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豬肉中常見致病菌的多重直接PCR法的建立與應用

發(fā)布時間:2019-07-01 19:26
【摘要】:目的建立檢測大腸桿菌、沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、李斯特菌和小腸耶爾森氏菌5種致病菌的多重直接PCR方法。方法根據(jù)大腸桿菌phoA、沙門氏菌invA、金黃色葡萄球菌nuc、李斯特菌hly、小腸耶爾森氏菌ail的基因序列,設計多重直接PCR引物,建立并優(yōu)化多重直接PCR反應條件,檢測引物的擴增特異性和靈敏性,并將所建立的方法應用于實際采集豬肉樣本的檢測,與金標培養(yǎng)法相比較,計算多重直接PCR檢測法的敏感性、準確性以及陽性預測值。結果所設計的多重直接PCR引物對5種菌都有特異擴增,最低檢出限量大腸桿菌為10CFU,金黃色葡萄球菌敏感性為100CFU,沙門氏菌、李斯特菌、小腸耶爾森氏菌敏感性可達1CFU。60份豬肉樣本中檢出大腸桿菌15份、沙門氏菌6份、金黃色葡萄球菌21份、李斯特菌20份、小腸耶爾森氏菌35份,陽性檢出率均高于金標培養(yǎng)法,總體檢測敏感性為100%,準確性為94%,陽性預測值為81.44%。結論多重直接PCR法實現(xiàn)了同時對各食源性致病菌敏感特異的檢測,并且省去了提取模板的步驟,將檢測時間縮短至3h左右,便于食品安全風險監(jiān)測中常見食源性致病菌的通量檢測。
[Abstract]:Objective to establish a multiplex direct PCR method for the detection of E. coli, Salmonella, Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes and Yelseng small intestine. Methods according to the gene sequence of E. coli phoA, Salmonella aureus invA, Staphylococcus aureus nuc, hly, ail, multiple direct PCR primers were designed, the multiplex direct PCR reaction conditions were established and optimized, and the amplification specificity and sensitivity of the primers were detected. The established method was applied to the detection of pork samples and compared with the gold standard culture method. The sensitivity, accuracy and positive predictive value of multiple direct PCR detection were calculated. Results the designed multiplex direct PCR primers were specifically amplified to all five kinds of bacteria. The minimum detection limit of Escherichia coli was 10 CFU, Staphylococcus aureus sensitivity was 100 CFU, salmonella, Listeria monocytogenes, Yelseng small intestine were as sensitive as 15 E. coli, 6 Salmonella, 21 Staphylococcus aureus, 20 Listeria monocytogenes and 35 Yelseng small intestine samples, among which 15 were Escherichia coli, 6 were Salmonella, 21 were Staphylococcus aureus, 20 were Listeria, 35 were Yelseng, and 15 were E. coli, 6 were Salmonella, 21 were Staphylococcus aureus, 21 were Staphylococcus aureus, 20 were Staphylococcus aureus, and 35 were Yelsonia. The positive detection rate was higher than that of gold standard culture method. The overall sensitivity, accuracy and positive predictive value were 100%, 94% and 81.44%, respectively. Conclusion multiple direct PCR method realizes the sensitive and specific detection of food-borne pathogenic bacteria at the same time, and saves the step of extracting template, and shortens the detection time to about 3 hours, which is convenient for the flux detection of common food-borne pathogenic bacteria in food safety risk monitoring.
【作者單位】: 中國動物衛(wèi)生與流行病學中心農業(yè)部畜禽產品質量安全風險評估實驗室(青島);吉林農業(yè)大學生命科學學院;
【基金】:農業(yè)部“國家農產品質量安全風險評估重大專項”(No.GJFP2016007)資助 留學人員科技活動項目擇優(yōu)資助~~
【分類號】:R155.5

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本文編號:2508737

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