎn)物與患者的生存及預(yù)后有關(guān)。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:R735.2
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,本文編號(hào):1271688
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