本文關(guān)鍵詞：淋巴瘤中EB病毒潛伏膜蛋白1基因多態(tài)性研究

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【摘要】：背景和目的EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)潛伏膜蛋白1(latent membrane protein,LMP1)基因是公認的EBV致癌基因,在EBV相關(guān)腫瘤的發(fā)病中具有重要作用。LMP1基因存在多種變異,其變異與腫瘤發(fā)生的關(guān)系一直是其致癌機制研究的熱點,但目前并未取得一致結(jié)論。以往對中國LMP1基因多態(tài)性的研究,多以鼻咽癌為研究對象,有關(guān)淋巴瘤的研究相對較少,且多數(shù)研究只針對LMP1單一基因變異進行檢測。本研究檢測青島地區(qū)EBV陽性淋巴瘤和正常人群中LMP1全序列,旨在了解該地區(qū)淋巴瘤中LMP1基因變異特征,探討LMP變異與淋巴瘤發(fā)生的相關(guān)性,為進一步明確LMP1基因變異與腫瘤發(fā)生的相關(guān)性提供實驗依據(jù)。方法用PCR和DNA測序檢測80例EBV陽性淋巴瘤組織(結(jié)外鼻型NK/T細胞淋巴瘤47例、霍奇金淋巴瘤26例、彌漫大B細胞淋巴瘤2例、T細胞淋巴瘤5例)和70例EBV陽性健康人群咽漱液標(biāo)本中LMP1基因序列,應(yīng)用DNAStar軟件對LMP1基因核苷酸及氨基酸序列進行對比分析,應(yīng)用MEGA軟件繪制系統(tǒng)進化樹,同時與EBV標(biāo)準(zhǔn)株B95-8序列比較,根據(jù)其特征性改變對變異進行分類。比較淋巴瘤和健康人群之間以及不同淋巴瘤之間LMP1基因變異型的分布情況。結(jié)果①與標(biāo)準(zhǔn)株B95-8相比,所有150例標(biāo)本中LMP1基因均出現(xiàn)序列變異,包括單核苷酸突變、插入、缺失和重復(fù)序列變化。根據(jù)系統(tǒng)樹及LMP1編碼區(qū)基因特征性突變,共發(fā)現(xiàn)3種主要亞型(China 1、China 2和Med-)及少數(shù)不同亞型的重組病毒株,3種亞型在非編碼區(qū)和重復(fù)序列區(qū)也呈現(xiàn)特征性改變。N端Xho I位點缺失變異即Xho I(-)和C端30 bp缺失即del-LMP1變異與LMP1亞型及重組病毒株呈不同的對應(yīng)關(guān)系。②China 1、China 2和Med-亞型在淋巴瘤中的檢出率分別為85.0%(68/80)、6.3%(5/80)和7.5%(6/80),在健康人群中的檢出率分別為65.7%(46/70)、5.7%(4/70)和21.4%(15/70),另有1例(2.1%)淋巴瘤和5例(7.2%)健康人群毒株為不同亞型的重組病毒株。LMP1亞型在2種人群中的分布有顯著性差異(P=0.014)。Xho I(-)和del-LMP1在淋巴瘤中的檢出率(92.5%和85.0%)高于健康人群(74.3%和67.1%),差異均有顯著性(P=0.002,0.010)。③LMP1各種變異類型在47例結(jié)外鼻型NK/T細胞淋巴瘤和26例霍奇金淋巴瘤之間的分布無顯著性差異。結(jié)論①LMP1變異復(fù)雜,分析LMP1基因多態(tài)性時,對LMP1全序列進行分析,才能全面準(zhǔn)確反映LMP1變異情況。②青島地區(qū)淋巴瘤和健康人群EBV毒株LMP1以China 1亞型、Xho I(-)和del-LMP1為主,3種變異型在淋巴瘤中的檢出率高于健康人群,提示帶有3種變異型的EBV毒株可能與淋巴瘤的發(fā)生相關(guān),但對不同細胞來源淋巴瘤可能無選擇傾向性。
【關(guān)鍵詞】：EB病毒 淋巴瘤 潛伏膜蛋白1 基因多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R733.1
【目錄】：

• 摘要2-4
• Abstract4-7
• 引言7-9
• 第1章 材料和方法9-15
• 1.1 儀器、試劑和耗材9-10
• 1.2 研究對象10
• 1.3 DNA提取10-12
• 1.4 LMP1基因序列多態(tài)性檢測12-14
• 1.5 統(tǒng)計學(xué)分析14-15
• 第2章 結(jié)果15-32
• 2.1 LMP1序列變異類型15-18
• 2.2 系統(tǒng)進化樹分析18-28
• 2.3 LMP1亞型在淋巴瘤與正常人群中的分布28
• 2.4 Xho I (-)變異及del-LMP1變異28-29
• 2.5 LMP1各種變異型在不同淋巴瘤中的分布29-30
• 2.6 LMP1 C末端重復(fù)序列變異30-32
• 第3章 討論32-36
• 研究結(jié)論36-37
• 參考文獻37-43
• 綜述43-58
• 綜述參考文獻51-58
• 攻讀學(xué)位期間的研究成果58-59
• 致謝59-60

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本文編號：1080112