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VGLL4和NOTCH4基因單核苷酸多態(tài)性與肺癌易感性的研究

發(fā)布時(shí)間:2017-10-29 23:00

  本文關(guān)鍵詞:VGLL4和NOTCH4基因單核苷酸多態(tài)性與肺癌易感性的研究


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【摘要】:中科院上海生命科學(xué)研究院近期在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Cell Research刊發(fā)了一項(xiàng)最新研究成果[7],他們發(fā)現(xiàn)了導(dǎo)致肺癌發(fā)生的新抑癌基因VGLL4基因。研究表明,VGLL4異常表達(dá)與肺癌、肝癌等多種癌癥的發(fā)生發(fā)展相關(guān),VGLL4基因表達(dá)下調(diào)是導(dǎo)致腫瘤發(fā)生的可能原因,但是對(duì)于其下調(diào)的機(jī)理還未見(jiàn)有報(bào)道,而外顯子的突變可以直接導(dǎo)致蛋白的變化或蛋白結(jié)構(gòu)的改變,從而導(dǎo)致蛋白的功能改變。據(jù)此我們選取了該基因編碼區(qū)的同義突變位點(diǎn)rs1803489(A/G,Gln/Gln)和錯(cuò)義突變位點(diǎn)rs2276749(C/T,Met/Ile)兩個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分析研究:同時(shí),在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中,Notch信號(hào)扮演著重要的角色,單一的Notch信號(hào)的紊亂可能直接引發(fā)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,而通路的異?捎捎诨蛲蛔儗(dǎo)致的蛋白表達(dá)變化而引起。因此,我們選取了位于NOTCH4基因外顯子區(qū)的同義突變位點(diǎn)rs3134942(A/C,Val/Val)作為研究對(duì)象。為了研究?jī)蓚(gè)基因的三個(gè)位點(diǎn)與肺癌易感性的關(guān)系,我們選取了375例肺癌患者外周血作為研究對(duì)象,和380例健康人群外周血作為正常對(duì)照組。首先我們根據(jù)不同的位點(diǎn)設(shè)計(jì)不同的引物,然后通過(guò)PCR擴(kuò)增和非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳,選取電泳條帶清晰、單一無(wú)雜帶的退火溫度進(jìn)行高分辨率熔解曲線(High Resolution Melting,HRM)上機(jī)實(shí)驗(yàn)。然后利用Roche480 Lightcycler Software對(duì)高分辨率熔解曲線進(jìn)行分析,根據(jù)曲線形成的形狀和顏色對(duì)樣本進(jìn)行分型,最后通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析這三個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與肺癌易感性的關(guān)聯(lián)性。研究結(jié)果表明:(1)研究對(duì)象基本資料比較結(jié)果顯示,在375例肺癌病例和380例對(duì)照樣本中:肺癌病例與正常對(duì)照在年齡、吸煙與飲酒狀況存在差異(p值均0.05),而性別沒(méi)有顯著差異(p=0.825),說(shuō)明肺癌的發(fā)生是多因素誘導(dǎo)的結(jié)果。VGLL4基因的兩個(gè)多態(tài)位點(diǎn)基因型分布顯示:在超顯性遺傳模型下,同義突變r(jià)s1803489多態(tài)性位點(diǎn)與肺癌易感性具有顯著顯著相關(guān)性,其中GA基因型會(huì)提高其個(gè)體的肺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(Adjusted OR=1.42,95%CI:1.00-2.00,p=0.048),是GG基因型攜帶者肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的1.42倍;谏鲜鲞z傳模型,我們對(duì)其進(jìn)行了分層分析,結(jié)果顯示:小于60歲的人群中該位點(diǎn)GA基因型與肺癌有著顯著的相關(guān)性(Adjusted OR=1.96,95%CI:1.23-3.14,p=0.005)。我們的研究結(jié)果提示錯(cuò)義突變位點(diǎn)rs2276749與肺癌易感性無(wú)顯著相關(guān)性。(2)NOTCH4基因外顯子上的rs3134942多態(tài)位點(diǎn)與肺癌易感性無(wú)顯著相關(guān)性,但是在針對(duì)該位點(diǎn)的分層分析中發(fā)現(xiàn),非飲酒人群中CA基因型在共顯性模型中與肺癌易感性有著顯著的相關(guān)性,并能夠降低肺癌易感的風(fēng)險(xiǎn)(p=0.046),但是在校正后顯著性消失。
【關(guān)鍵詞】:VGLL4 NOTCH4 多態(tài)性 腫瘤易感性
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R734.2
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-9
  • 一、引言9-16
  • 二、材料與方法16-23
  • 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果23-30
  • 四、討論30-33
  • 參考文獻(xiàn)33-37
  • 附錄37-38
  • 攻讀學(xué)位期間取得的研究成果38-39
  • 致謝39-40

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9 江s,

本文編號(hào):1115008


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