淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌中Hsa-miRNA-133a表達(dá)的研究
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更多相關(guān)文章: 食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC) miRNA-133a VEGFA 生物信息學(xué)
【摘要】:目的:探討江蘇淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)中miRNA-133a的表達(dá)特征并對其生物信息學(xué)進(jìn)行分析研究。方法:采用Microarray流體芯片技術(shù)及熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitatie realtime Polymerase Chain Reaction,qPCR)技術(shù)檢測食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織及癌旁組織中miRNA-133a表達(dá);通過miRBase、NCBI、UCSC Browser等在線工具分析,iRNA-133a序列特征;應(yīng)用niRanda、TargetScan預(yù)測miRNA-133a的靶基因,并結(jié)合已證實(shí)的靶標(biāo)基因,進(jìn)行功能富集分析(Gene Ontology)和信號通路富集分析(Pathway Enrichment),并采用Western Blot技術(shù)檢測miRNA-133a過表達(dá)/沉默后ESCC細(xì)胞中靶基因蛋白表達(dá)水平。結(jié)果:1.流體芯片技術(shù)及qRT-PCR技術(shù)檢測的結(jié)果均表明:淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織中miRNA-133a表達(dá)水平顯著低于癌旁組織(P0.05);2.伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)的miRNA-133a表達(dá)水平低于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(P0.05);3.食管鱗癌細(xì)胞株(KYSE-150、ECA109)中niRNA-133a的表達(dá)比正常食管上皮細(xì)胞株Het-1A顯著降低(P0.05),但食管鱗癌細(xì)胞株高分化和低分化組間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05):4miRNA-133a在各物種之間具有高度保守性,其靶基因功能分別富集于蛋白質(zhì)修飾、細(xì)胞增殖及凋亡等生物學(xué)過程(P0.001),涉及腫瘤、細(xì)胞凋亡等信號通路(P0.05);5.參與腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因血管內(nèi)皮生長因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)可能為miRNA-133a的靶基因。結(jié)論:1.淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織中hsa-miRNA-133a表達(dá)水平顯著低于癌旁組織;2.伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)中hsa-miRNA-133a表達(dá)低于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC),hsa-miRNA-133a可能與腫瘤的轉(zhuǎn)移相關(guān);3. miRNA-133a可能通過與VEGFA基因相互作用參與腫瘤轉(zhuǎn)移的發(fā)生。
【關(guān)鍵詞】:食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC) miRNA-133a VEGFA 生物信息學(xué)
【學(xué)位授予單位】:東南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.1
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- 英文摘要6-9
- 縮略詞表9-11
- 前言11-13
- 文獻(xiàn)綜述13-17
- 資料和方法17-26
- 實(shí)驗(yàn)結(jié)果26-34
- 討論34-37
- 結(jié)論37-38
- 參考文獻(xiàn)38-43
- 附錄(該文已發(fā)表于《山東醫(yī)藥》雜志)43-50
- 附錄(讀碩士期間發(fā)表論文)50-51
- 致謝51
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本文編號:1125077
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