【摘要】：目的對(duì)廣西東蘭縣老年人群的體檢結(jié)果進(jìn)行分析,初步了解該人群的健康狀況,為促進(jìn)老年人健康長(zhǎng)壽提供建議;為研究該縣老年人長(zhǎng)壽遺傳因素提供背景資料;運(yùn)用人類全基因組關(guān)聯(lián)分析方法,對(duì)該縣人群進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,初步篩選該地區(qū)長(zhǎng)壽相關(guān)基因。方法1、通過(guò)對(duì)廣西東蘭縣老年人進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)流行病學(xué)調(diào)查,問(wèn)卷調(diào)查收集研究對(duì)象的一般資料以及對(duì)老人進(jìn)行健康體檢獲得體檢資料,并分析其健康狀況。2、應(yīng)用Illumina Infinium?Global Screening Array基因芯片對(duì)1040名研究對(duì)象進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)芯片實(shí)驗(yàn),以年齡和各種體檢結(jié)果為表型,進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,并選擇其中以年齡為表型的結(jié)果進(jìn)行研究,結(jié)合生物信息學(xué)方法包括GO功能注釋和KEGG通路分析從中篩選出候選長(zhǎng)壽SNP及所在基因擬后續(xù)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果1、最終納入本次研究分析的有效樣本量為4474人,年齡范圍60~104歲。按照5歲一個(gè)年齡組,分為60~、65~、70~、75~、80~歲五個(gè)年齡組,每個(gè)年齡組分別為1199(26.8%)人,1213(27.1%)人,981(21.9%)人,664(14.8%)人,417(9.3%)人。其中男性為1790(40%)人,女性為2684(60%)人;漢族為456(10.2%)人,壯族為3816(85.3%)人,瑤族等其他少數(shù)民族為202(4.5%)人;未接受教育為2071(46.3%)人,小學(xué)文化為1505(33.6%)人,初中文化為735(16.4%)人,高中及以上文化為163(3.6%)人;未婚為661(14.8%)人,已婚或同居為3031(67.7%)人,離異分居或喪偶為782(17.5%)人;農(nóng)民為4301(91.7%)人,其他職業(yè)為371(8.3%)人。2、SBP、DBP平均水平分別為(140.44±22.83)mmHg、(80.83±13.24)m mHg;LDL-C、TG、HDL-C、TC平均水平分別為(3.28±0.92)mmol/L、(1.35±1.06)mmol/L、(1.58±0.37)mmol/L、(5.42±1.09)mmol/L;LDL-C/HDL-C、TC/HDL-C、AI平均水平分別為(2.16±0.69)、(3.55±0.81)、(2.55±0.81),不同年齡組研究對(duì)象血脂比值比較沒有差異(P0.05);FBG平均水平為(4.98±1.63)mmol/L,其在不同的年齡組之間沒有差異(P0.05)。3、血壓異常的總檢出率為52.1%,不同年齡組研究對(duì)象血壓異常檢出率有差異,有隨著年齡上升有升高的趨勢(shì)(P0.05),男性檢出率為56.4%,女性檢出率為49.3%。血脂異常檢出率為60.5%,有隨著年齡增長(zhǎng)而有下降的趨勢(shì)(P0.05),男性檢出率為54.9%,女性檢出率為64.1%。血糖異常總檢出率為6.2%,男性血糖異常檢出率為8.3%,女性血糖異常檢出率為4.8%,檢出率在不同年齡組之間比較均沒有差異(P0.05)。TC、TG、HDL-C、LD L-C異常檢出率分別為55.5%,18.5%,2.2%,43.3%。其中TC、TG異常檢出率在高年齡組低于低年齡組,LDL-C異常檢出率在不同年齡組之間比較沒有差異(P0.05)。4、差異基因主要參與生物學(xué)過(guò)程:鈣介導(dǎo)的信號(hào)傳導(dǎo)、離子平衡的調(diào)節(jié)、第二信使介導(dǎo)的信號(hào)、鈣調(diào)磷酸酶-NFAT信號(hào)級(jí)聯(lián)、跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性的調(diào)節(jié)、溶酶體微自噬等;差異性基因主要的細(xì)胞組分:DNA連接酶IV復(fù)合物,線粒體內(nèi)膜肽酶復(fù)合物,鳥苷酸環(huán)化酶復(fù)合物,跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白復(fù)合物,糖蛋白復(fù)合物等;差異性基因主要的分子功能:腺苷酸環(huán)化酶活性,異亮氨酸-tRNA連接酶活性,神經(jīng)連接蛋白結(jié)合蛋白等。5、差異性基因主要參與心肌細(xì)胞中的腎上腺素能信號(hào)傳導(dǎo),催產(chǎn)素信號(hào)通路,胃酸分泌,擴(kuò)張型心肌病(DCM),胰腺分泌,黑色素,非同源末端連接,膽堿能突觸,破骨細(xì)胞分化等通路。6、經(jīng)過(guò)生物信息學(xué)分析,NHEJ1、ATG7、CPNE4、IMMP2L、ADCY、KCNQ1、AKAP6等20個(gè)基因及其位點(diǎn)可能和長(zhǎng)壽相關(guān),可作為長(zhǎng)壽候選基因,擬在另外一個(gè)長(zhǎng)壽人群進(jìn)行驗(yàn)證;胰腺分泌通路、非同源末端連接通路可能和長(zhǎng)壽相關(guān)。結(jié)論1、與國(guó)內(nèi)其他地方的研究報(bào)道相比,廣西東蘭縣老年人血脂水平、空腹血糖水平的總體水平相對(duì)較低;TC、TG異常檢出率在高年齡組低于低年齡組。2、NHEJ1、ATG7、CPNE4、IMMP2L、ADCY、KCNQ1、AKAP6等20個(gè)基因可能和長(zhǎng)壽相關(guān);胰腺分泌通路、非同源末端連接通路可能和長(zhǎng)壽相關(guān)。
【圖文】：

圖 1 Illumina SNP 芯片實(shí)驗(yàn)流程圖Figure 1 Flow chart of Illumina SNP chip填充前的質(zhì)控利用 GenomeStudio 2.0 軟件對(duì)下機(jī)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，導(dǎo)出 plink 格式分型數(shù)據(jù)；去除染色體為 0，X，XY，Y 和 MT 的位點(diǎn)，剩余 679025 個(gè)位點(diǎn)；采用 plink 1.90 軟件對(duì)分型結(jié)果進(jìn)行質(zhì)控，質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)：MAF（Minor AlleleFrequency ） >0.01 ，， SNP call rate>0.95 ， sample call rate>0.95 ， HWE（Hardy-Weinberg equilibrium）>0.000001，質(zhì)控后剩余 373497 個(gè)位點(diǎn)，1040個(gè)樣本（396 名男性，644 名女性）。利用 plink 1.90 軟件采用質(zhì)控后的位點(diǎn)對(duì)剩余樣本計(jì)算兩兩之間的親緣關(guān)系，去除 112 個(gè)重復(fù)或者存在親緣關(guān)系的樣本（74 名男性，38 名女性），最終剩余 928 例樣本。

全基因組關(guān)聯(lián)分析曼哈頓圖
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R161.7

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3 劉笛;徐加英;焦e

本文編號(hào)：2685314