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基于GC-TOF-MS的結(jié)直腸癌代謝組學(xué)差異分析

發(fā)布時間:2017-11-19 04:14

  本文關(guān)鍵詞:基于GC-TOF-MS的結(jié)直腸癌代謝組學(xué)差異分析


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【摘要】:[背景]結(jié)直腸癌(CRC)的發(fā)病率和死亡率分別居我國癌癥發(fā)病率和死亡率的第三位和第五位,并且有逐漸上升的趨勢。因為早期癥狀不明顯,缺乏特異性和敏感性較高的血清標(biāo)志物,多數(shù)患者確診時已屬中、晚期,而手術(shù)切除結(jié)合放化療的治療效果逐漸難以滿足病患的期望,因此有必要加深對CRC的了解,以改善治療方法,提高治療效果。近年來興起的代謝組學(xué)研究方法發(fā)現(xiàn)惡性腫瘤組織中的核酸、氨基酸、脂肪酸、糖類等代謝通路發(fā)生改變,使人們對惡性腫瘤細(xì)胞的生命活動有了更深層次的理解,為腫瘤細(xì)胞的研究提供了一個新的角度,并顯示出了巨大潛力。[目的]運用代謝組學(xué)研究方法探索CRC患者癌組織、癌旁黏膜、正常黏膜三種組織間的代謝物差異,并將差異代謝物在數(shù)據(jù)庫中映射,尋找相關(guān)差異代謝通路。[方法]按納入和排除標(biāo)準(zhǔn)選取25例CRC患者,每位患者取癌組織、癌旁黏膜和正常黏膜各一份,首先用N-O-雙(三甲硅基)三氟乙酰胺對樣本進(jìn)行衍生化,然后采用氣相色譜-飛行時間-質(zhì)譜(GC-TOF-MS)分析平臺對組織樣本進(jìn)行代謝組學(xué)檢測,三種組織間相互比較并采用主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)對數(shù)據(jù)建模,分析差異代謝物并在KEGG數(shù)據(jù)庫中映射,尋找相關(guān)代謝通路。[結(jié)果]與正常黏膜相比,癌組織中有47種差異代謝物(p0.05,q0.05),在KEGG數(shù)據(jù)庫中映射后,發(fā)現(xiàn)其半乳糖代謝,磷酸戊糖途徑,谷氨酸和谷氨酰胺代謝,谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代謝明顯改變(p0.05)。其中與半乳糖代謝相關(guān)的差異代謝物有D-果糖,D-半乳糖,甘露糖,葡萄糖和D-半乳糖酸;與磷酸戊糖途徑相關(guān)的差異代謝物有葡萄糖,葡萄糖酸內(nèi)酯,核糖和氨基葡糖酸;與谷氨酸和谷氨酰胺代謝相關(guān)的差異代謝物有L-谷氨酸和L-谷氨酰胺;與谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代謝相關(guān)的差異代謝物有L-天冬氨酸,L-谷氨酸,N-乙酰-L-天冬氨酸和L-谷氨酰胺。與正常黏膜相比,癌旁黏膜中有3種差異代謝物(p0.05,q0.05),在KEGG數(shù)據(jù)庫中映射后,發(fā)現(xiàn)其半乳糖代謝明顯改變(p0.05),其相關(guān)差異代謝物為D-半乳糖酸。癌組織與癌旁黏膜相比,有34種差異代謝物(p0.05,q0,05),在KEGG數(shù)據(jù)庫中映射后,發(fā)現(xiàn)其半乳糖代謝,磷酸戊糖途徑,谷氨酸和谷氨酰胺代謝,谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代謝明顯改變(p0.05)。其中與半乳糖代謝相關(guān)的差異代謝物有D-果糖,D-半乳糖,甘露糖和葡萄糖;與磷酸戊糖途徑相關(guān)差異代謝物有葡萄糖酸內(nèi)酯,葡萄糖和6-磷酸葡萄糖酸;與谷氨酸和谷氨酰胺代謝相關(guān)的差異代謝物有L-谷氨酸和L-谷氨酰胺;與谷氨酸、丙氨酸和天冬氨酸代謝相關(guān)的差異代謝物有L-谷氨酸,N-乙酰-L-天冬氨酸和L-谷氨酰胺。[結(jié)論]CRC癌組織較正常黏膜在糖代謝和氨基酸代謝方面發(fā)生明顯改變,對腫瘤細(xì)胞的生命活動具有重要意義;癌組織與正常黏膜間代謝差異最大,癌旁黏膜與正常黏膜間的代謝差異最小。
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R735.34

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號:1202277

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