多位點結(jié)合型流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的設(shè)計、合成與活性研究
發(fā)布時間:2025-03-19 05:26
流感病毒(Influenza virus,IFV)的爆發(fā)給人類的健康和生命造成了嚴重危害,時常出現(xiàn)的致病性禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)感染同樣會給人類帶來致命性威脅,給世界各國帶來極大的恐慌。在流感病毒的生命周期中,神經(jīng)氨酸酶(Neuraminidase,NA)負責催化水解宿主細胞表面唾液酸與流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)之間的糖苷鍵,使成熟的病毒從被感染的細胞表面釋放出來從而繼續(xù)感染其它細胞。另外,NA裂解完子代病毒粒子的HA與宿主細胞之間連接的唾液酸殘基后還要行使另外兩種重要功能:①阻止子代病毒粒子從宿主細胞釋放后發(fā)生凝聚;②裂解呼吸道黏膜中的唾液酸,從而阻止子代病毒顆粒滅活,加速流感病毒在呼吸道中的傳播,因此,NA是抗流感病毒藥物設(shè)計的理想靶點。環(huán)己烯類NA抑制劑(Neuraminidase inhibitors,NAIs)磷酸奧司他韋具有高效、低毒、生物利用度高的優(yōu)點,是目前唯一的口服NAI。但是由于流感病毒固有的高變異性,快速出現(xiàn)的耐藥株(如N1-H274Y和N2-E119V突變株)嚴重削弱了該藥物的防治作用。目前,抗流感...
【文章頁數(shù)】:375 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
符號說明
第一章 緒論
第一節(jié) 流感的流行性
第二節(jié) 流感病毒的結(jié)構(gòu)特征及其分類
1 流感病毒的結(jié)構(gòu)特征
2 流感病毒的分類、分型及命名
第三節(jié) 流感病毒的生命周期與突變機制
1 流感病毒的生命周期
2 流感病毒的突變機制
第四節(jié) 流感的預防與治療
1 流感的臨床表現(xiàn)和診斷
2 流感的疫苗預防及其問題
3 小分子抗流感病毒藥物
3.1 M2離子通道阻滯劑
3.2 神經(jīng)氨酸酶抑制劑
3.3 以聚合酶為靶點的流感病毒抑制劑
3.4 廣譜抗病毒藥物
第五節(jié) 流感病毒神經(jīng)氨酸酶的特點及功能
1 神經(jīng)氨酸酶的結(jié)構(gòu)特征
2 神經(jīng)氨酸酶的生物學功能
3 流感病毒神經(jīng)氨酸酶的活性位點及其抑制劑的設(shè)計
第六節(jié) 流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的研究進展
1 上市流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的發(fā)展歷程
2 新型神經(jīng)氨酸酶抑制劑的發(fā)現(xiàn)及優(yōu)化策略
2.1 對上市藥物的外周取代基修飾
2.2 生物電子等排和骨架躍遷策略
2.3 多位點策略
2.4 多價態(tài)結(jié)合策略
2.5 多靶點策略
2.6 共價結(jié)合策略
2.7 前藥策略
2.8 天然產(chǎn)物及化合物庫的高通量篩選
3 神經(jīng)氨酸酶抑制劑的耐藥性問題
第六節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第二章 靶向于GROUP-1和-2 NAS催化中心與150-CAVITY的雙位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成與活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 測試溶液的配制
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 無特定病原體(SPF)雞胚胎內(nèi)的抗流感病毒活性
1 主要儀器和耗材
2 主要材料和試劑
3 化合物溶液的配制
4 測試方法
5 活性結(jié)果分析
第五節(jié) 分子動力學模擬(MDS)研究
1 配體和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的制備
2 配體結(jié)合構(gòu)象的生成
3 分子動力學模擬
4 分子動力學模擬結(jié)果討論
第六節(jié) 活性化合物的臨床前初步成藥性評價
1 人肝微粒體(HLM)中的代謝穩(wěn)定性與人血漿中的穩(wěn)定性研究
2 急性毒性研究
2.1 動物準備
2.2 材料和方法
2.3 結(jié)果和討論
3 化合物I-2b和I-3b的臨床前藥代動力學研究
3.1 給藥與血樣采集
3.2 結(jié)果和討論
第七節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第三章 基于結(jié)構(gòu)優(yōu)化的GROUP-1 NAS選擇性和抗N1-H274Y耐藥性奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成與活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 測試溶液的配制
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 無特定病原體(SPF)雞胚胎內(nèi)的抗流感病毒活性
1 主要儀器和耗材
2 主要材料和試劑
3 化合物溶液的配制
4 測試方法
5 活性結(jié)果分析
第五節(jié) 分子動力學模擬研究
1 配體和蛋白結(jié)構(gòu)的制備
2 配體結(jié)合構(gòu)象的生成
3 分子動力學模擬
4 MM-GBSA計算
5 分子動力學模擬結(jié)果討論
第六節(jié) 活性化合物的臨床前初步成藥性評價
1 人血漿與人肝微粒體(HLM)中的代謝穩(wěn)定性研究
2 急性毒性研究
2.1 動物準備
2.2 材料和方法
2.3 結(jié)果和討論
3 化合物Ⅱ-14h和Ⅱ-15h的臨床前藥代動力學研究
3.1 給藥與血樣采集
3.2 結(jié)果和討論
第七節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第四章 其它靶向于GROUP-1 NAS催化中心和150-CAVITY的雙位點結(jié)合型(GROUP-1 NAS選擇性)奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成及其活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 測試溶液的配制
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 目標化合物的分子對接研究
第五節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第五章 靶向于NAS催化中心、150-CAVITY和430-CAVITY的三位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成及其活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 測試溶液的配制
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 目標化合物的分子對接研究
第五節(jié) 化合物IV-11E的小鼠急性毒性研究
1 動物準備
2 材料和方法
3 結(jié)果和討論
第六節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第六章 總結(jié)與展望
第一節(jié) 總結(jié)
一 基于NAs催化中心和150-cavity結(jié)構(gòu)的新型雙位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的發(fā)現(xiàn)
二 基于NAs催化中心、150-cavity和430-cavity結(jié)構(gòu)的新型多位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的發(fā)現(xiàn)
三 本論文創(chuàng)新點和標志性成果
四 本論文不足之處
第二節(jié) 展望
一 對本課題進一步的研究思路
二 抗流感病毒藥物的研究方向和發(fā)展趨勢
參考文獻
致謝
攻讀博士研究生期間科研及獎勵情況
附錄
學位論文評閱及答辯情況表
本文編號:4036735
【文章頁數(shù)】:375 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
符號說明
第一章 緒論
第一節(jié) 流感的流行性
第二節(jié) 流感病毒的結(jié)構(gòu)特征及其分類
1 流感病毒的結(jié)構(gòu)特征
2 流感病毒的分類、分型及命名
第三節(jié) 流感病毒的生命周期與突變機制
1 流感病毒的生命周期
2 流感病毒的突變機制
第四節(jié) 流感的預防與治療
1 流感的臨床表現(xiàn)和診斷
2 流感的疫苗預防及其問題
3 小分子抗流感病毒藥物
3.1 M2離子通道阻滯劑
3.2 神經(jīng)氨酸酶抑制劑
3.3 以聚合酶為靶點的流感病毒抑制劑
3.4 廣譜抗病毒藥物
第五節(jié) 流感病毒神經(jīng)氨酸酶的特點及功能
1 神經(jīng)氨酸酶的結(jié)構(gòu)特征
2 神經(jīng)氨酸酶的生物學功能
3 流感病毒神經(jīng)氨酸酶的活性位點及其抑制劑的設(shè)計
第六節(jié) 流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的研究進展
1 上市流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的發(fā)展歷程
2 新型神經(jīng)氨酸酶抑制劑的發(fā)現(xiàn)及優(yōu)化策略
2.1 對上市藥物的外周取代基修飾
2.2 生物電子等排和骨架躍遷策略
2.3 多位點策略
2.4 多價態(tài)結(jié)合策略
2.5 多靶點策略
2.6 共價結(jié)合策略
2.7 前藥策略
2.8 天然產(chǎn)物及化合物庫的高通量篩選
3 神經(jīng)氨酸酶抑制劑的耐藥性問題
第六節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第二章 靶向于GROUP-1和-2 NAS催化中心與150-CAVITY的雙位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成與活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 測試溶液的配制
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 無特定病原體(SPF)雞胚胎內(nèi)的抗流感病毒活性
1 主要儀器和耗材
2 主要材料和試劑
3 化合物溶液的配制
4 測試方法
5 活性結(jié)果分析
第五節(jié) 分子動力學模擬(MDS)研究
1 配體和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的制備
2 配體結(jié)合構(gòu)象的生成
3 分子動力學模擬
4 分子動力學模擬結(jié)果討論
第六節(jié) 活性化合物的臨床前初步成藥性評價
1 人肝微粒體(HLM)中的代謝穩(wěn)定性與人血漿中的穩(wěn)定性研究
2 急性毒性研究
2.1 動物準備
2.2 材料和方法
2.3 結(jié)果和討論
3 化合物I-2b和I-3b的臨床前藥代動力學研究
3.1 給藥與血樣采集
3.2 結(jié)果和討論
第七節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第三章 基于結(jié)構(gòu)優(yōu)化的GROUP-1 NAS選擇性和抗N1-H274Y耐藥性奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成與活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 測試溶液的配制
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 無特定病原體(SPF)雞胚胎內(nèi)的抗流感病毒活性
1 主要儀器和耗材
2 主要材料和試劑
3 化合物溶液的配制
4 測試方法
5 活性結(jié)果分析
第五節(jié) 分子動力學模擬研究
1 配體和蛋白結(jié)構(gòu)的制備
2 配體結(jié)合構(gòu)象的生成
3 分子動力學模擬
4 MM-GBSA計算
5 分子動力學模擬結(jié)果討論
第六節(jié) 活性化合物的臨床前初步成藥性評價
1 人血漿與人肝微粒體(HLM)中的代謝穩(wěn)定性研究
2 急性毒性研究
2.1 動物準備
2.2 材料和方法
2.3 結(jié)果和討論
3 化合物Ⅱ-14h和Ⅱ-15h的臨床前藥代動力學研究
3.1 給藥與血樣采集
3.2 結(jié)果和討論
第七節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第四章 其它靶向于GROUP-1 NAS催化中心和150-CAVITY的雙位點結(jié)合型(GROUP-1 NAS選擇性)奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成及其活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 測試溶液的配制
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 目標化合物的分子對接研究
第五節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第五章 靶向于NAS催化中心、150-CAVITY和430-CAVITY的三位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的設(shè)計、合成及其活性研究
第一節(jié) 目標化合物的設(shè)計
第二節(jié) 目標化合物的合成
1 儀器與試劑
2 目標化合物的合成路線與步驟
2.1 目標化合物的合成路線
2.2 目標化合物的合成步驟
3 合成實驗討論
4 主要中間體及目標化合物的編號和結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 目標化合物的體外活性評價結(jié)果與討論
1 目標化合物NA抑制實驗(酶水平)
1.1 測試原理
1.2 主要儀器和耗材
1.3 主要材料和試劑
1.4 測試溶液的配制
1.5 測試方法
1.6 實驗結(jié)果與討論
2 目標化合物抗流感病毒的活性篩選實驗(細胞水平)
2.1 測試原理
2.2 主要儀器和耗材
2.3 主要材料和試劑
2.4 化合物溶液的配制和細胞保存方法
2.5 測試方法
2.6 實驗結(jié)果與討論
第四節(jié) 目標化合物的分子對接研究
第五節(jié) 化合物IV-11E的小鼠急性毒性研究
1 動物準備
2 材料和方法
3 結(jié)果和討論
第六節(jié) 本章小結(jié)
參考文獻
第六章 總結(jié)與展望
第一節(jié) 總結(jié)
一 基于NAs催化中心和150-cavity結(jié)構(gòu)的新型雙位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的發(fā)現(xiàn)
二 基于NAs催化中心、150-cavity和430-cavity結(jié)構(gòu)的新型多位點結(jié)合型奧司他韋衍生物的發(fā)現(xiàn)
三 本論文創(chuàng)新點和標志性成果
四 本論文不足之處
第二節(jié) 展望
一 對本課題進一步的研究思路
二 抗流感病毒藥物的研究方向和發(fā)展趨勢
參考文獻
致謝
攻讀博士研究生期間科研及獎勵情況
附錄
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本文編號:4036735
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