青島地區(qū)淋巴瘤中EB病毒編碼基因EBNA1多態(tài)性研究
本文關(guān)鍵詞:青島地區(qū)淋巴瘤中EB病毒編碼基因EBNA1多態(tài)性研究
更多相關(guān)文章: EB病毒 人皰疹病毒 EBV核抗原1 基因多態(tài)性
【摘要】:目的EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)與人類淋巴瘤的發(fā)生密切相關(guān),其分布具有一定的地域性和人群傾向性,除環(huán)境因素和遺傳因素外,是否存在與EBV陽性淋巴瘤相關(guān)的EBV基因變異一直是倍受關(guān)注。本研究采用聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)結(jié)合DNA測(cè)序技術(shù)檢測(cè)山東青島地區(qū)EBV陽性淋巴瘤組織中EBV核抗原1(Epstein-Barr virus nuclear antigen 1,EBNA1)編碼基因序列,旨在探討EBNA1編碼基因序列變異在淋巴瘤發(fā)生中的意義,明確其變異是具有地域性抑或腫瘤特異性。方法采用原位雜交技術(shù)檢測(cè)山東省青島市622例淋巴瘤患者腫瘤組織中EBV編碼的小RNA 1(EBV-encoded small RNA 1,EBER1)以篩選EBV陽性淋巴瘤標(biāo)本,巢式PCR結(jié)合DNA測(cè)序檢測(cè)EBV陽性淋巴瘤標(biāo)本中EBNA1編碼基因多態(tài)性。應(yīng)用DNAStar軟件對(duì)EBNA1編碼基因序列檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析,與EBV標(biāo)準(zhǔn)株序列比較,根據(jù)EBNA1蛋白487位氨基酸(AA)的變異情況分型;并根據(jù)EBNA3C基因的缺失序列采用PCR技術(shù)對(duì)EBV陽性淋巴瘤標(biāo)本進(jìn)行EBV 1/2分型。結(jié)果①622例淋巴瘤中共有110例檢測(cè)到EBER1陽性信號(hào),陽性率為17.68%;羝娼鹆馨土(Hodgkin's lymphoma,HL)的陽性率為33.33%(35/105),NK/T細(xì)胞淋巴瘤的陽性率為78.67%(59/75),彌漫大B細(xì)胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)的陽性率為1.34%(5/372)和T細(xì)胞淋巴瘤的陽性率為15.71%(11/70)。②EBNA1根據(jù)其C端487位點(diǎn)氨基酸的變化及其它共有突變可分為5種亞型,本研究共檢測(cè)到4種亞型,包括V-val變異型,原型P-thr,V-Leu變異型以及P-ala原型,檢出率分別為67.3%(74/110),15.5%(17/110),3.6%(4/110)和10.9%(12/110)。③統(tǒng)計(jì)學(xué)分析顯示,4種EBNA1亞型在淋巴瘤組織中的分布無顯著性差異(P=0.383);與EBV相關(guān)胃癌(EBV-associated gastric carcinoma,EBVaGC)、鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)及健康攜帶者咽漱液(throat washing,TW)相比,EBNA1亞型的分布也無顯著性差異(P0.05)。④4種淋巴瘤組織中1型EBV、2型EBV以及1+2混合型EBV的分布沒有顯著不同(P=0.089),而淋巴瘤分別與NPC,EBVaGC和TWs比較EBV分型均有顯著性差異(P=0.002,P=0.007,P=0.001)。根據(jù)EBV 1/2分型將淋巴瘤分為3組,即type1,type2和type1+2,3組中EBNA1亞型V-val,P-thr,V-leu和P-ala的分布沒有顯著不同(P=0.553)。結(jié)論①EBV陽性淋巴瘤標(biāo)本共檢測(cè)到V-val,P-thr,V-Leu和P-ala 4種EBNA1亞型,V-val是青島地區(qū)淋巴瘤中最為常見亞型,由于該亞型同時(shí)也是亞洲地區(qū)最常見的亞型,而此結(jié)果與其它地區(qū)的相關(guān)報(bào)道不同,表明V-val亞型呈地域相關(guān)性。②青島地區(qū)EBV陽性淋巴瘤、NPC、EBVaGC組織和EBV健康攜帶者TWs中,以及4種EBV陽性淋巴瘤間EBNA1亞型的分布均無顯著性差異,表明EBNA1亞型不具有腫瘤特異性,在淋巴瘤的發(fā)生中不具有選擇傾向性,進(jìn)一步支持其地域相關(guān)性特點(diǎn)。③與NPC,EBVaGC和TWs不同,EBV陽性淋巴瘤組織中檢測(cè)到更多1型EBV和2型EBV的共同感染,尤其以T細(xì)胞淋巴瘤中較為明顯,推測(cè)2型EBV可能更易感染初級(jí)T細(xì)胞,1型EBV和2型EBV混合感染可能具有有協(xié)同效應(yīng)。④淋巴瘤組織中EBV1/2分型與EBNA1亞型之間沒有關(guān)聯(lián)性。
【關(guān)鍵詞】:EB病毒 人皰疹病毒 EBV核抗原1 基因多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R733.1
【目錄】:
- 摘要2-4
- ABSTRACT4-7
- 前言7-9
- 第一章 材料與方法9-16
- 1.1 儀器、試劑和耗材9-10
- 1.2 標(biāo)本和細(xì)胞10
- 1.3 核酸提取10-12
- 1.4 EBV陽性淋巴瘤標(biāo)本的篩選12-14
- 1.5 EBNA1編碼基因引物設(shè)計(jì)和DNA擴(kuò)增14
- 1.6 DNA序列分析14-15
- 1.7 EBV1型和2型的定義15
- 1.8 統(tǒng)計(jì)分析15-16
- 第二章 結(jié)果16-22
- 2.1 EBV陽性標(biāo)本鑒定16
- 2.2 EBNA1C末端序列的類型16-19
- 2.3 EBV陽性淋巴瘤組織中EBNA1亞型的分布19-20
- 2.4 EBV 1/2 分型和EBNA1亞型的關(guān)系20-22
- 第三章 討論22-27
- 結(jié)論27-28
- 參考文獻(xiàn)28-32
- 綜述32-64
- 摘要32
- 引言32
- 1. DNA的復(fù)制功能32-37
- 2. 有絲分裂隔離功能37-41
- 3. 轉(zhuǎn)錄影響41-44
- 4. 細(xì)胞永生化和轉(zhuǎn)化44-47
- 5. EBNA1的轉(zhuǎn)化和免疫逃避47-48
- 總結(jié)48-49
- 參考文獻(xiàn)49-64
- 攻讀學(xué)位期間的學(xué)術(shù)成果64-65
- 致謝65-66
【共引文獻(xiàn)】
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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條
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,本文編號(hào):1130968
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