本文關(guān)鍵詞：女性乳腺癌相關(guān)基因異常甲基化研究

  更多相關(guān)文章： 乳腺癌 表觀遺傳學(xué) 甲基化 MSP 免疫組化 BRCA1 Meta分析

【摘要】：目的:乳腺癌(Breast cancer,BC)是女性最常見的惡性腫瘤之一,乳腺癌相關(guān)基因的功能學(xué)異常與乳腺癌發(fā)生發(fā)展有關(guān)已得到廣泛認(rèn)可。早期研究多關(guān)注編碼基因的單核苷酸多態(tài)(SNP),這是人類可遺傳變異中最常見的一種,被認(rèn)為是人類疾病易感性和藥物敏感性的決定性因素之一。隨著分子生物學(xué)研究的深入,人們發(fā)現(xiàn)DNA序列以外的調(diào)控異常在腫瘤發(fā)生、發(fā)展過程中更為普遍,這種不依賴于DNA序列變化的可遺傳調(diào)控稱為表觀遺傳(Epigenetics)改變,主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質(zhì)重塑和micro RNAs等。與傳統(tǒng)的蛋白類生物標(biāo)志物相比,DNA甲基化改變常常是細(xì)胞癌變過程中更為早期的事件,可能在腫瘤早期診斷中具有更大的價(jià)值,有望成為乳腺癌患者診斷和預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物。本次研究旨在(1)探討乳腺癌相關(guān)基因的異常甲基化頻率及應(yīng)用于乳腺癌診斷的臨床價(jià)值;(2)系統(tǒng)評(píng)價(jià)與乳腺癌相關(guān)的BRCA1基因啟動(dòng)子甲基化和乳腺癌患者臨床預(yù)后之間的關(guān)系。方法:本研究分兩部分,第一部分,采用病例對(duì)照研究設(shè)計(jì)和分子流行病學(xué)研究方法,分析BRCA1,GSTP1,P16INK4A,MGMT,PTEN,RARβ2和CCND2基因甲基化與乳腺癌的關(guān)聯(lián)。共納入70例臨床確診的乳腺癌患者為病例組,并以20例罹患乳腺良性疾病(Benign breast disease,BBD)的患者作為對(duì)照。采用甲基化特異性PCR(Methylation-specific PCR,MSP)方法檢測候選基因的啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況,并應(yīng)用免疫組化實(shí)驗(yàn)檢測相關(guān)基因的蛋白表達(dá)。采用靈敏度、特異度和受試者工作特征(Receiver operator characteristic,ROC)曲線下面積(Area under the curve,AUC)表示DNA甲基化生物標(biāo)志物應(yīng)用于乳腺癌診斷的價(jià)值。第二部分,根據(jù)PRISMA指南,應(yīng)用meta分析系統(tǒng)評(píng)價(jià)乳腺癌相關(guān)基因BRCA1甲基化與疾病預(yù)后的關(guān)聯(lián)。文獻(xiàn)來源于Pub Med,Web of Science和Embase數(shù)據(jù)庫,文獻(xiàn)檢索截止日期為2014年12月。采用合并風(fēng)險(xiǎn)比(Hazard ratio,HR)及其95%可信區(qū)間(Confidence interval,CI)來評(píng)價(jià)對(duì)預(yù)后的效應(yīng)。根據(jù)異質(zhì)性檢驗(yàn)結(jié)果來選擇隨機(jī)效應(yīng)模型或固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析。結(jié)果:(1)分子流行病學(xué)研究顯示,94.3%的乳腺癌患者至少有一個(gè)基因發(fā)生甲基化,乳腺癌組織中BRCA1,GSTP1,P16INK4A,MGMT,PTEN,RARβ2和CCND2的甲基化率分別為24.3%,31.4%,40.0%,27.1%,48.6%,55.7%和67.1%,均高于對(duì)照組(0%,0%,20.0%,25.0%,40.0%,40.0%和40.0%)。免疫組化研究證實(shí)BRCA1和GSTP1高甲基化與基因表達(dá)下降低有關(guān)。診斷試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)BRCA1和GSTP1聯(lián)合使用診斷乳腺癌的AUC為0.721(95%CI:0.616-0.827),診斷界值確定為1,即任一基因發(fā)生甲基化時(shí),靈敏度和特異度分別為44.3%和100.0%。7個(gè)基因聯(lián)合分析AUC為0.741(95%CI:0.631-0.850),診斷界值為3,即有3個(gè)基因發(fā)生甲基化時(shí),靈敏度和特異度分別為58.6%和80.0%。(2)Meta分析共納入11篇文獻(xiàn),3374名患者。BRCA1基因高甲基化與乳腺癌患者總生存期(Overall survival,OS)縮短有關(guān),合并HR(95%CI)為2.11(1.42-3.13);應(yīng)用Cox回歸模型調(diào)整混雜因素后合并HR(95%CI)為1.83(1.08-3.09)。當(dāng)采用無病生存期(Disease free survival,DFS)作為結(jié)局指標(biāo)時(shí),單因素和多因素分析得到合并HR(95%CI)分別為2.30(1.35-3.93)和3.72(1.65-8.38)。按樣本類型分層分析OS與BRCA1甲基化關(guān)系,使用福爾馬林固定石蠟包埋(Formalin-fixed paraffin-embedded,FFPE)組織檢測甲基化時(shí)合并HR(95%CI)為1.75(1.25-2.46),采用新鮮冷凍組織檢測甲基化時(shí)合并HR(95%CI)為1.38(0.16-11.84),采用血漿樣本檢測甲基化時(shí)合并HR(95%CI)為5.97(2.35-15.13)。按樣本類型分層分析DFS與BRCA1關(guān)系,采用FFPE樣本的合并HR(95%CI)為1.85(0.99-3.49),采用新鮮冷凍組織的合并HR(95%CI)為2.78(1.47-5.28)。BRCA1基因高甲基化能縮短三陰乳腺癌(Triple-negative breast cancer,TNBC)患者的DFS(合并HR:0.38,95%CI:0.24-0.62),在非TNBC患者中,合并HR(95%CI)為1.58(1.20-2.07)。結(jié)論:乳腺癌組織中BRCA1,GSTP1,P16INK4A,MGMT,PTEN,RARβ2和CCND2基因發(fā)生不同程度的甲基化改變,且這種異常甲基化與多種臨床病理特征相關(guān)。BRCA1和GSTP1基因高甲基化在乳腺癌中更為常見,具有潛在的乳腺癌診斷價(jià)值。Meta分析進(jìn)一步說明BRCA1基因甲基化與乳腺癌患者不良預(yù)后存在關(guān)聯(lián)。本研究次結(jié)果提示以特定基因DNA異常甲基化作為生物標(biāo)志物在乳腺癌診斷和預(yù)后方面具有重要價(jià)值。
【關(guān)鍵詞】：乳腺癌 表觀遺傳學(xué) 甲基化 MSP 免疫組化 BRCA1 Meta分析
【學(xué)位授予單位】：南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R737.9
【目錄】：

• 中文摘要5-8
• 英文摘要8-11
• 前言11-15
• 第一部分 女性乳腺癌相關(guān)基因啟動(dòng)子區(qū)異常甲基化及蛋白表達(dá)15-39
• 一、研究對(duì)象與方法15-24
• 二、結(jié)果24-36
• 三、討論36-38
• 四、結(jié)論38-39
• 第二部分 BRCA1基因甲基化與乳腺癌預(yù)后的meta分析39-52
• 一、方法39-41
• 二、結(jié)果41-49
• 三、討論49-51
• 四、結(jié)論51-52
• 參考文獻(xiàn)52-59
• 文獻(xiàn)綜述59-71
• 參考文獻(xiàn)66-71
• 附錄71-73
• 附錄一、常用名詞縮略語71-72
• 附錄二、碩士研究生期間發(fā)表文章72-73
• 致謝73

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 趙玉鳳;李鋒;曹玉文;蔣金芳;;乳腺癌相關(guān)基因啟動(dòng)子甲基化的研究進(jìn)展[J];臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志;2010年03期

2 郭山春;乳腺癌相關(guān)基因異常的研究進(jìn)展[J];中國癌癥雜志;1998年03期

3 李曉旭;高艷麗;李孟圈;許瀚;;三陰性乳腺癌相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J];河南醫(yī)學(xué)研究;2014年01期

4 田興松,張強(qiáng);乳腺癌相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J];中國現(xiàn)代普通外科進(jìn)展;2002年03期

5 王燕;鐘世軍;邵敏;張青峰;;抑制消減雜交篩選乳腺癌相關(guān)基因[J];中國民族民間醫(yī)藥;2009年10期

6 河福金,高志安;乳腺癌相關(guān)基因的研究進(jìn)展[J];解剖科學(xué)進(jìn)展;2002年04期

7 陳建武,王佩飛;乳腺癌相關(guān)基因蛋白的表達(dá)及意義[J];現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué);2003年11期

8 陳亞民;宋蔚青;;乳腺癌相關(guān)基因表達(dá)及其臨床意義[J];中國現(xiàn)代醫(yī)藥雜志;2011年04期

9 吳揚(yáng),楊莉,魏于全;乳腺癌相關(guān)基因的分子遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J];中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志;2002年02期

10 鄧君;黃文方;饒紹琴;楊靜;;乳腺癌相關(guān)基因聯(lián)合檢測的臨床研究[J];國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志;2006年11期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 董青;單保恩;;Syk—乳腺癌相關(guān)基因研究領(lǐng)域中的新寵[A];中國免疫學(xué)會(huì)第四屆學(xué)術(shù)大會(huì)會(huì)議議程及論文摘要集[C];2002年

2 鄧君;黃文芳;饒紹琴;;乳腺癌相關(guān)基因mRNA聯(lián)合檢測在乳腺癌診斷中的應(yīng)用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第九次全國檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨中國醫(yī)院協(xié)會(huì)臨床檢驗(yàn)管理專業(yè)委員會(huì)第六屆全國臨床檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室管理學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2011年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉霞;英新發(fā)現(xiàn)5個(gè)乳腺癌相關(guān)基因[N];科技日?qǐng)?bào);2010年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 周翊峰;乳腺癌相關(guān)基因單核苷酸多態(tài)研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2005年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 李明宵;基于多特征融合的乳腺癌相關(guān)基因預(yù)測方法研究[D];華東師范大學(xué);2010年

2 彭海寧;利用抑制消減雜交技術(shù)篩選乳腺癌相關(guān)基因[D];湖南師范大學(xué);2007年

3 吳亮;女性乳腺癌相關(guān)基因異常甲基化研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2015年

，

本文編號(hào)：1125051