大腸癌病理本體的構(gòu)建研究
本文關(guān)鍵詞:大腸癌病理本體的構(gòu)建研究
【摘要】:大腸癌是我國常見的消化道惡性腫瘤之一,且近年來大腸癌的發(fā)病率不斷上升,嚴(yán)重影響我國居民的身心健康。病理診斷是大腸癌確診的重要手段,有臨床腫瘤的“金標(biāo)準(zhǔn)”之稱。當(dāng)前,紙質(zhì)的大腸癌病理學(xué)腫瘤診斷圖譜是醫(yī)學(xué)生和病理醫(yī)生學(xué)習(xí)的主要工具。然而隨著病理學(xué)的發(fā)展和數(shù)字病理技術(shù)的普及,病理知識和病理圖像以前所未有的速度不斷增加,紙質(zhì)大腸癌病理圖譜已不能滿足也不方便病理醫(yī)生及時更新知識的需要。構(gòu)建準(zhǔn)確完整且能及時更新的在線大腸癌病理知識庫成為迫切需求。計算機輔助診斷(Computer Aided Diagnosis, CAD)對提高大腸癌病理診斷的效率和準(zhǔn)確性有很大的潛力。近年來基于深度學(xué)習(xí)的計算機視覺技術(shù)使精準(zhǔn)的病理輔助診斷成為可能。CAD尤其深度學(xué)習(xí)需要大規(guī)模的數(shù)據(jù)集,而當(dāng)前大腸癌病理數(shù)據(jù)資源分散且缺乏標(biāo)準(zhǔn)的標(biāo)注方式,造成不同機構(gòu)的數(shù)據(jù)難以進行整合,已成為CAD的主要障礙。為了解決以上病理學(xué)中存在的問題,本論文構(gòu)建了大腸癌病理本體,并利用大腸癌病理本體建立大腸癌病理知識庫,同時對簡單的大腸癌診斷CAD規(guī)則進行探索。本文的主要工作及采用的關(guān)鍵技術(shù)如下:首先,通過對各種知識表示方式的比較研究,確定了使用本體技術(shù)構(gòu)建大腸癌病理知識庫的結(jié)構(gòu),通過網(wǎng)絡(luò)本體語言(Web Ontology Language, OWL)語言來對大腸癌病理知識進行描述。其次,本文提出了一種新的構(gòu)建本體的方法——翻譯法,并使用翻譯法將小鼠病理本體擴展為人類病理本體,并在病理本體中擴充了大腸癌的相關(guān)概念,并使用protege本體編輯器構(gòu)建出大腸癌病理本體。再次,本文利用Vitro系統(tǒng)建立了大腸癌病理知識庫,實現(xiàn)了大腸癌病理知識的存儲、瀏覽、圖像標(biāo)注、檢索和SPARQL查詢,并與臨床合作,在病理知識庫中添加了3800條左右的大腸癌病例,方便病理醫(yī)生和醫(yī)學(xué)生學(xué)習(xí)。同時本文提出了一種機器學(xué)習(xí)與規(guī)則推理相結(jié)合的計算機病理輔助診斷流程——機器學(xué)習(xí)邏輯(Machine Learning Logic, MLogic),為臨床腫瘤病理知識庫構(gòu)建提出一條新的途徑。最后,嘗試使用SWRL規(guī)則實現(xiàn)簡單的大腸癌診斷的CAD規(guī)則。論文中還有很多研究得不夠深入的問題,有待今后繼續(xù)改進與完善。
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R735.34
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,本文編號:1172367
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