ENST00000501520鑒定及在惡性轉(zhuǎn)化BEAS-2B細(xì)胞中的作用
發(fā)布時(shí)間:2021-06-18 07:08
目的利用煤焦瀝青煙提取物(Coal tar pitch extracts,CTPE)構(gòu)建的體外永生化人支氣管上皮細(xì)胞(Immortalized human bronchial epithelial,BEAS-2B)惡性轉(zhuǎn)化模型,研究ENST00000501520在細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化中對(duì)細(xì)胞功能的影響,以及可能的靶向基因,為從LncRNAs水平探討惡性轉(zhuǎn)化發(fā)生發(fā)展機(jī)制提供理論支持。方法1.UCSC數(shù)據(jù)庫(kù)檢索ENST00000501520轉(zhuǎn)錄基因基因信息和臨近基因情況。編碼潛能預(yù)測(cè)器(Coding potential calculator,CPC)、編碼潛能預(yù)測(cè)軟件(Coding PotentialAssessmentTool,CPAT)預(yù)測(cè) ENST00000501520 蛋白質(zhì)翻譯能力。細(xì)胞核質(zhì)分離技術(shù)分離細(xì)胞核質(zhì)RNA,qRT-PCR檢測(cè)細(xì)胞核、質(zhì)中ENST00000501520相對(duì)表達(dá)含量,計(jì)算核質(zhì)百分比,明確其亞細(xì)胞定位。qRT-PCR 檢測(cè) CTPE15、20、25、30、35 代細(xì)胞中 ENST00000501520 相對(duì)含量隨細(xì)胞代數(shù)變化的變化情況。2.小干擾 RNA(Small...
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ENST00000501520的轉(zhuǎn)錄基因定位及其臨近基因情況
3.2.2各組CTPE染毒細(xì)月包中ENST00000501520表達(dá)情況??分別提。茫裕校牛保、20、25、30、35代細(xì)胞總RNA,并通過(guò)qRT-PCR檢??測(cè)各代數(shù)細(xì)胞中ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量。結(jié)果如表3.3和圖3.3所??示,在CTPE30代及以前,ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量隨著細(xì)胞代數(shù)的增??加逐漸增加。CTPE30代與CTPE15、20、25代比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義??(均P<0.05)。CTPE30和CTPE35代比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.804)。??表3.?3各組細(xì)胞ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量情況(n=8,?f±s)??組別?ENST00000501520相對(duì)表達(dá)量?F?P??CTPE15?0.278±〇.〇77??CTPE20?0.875±0.314??CTPE25?1.151±0.363?19?647?<0001??CTPE30?1.861±0.385*??CTPE35?1.916±0.765???注:*表示與30代前細(xì)胞組相比,CTPE30組差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.05???18??
分別配置50nM、100nM、150nM轉(zhuǎn)染濃度的siRNA干擾溶液對(duì)CTPE30??代細(xì)胞干預(yù)培養(yǎng)48h,然后提取總RNA進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)ENST00000501520??的相對(duì)表達(dá)量,并計(jì)算干擾效率。結(jié)果如表3.4和圖3.4所示,與CTPE30組比??較,不同干擾濃度組ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量明顯下降(均P<0.05),??其中50nM干擾組減少52.284%,lOOnM干擾組減少69.371%,150nM干擾組??減少25.734%。選用丨OOnM為最佳干擾濃度,同時(shí)設(shè)立Mock組、NC組和無(wú)??任何處理的CTPE30組。結(jié)果如表3.5和圖3.5所示,Mock組和NC組比較差??異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.478),且均與CTPE30組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別??/MX718,尸=0.723)。100nM?組相比?Mock、NC?和?CTPE30?組,??ENST00000501520相對(duì)表達(dá)量明顯下降(均P<0.001?),轉(zhuǎn)染試劑和siRNA陰??性對(duì)照均不影響ENST00000501520的表達(dá)水平
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LncRNA的篩選及其保守性[J]. 姜貴先,羅溪,劉文文,張晶,肖良. 醫(yī)學(xué)綜述. 2017(20)
[2]BET家族基因表達(dá)與惡性腫瘤患者總生存期及臨床病理特征的關(guān)系[J]. 王婧文,唐菲,鄧?yán)?納飛飛,薛建新,盧鈾. 中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2016(02)
[3]JAK2/STAT3/SOCS3信號(hào)通路與腫瘤轉(zhuǎn)移[J]. 蔣樹龍,花寶金. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2014(06)
[4]SOCS3結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 牛麗娜,陳顯久. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2014(11)
[5]人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的篩選[J]. 王平章,王欣,王峰,吳俊. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2006(04)
[6]癌基因、妊娠性滋養(yǎng)細(xì)胞增生與葡萄胎惡變關(guān)系的研究[J]. 楊興升,張振國(guó),張友忠,李家福,譚燕泉. 現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展. 1997(03)
[7]絨毛膜癌及葡萄胎——滋養(yǎng)葉母細(xì)胞來(lái)源的一類特殊腫瘤[J]. 蚌埠醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教研組. 蚌埠醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 1976(01)
碩士論文
[1]惡性轉(zhuǎn)化BEAS-2B細(xì)胞lncRNAs與miRNAs的差異表達(dá)[D]. 孟麗雅.鄭州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3236212
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
ENST00000501520的轉(zhuǎn)錄基因定位及其臨近基因情況
3.2.2各組CTPE染毒細(xì)月包中ENST00000501520表達(dá)情況??分別提。茫裕校牛保、20、25、30、35代細(xì)胞總RNA,并通過(guò)qRT-PCR檢??測(cè)各代數(shù)細(xì)胞中ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量。結(jié)果如表3.3和圖3.3所??示,在CTPE30代及以前,ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量隨著細(xì)胞代數(shù)的增??加逐漸增加。CTPE30代與CTPE15、20、25代比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義??(均P<0.05)。CTPE30和CTPE35代比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.804)。??表3.?3各組細(xì)胞ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量情況(n=8,?f±s)??組別?ENST00000501520相對(duì)表達(dá)量?F?P??CTPE15?0.278±〇.〇77??CTPE20?0.875±0.314??CTPE25?1.151±0.363?19?647?<0001??CTPE30?1.861±0.385*??CTPE35?1.916±0.765???注:*表示與30代前細(xì)胞組相比,CTPE30組差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.05???18??
分別配置50nM、100nM、150nM轉(zhuǎn)染濃度的siRNA干擾溶液對(duì)CTPE30??代細(xì)胞干預(yù)培養(yǎng)48h,然后提取總RNA進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)ENST00000501520??的相對(duì)表達(dá)量,并計(jì)算干擾效率。結(jié)果如表3.4和圖3.4所示,與CTPE30組比??較,不同干擾濃度組ENST00000501520的相對(duì)表達(dá)量明顯下降(均P<0.05),??其中50nM干擾組減少52.284%,lOOnM干擾組減少69.371%,150nM干擾組??減少25.734%。選用丨OOnM為最佳干擾濃度,同時(shí)設(shè)立Mock組、NC組和無(wú)??任何處理的CTPE30組。結(jié)果如表3.5和圖3.5所示,Mock組和NC組比較差??異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.478),且均與CTPE30組比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(分別??/MX718,尸=0.723)。100nM?組相比?Mock、NC?和?CTPE30?組,??ENST00000501520相對(duì)表達(dá)量明顯下降(均P<0.001?),轉(zhuǎn)染試劑和siRNA陰??性對(duì)照均不影響ENST00000501520的表達(dá)水平
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[3]JAK2/STAT3/SOCS3信號(hào)通路與腫瘤轉(zhuǎn)移[J]. 蔣樹龍,花寶金. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2014(06)
[4]SOCS3結(jié)構(gòu)和作用機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 牛麗娜,陳顯久. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2014(11)
[5]人SBK1 cDNA的克隆及其相互作用蛋白的篩選[J]. 王平章,王欣,王峰,吳俊. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2006(04)
[6]癌基因、妊娠性滋養(yǎng)細(xì)胞增生與葡萄胎惡變關(guān)系的研究[J]. 楊興升,張振國(guó),張友忠,李家福,譚燕泉. 現(xiàn)代婦產(chǎn)科進(jìn)展. 1997(03)
[7]絨毛膜癌及葡萄胎——滋養(yǎng)葉母細(xì)胞來(lái)源的一類特殊腫瘤[J]. 蚌埠醫(yī)學(xué)院病理學(xué)教研組. 蚌埠醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 1976(01)
碩士論文
[1]惡性轉(zhuǎn)化BEAS-2B細(xì)胞lncRNAs與miRNAs的差異表達(dá)[D]. 孟麗雅.鄭州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3236212
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