【摘要】：目的:流行病學(xué)與分子生物學(xué)方法相結(jié)合,了解掌握欽州市HIV-1的流行狀況及其亞型分布特征,為今后欽州乃至廣西地區(qū)的HIV-1的防控工作提供資料和依據(jù)。方法:以調(diào)查問卷的形式收集50例欽州市HIV-1感染者的人口學(xué)及流行病學(xué)資料,每例感染者采集抗凝全血5-10毫升,提取血漿病毒RNA,用逆轉(zhuǎn)錄%q巢式PCR法擴增gag區(qū)核酸片段,對PCR擴增產(chǎn)物進行鑒定,將陽性擴增產(chǎn)物送北京軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所進行基因測序,用BioEdit、MEGA5.03軟件、Distance程序及在線分析工具Genotyping對所測得序列進行裁剪、校正、比對、構(gòu)建系統(tǒng)進化樹和亞型分析。結(jié)果:1.本實驗共收集血液樣本50例,其人口學(xué)及流行病學(xué)特征如下:(1)50例感染者的居住地包含欽州市欽南區(qū),欽北區(qū)及下轄的浦北縣、靈山縣。(2)感染者的男女比例為1.38:1,小于40歲的感染者31例,漢族及壯族感染者48例。(3)異性傳播和靜脈吸毒兩種傳播途徑所占的比例為96%。2.50例血液樣本經(jīng)血漿病毒RNA提取,逆轉(zhuǎn)錄%q巢式PCR擴增,基因測序最終獲得36條基因序列,擴增率為72%。3.經(jīng)美國NCBI進行在線初步分型,及MEGA5.03軟件構(gòu)建系統(tǒng)樹進一步驗證,最終確定36條序列包含01_ae、07_bc、08_bc3種重組毒株,其中01_ae亞型32例(88.90%),07_bc亞型2例(5.55%),08_bc亞型2例(5.55%),各亞型間的基因離散率分別為8.62%,6.47%,5.73%。4.系統(tǒng)進化分析:32例01_ae亞型重組毒株與來自泰國的參考株01_ae.th.91.tn240.l11761聚在一起,兩者的基因離散率最小,為(9.12±1.76)%,2例07_bc亞型重組毒株與來自中國的參考株07_bc.cn.97.97.cn001_c54.af286226聚在一起,兩者的基因離散率最小,為(7.31±2.43)%,2例08_bc亞型重組毒株與中國廣西的bc重組代表株08_bc.cn.97.97.cngx_9f.ay008717聚在一起,兩者的基因離散率最小,為(6.64±2.58)%。5.不同亞型的傳播途徑分布:在32例01_ae亞型感染者中,有30例有不安全性行為史,2例有靜脈吸毒史,在各2例07_bc和08_bc亞型感染者中,均有不安全性行為史。結(jié)論:1.hiv-1已在欽州市各個區(qū)縣全面流行,男女構(gòu)成比趨于平衡,感染者以漢族及壯族為主,小于40歲的青壯年居多,以性傳播和靜脈吸毒為主要傳播途徑。2.欽州市hiv-1感染者中存在01_ae、07_bc、08_bc三種流行毒株,以01_ae亞型為主,且01_ae亞型已從高危人群向普通人群擴散,并成為欽州乃至廣西地區(qū)的主流亞型。3.由基因離散率推測各亞型在欽州市的流行時間約為01_ae亞型9-15年、07_bc亞型8-12年,08_bc亞型6-10年。4.從分子生物學(xué)角度揭示了欽州市HIV-1的流行毒株的多樣性,欽州市的HIV-1防控工作已不容小覷。
【學(xué)位授予單位】：桂林醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R512.91;R181.3

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本文編號：2756205