PD-1/PD-L1蛋白—蛋白相互作用(PPI)調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選及生物活性評價
發(fā)布時間:2024-03-20 02:24
研究背景通過增強免疫細胞功能以清除癌細胞的治療手段——腫瘤免疫治療,是繼手術、放療、化療之后的一種突破性治療方法,包括癌癥疫苗、靶向抗體、過繼細胞療法(ACT)、免疫檢查點抑制劑(ICB)、非特異性免疫調(diào)節(jié)劑等多種形式。免疫檢查點分子通過產(chǎn)生免疫共抑制信號誘導細胞毒性T細胞無能,介導腫瘤免疫逃逸,是目前腫瘤免疫治療的重要靶標。免疫檢查點抑制劑通過阻斷共抑制信號重新激活T細胞而殺傷腫瘤細胞,現(xiàn)已成功用于黑色素瘤等多種惡性腫瘤的治療。其中,針對PD-1/PD-L1信號通路的抗體藥物發(fā)展最為迅速,已有Avelumab等多個單克隆抗體藥物上市。其存在的局限性包括不良的組織及腫瘤滲透性,較長的半衰期,不良的口服生物利用度以及昂貴的生產(chǎn)成本,阻礙了它們的廣泛臨床應用。而擁有大大降低生產(chǎn)成本、穩(wěn)定性良好、較小免疫原性副作用等固有優(yōu)勢的小分子抑制劑,有望成為抗體藥物的有效替代品或補充。研究目的本課題基于PD-1、PD-L1結構開展多肽及小分子的虛擬篩選研究,結合分子模擬技術發(fā)現(xiàn)理論候選化合物并分析結合模式,通過表面等離子共振(SPR)競爭性分析及生物活性測定評價其抗腫瘤活性,以期發(fā)現(xiàn)具有潛在應用價值的...
【文章頁數(shù)】:116 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
1 緒言
1.1 腫瘤的發(fā)生
1.1.1 腫瘤的發(fā)生
1.1.2 腫瘤微環(huán)境
1.1.3 腫瘤的免疫逃逸
1.2 腫瘤的免疫治療
1.3 免疫檢查點
1.4 PD-1/PD-L1 信號通路的研究進展
1.5 研究的選題
1.5.1 選題意義
1.5.2 擬解決的問題
1.5.3 主要技術路線
2 基于PD-1的PPI多肽調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
2.1 計算機虛擬篩選概述
2.1.1 計算機輔助藥物設計
2.1.2 虛擬篩選
2.1.3 分子對接
2.1.4 同源模建
2.2 人源PD-1/PD-L1 復合物晶體結構分析
2.3 材料與方法
2.3.1 實驗材料
2.3.2 實驗方法
2.4 結果與討論
2.4.1 同源模建
2.4.2 基于分子對接的虛擬篩選
2.4.3 多肽與PD-1 蛋白結合模式分析
2.5 本章小結
3 PPI多肽調(diào)節(jié)劑的合成、SPR分析及生物活性評價
3.1 多肽調(diào)節(jié)劑的合成
3.1.1 實驗原理
3.1.2 實驗方法
3.1.3 實驗結果
3.2 多肽與PD-1的SPR分析
3.2.1 實驗儀器與試劑
3.2.2 實驗原理與方法
3.2.3 SPR結果分析
3.3 多肽與PD-1/PD-L1 的競爭結合試驗
3.3.1 實驗方法
3.3.2 競爭性實驗結果
3.4 多肽調(diào)節(jié)劑的生物活性評價
3.4.1 T細胞活化試驗
3.4.2 T細胞細胞毒性試驗
3.5 本章小結
4 PPI小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.1 PPI小分子調(diào)節(jié)劑的分子對接
4.1.1 靶向PD-1 小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.1.2 以PD-L1 為靶點的小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.2 PPI調(diào)節(jié)劑的分子動力學模擬
4.2.1 分子動力學模擬的概論
4.2.2 實驗方法
4.2.3 實驗結果
4.3 本章小結
5 小分子調(diào)節(jié)劑的SPR分析及生物活性評價
5.1 小分子調(diào)節(jié)劑與PD-1/PD-L1的SPR分析
5.1.1 實驗方法
5.1.2 實驗結果與分析
5.2 基于SPR的競爭性結合試驗
5.2.1 實驗方法
5.2.2 競爭性實驗結果
5.3 小分子調(diào)節(jié)劑的生物活性評價
5.3.1 T細胞活化試驗
5.3.2 T細胞細胞毒性試驗
5.4 本章小結
6 全文總結
6.1 全文總結
6.2 工作展望
致謝
參考文獻
附錄1
附錄2
附錄3
個人簡歷、在校期間發(fā)表的學術論文及取得的研究成果
本文編號:3932814
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【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
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英文縮略詞表
1 緒言
1.1 腫瘤的發(fā)生
1.1.1 腫瘤的發(fā)生
1.1.2 腫瘤微環(huán)境
1.1.3 腫瘤的免疫逃逸
1.2 腫瘤的免疫治療
1.3 免疫檢查點
1.4 PD-1/PD-L1 信號通路的研究進展
1.5 研究的選題
1.5.1 選題意義
1.5.2 擬解決的問題
1.5.3 主要技術路線
2 基于PD-1的PPI多肽調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
2.1 計算機虛擬篩選概述
2.1.1 計算機輔助藥物設計
2.1.2 虛擬篩選
2.1.3 分子對接
2.1.4 同源模建
2.2 人源PD-1/PD-L1 復合物晶體結構分析
2.3 材料與方法
2.3.1 實驗材料
2.3.2 實驗方法
2.4 結果與討論
2.4.1 同源模建
2.4.2 基于分子對接的虛擬篩選
2.4.3 多肽與PD-1 蛋白結合模式分析
2.5 本章小結
3 PPI多肽調(diào)節(jié)劑的合成、SPR分析及生物活性評價
3.1 多肽調(diào)節(jié)劑的合成
3.1.1 實驗原理
3.1.2 實驗方法
3.1.3 實驗結果
3.2 多肽與PD-1的SPR分析
3.2.1 實驗儀器與試劑
3.2.2 實驗原理與方法
3.2.3 SPR結果分析
3.3 多肽與PD-1/PD-L1 的競爭結合試驗
3.3.1 實驗方法
3.3.2 競爭性實驗結果
3.4 多肽調(diào)節(jié)劑的生物活性評價
3.4.1 T細胞活化試驗
3.4.2 T細胞細胞毒性試驗
3.5 本章小結
4 PPI小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.1 PPI小分子調(diào)節(jié)劑的分子對接
4.1.1 靶向PD-1 小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.1.2 以PD-L1 為靶點的小分子調(diào)節(jié)劑的虛擬篩選
4.2 PPI調(diào)節(jié)劑的分子動力學模擬
4.2.1 分子動力學模擬的概論
4.2.2 實驗方法
4.2.3 實驗結果
4.3 本章小結
5 小分子調(diào)節(jié)劑的SPR分析及生物活性評價
5.1 小分子調(diào)節(jié)劑與PD-1/PD-L1的SPR分析
5.1.1 實驗方法
5.1.2 實驗結果與分析
5.2 基于SPR的競爭性結合試驗
5.2.1 實驗方法
5.2.2 競爭性實驗結果
5.3 小分子調(diào)節(jié)劑的生物活性評價
5.3.1 T細胞活化試驗
5.3.2 T細胞細胞毒性試驗
5.4 本章小結
6 全文總結
6.1 全文總結
6.2 工作展望
致謝
參考文獻
附錄1
附錄2
附錄3
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本文編號:3932814
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