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基于臨床組學(xué)信息融合的EHR決策支持系統(tǒng)研究

發(fā)布時間:2020-03-31 00:35
【摘要】:計算機技術(shù)的發(fā)展使得醫(yī)療模式不再復(fù)雜,慢慢走向分子醫(yī)療和信息化醫(yī)療階段:首先現(xiàn)代醫(yī)療模式利用分子生物技術(shù)、DNA測序技術(shù)對人體進行DNA測序,接下來將得到的結(jié)果與人類標準基因庫進行對比,從而從根本上發(fā)現(xiàn)并解決人類的疾病;蛐秃捅硇偷难芯吭谂R床的疾病診斷過程中可以起到?jīng)Q策支持的作用。本文分析了現(xiàn)階段的衛(wèi)生信息傳輸標準和電子健康記錄的模型,并對常見的染色體變異的檢測方法進行了研究,最終擴展了關(guān)系信息模型的六大抽象類,建立了可以存儲臨床組學(xué)數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫和電子健康記錄,并且提出了一種基于DNA序列的信息提取方法,最終優(yōu)化了系統(tǒng)決策支持的效果。主要的研究內(nèi)容包括:針對當(dāng)前的電子病歷系統(tǒng)沒有融合病人的臨床組學(xué)信息及可擴展性不高的問題,建立了融合臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù)的存儲模型,在存儲的過程中,用到了關(guān)系信息模型模型,該模型中的類是高度抽象類,不能夠直接使用,針對這個問題,對其抽象類進行擴展和細化,在細化的過程中,存在不同的復(fù)雜數(shù)據(jù)類型和類間關(guān)系,依據(jù)不同的情況處理好這些數(shù)據(jù),臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù)具有屬性稀疏,屬性增長快等特點,為了解決這個問題,結(jié)合了實體關(guān)系模型和實體屬性值模型來存儲臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù),存儲模型具有可擴展性,在此基礎(chǔ)上建立了數(shù)據(jù)庫和電子健康記錄,并且在系統(tǒng)中融合了可擴展標記語言格式的臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù)和千人基因組計劃變異標準數(shù)據(jù);新建立的電子健康記錄除了具有常見功能,還可以存儲臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù),并且根據(jù)這些不斷增長的組學(xué)知識庫給醫(yī)生的臨床診斷提供決策支持。通過病人的個人基因組測序數(shù)據(jù),從中檢測到染色體變異的位置,將這些信息和系統(tǒng)中存儲的臨床基因組學(xué)數(shù)據(jù)作為輔助信息幫助醫(yī)生。檢測變異的過程中沒有用到個人基因組碎片中的DNA序列信息,針對這個問題,論文中提出了一種基于DNA序列的特征信息提取方法,引入了信息熵的概念,通過互信息量把單聯(lián),雙聯(lián)和三聯(lián)密碼子有機結(jié)合到一起,作為特征信息融合到染色體缺失的檢測過程中,和三個經(jīng)典的染色體缺失檢測方法進行了實驗比較,實驗結(jié)果表明,新的方法可以更好的提取有效的信息,在染色體缺失檢測和臨床決策支持過程中發(fā)揮了更好的作用,準確率好于先前的方法,可得到結(jié)論,論文中的方法是有效的。
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R-05;TP311.13

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本文編號:2608297

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