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上海市黃浦江水體菌群分布研究

發(fā)布時(shí)間:2018-05-12 18:05

  本文選題:黃浦江 + 霍亂弧菌; 參考:《復(fù)旦大學(xué)》2013年碩士論文


【摘要】:黃浦江是長江下游的一個(gè)分支。它從太湖發(fā)源,向東運(yùn)行經(jīng)青浦縣淀山湖,然后流入上海。它是上海的母親河,承擔(dān)著飲水、內(nèi)河航運(yùn)、旅游等多方面功能。然而,由于上海人口密度高,排污總量大,加之對工業(yè)、旅游等污染控制措施乏力,使黃浦江水體一直處于一種較重的負(fù)荷狀況。因此,黃浦江水環(huán)境狀況一直受到社會的廣泛關(guān)注。本研究通過構(gòu)建16S rDNA克隆文庫以及開展對霍亂弧菌、菌落總數(shù)和大腸菌群的傳統(tǒng)培養(yǎng)監(jiān)測,以了解黃浦江菌群分布情況,為有關(guān)部門制定環(huán)境治理政策和疾病防控政策提供依據(jù)。本研究包括以下3個(gè)方面內(nèi)容:1.上海市黃浦江水體霍亂弧菌監(jiān)測分析在2011年7月~10月,從黃浦江63個(gè)霍亂弧菌固定監(jiān)測點(diǎn)每月采集水體標(biāo)本進(jìn)行霍亂弧菌分離培養(yǎng),對分離得到的陽性菌株進(jìn)行血清分型、PCR毒力基因檢測、K-B法藥敏試驗(yàn)及脈沖場凝膠電泳(PFGE)分子分型。研究結(jié)果顯示,監(jiān)測期間采取的252份水樣中,有1份檢出O139群霍亂弧菌,陽性檢出率為0.4%。毒力基因檢測發(fā)現(xiàn)該菌株為非產(chǎn)毒株。對11種藥物的敏感試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)該菌株對氨芐西林耐藥,對其余強(qiáng)力霉素、諾氟沙星、環(huán)丙沙星等10種抗菌藥物敏感。PFGE分型結(jié)果聚類分析顯示該菌株與同年分離自病人的菌株處于不同的分支,兩者相似系數(shù)為76%。研究表明,在霍亂流行季節(jié),黃浦江水體中存在霍亂弧菌,必須加強(qiáng)環(huán)境水體霍亂弧菌監(jiān)測以了解其污染情況,以便采取針對性措施預(yù)防控制霍亂的發(fā)生和流行。2.上海黃浦江水體菌落總數(shù)和大腸菌群檢測分析在2011年7月~10月,從黃浦江63個(gè)固定采樣點(diǎn)每月采集水體標(biāo)本進(jìn)行菌落總數(shù)和大腸菌群指標(biāo)檢測,以了解黃浦江水體微生物污染狀況以及菌落總數(shù)和大腸菌群指標(biāo)的時(shí)空分布規(guī)律。研究結(jié)果顯示,菌落總數(shù)和大腸菌群分布存在時(shí)間差異(P0.0001),菌落總數(shù)分布存在空間差異(P0.0001)。大腸菌群和菌落總數(shù)指標(biāo)間呈正相關(guān)(P0.0001)。研究表明,黃浦江的微生物污染受時(shí)間及人類活動影響較嚴(yán)重,微生物指標(biāo)呈現(xiàn)一定的時(shí)空分布規(guī)律。微生物指標(biāo)間有相關(guān)性。3.上海市黃浦江水體細(xì)菌多樣性研究采用構(gòu)建16S rDNA克隆文庫方法,對黃浦江2011年7月~10月三個(gè)檢測段(吳涇至盧浦大橋段、盧浦大橋至楊浦大橋段和楊浦大橋至復(fù)興島段)水樣的細(xì)菌多樣性進(jìn)行研究。結(jié)果顯示,黃浦江水體12個(gè)16S rDNA克隆文庫共獲得1135個(gè)陽性克隆,分為660個(gè)操作分類單元,分屬以下類群:變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)、疣微菌門(Verrucomicrobia)、厚壁菌門(Firmicutes)酸桿菌門(Acidobacteria)、Armatimonadetes、梭桿菌門(Fusobacteria)、浮霉菌門(Planctomycetes)以及尚不確定分類地位的類群(Unclassified)。其中變形菌門、放線菌門、擬桿菌門是黃浦江水體細(xì)菌的優(yōu)勢類群,β-變形菌綱(p-proteobacteria)為最優(yōu)勢類群。各個(gè)文庫間細(xì)菌類群多樣性都不相同,分布存在時(shí)空差異。Genbank blast結(jié)果和系統(tǒng)發(fā)育分析表明,黃浦江水體中細(xì)菌大多數(shù)為未可培養(yǎng)細(xì)菌,且對本研究所獲序列的最近親緣關(guān)系序列來源環(huán)境分析表明,黃浦江水體環(huán)境細(xì)菌菌落多樣性受到了人類活動的影響。
[Abstract]:According to the results of the study , the results showed that the strain was in different branches and the positive detection rate was 0 . 4 % . The diversity of bacteria in Huangpu River is not the same and the distribution of 尾 - proteome is the dominant group . The results show that the diversity of bacteria in Huangpu River is not the same , and the environmental analysis indicates that the diversity of bacterial colonies in the environment of Huangpu River is affected by human activities .

【學(xué)位授予單位】:復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R123

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:1879604

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