計算機輔助藥物設(shè)計(computer aided drug design,CADD)通過計算機模擬、計算和預(yù)測藥物分子與受體之間的相互作用,是新藥設(shè)計、開發(fā)和優(yōu)化的重要技術(shù)手段。多肽(peptide)是氨基酸通過肽鍵的形式連接形成的一種短鏈化合物,在機體調(diào)節(jié)等方面發(fā)揮重要作用。多肽具有特異性強、親和力高及容易制備等優(yōu)點,近年來在臨床治療、藥物開發(fā)等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。為了克服多肽在體內(nèi)穩(wěn)定性較差和半衰期較短等不足,研究人員采用多種方法對多肽進行修飾改進,其中一個有效的策略就是將多肽與免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)中的可結(jié)晶片段(fragment crystallizable,Fc)進行連接構(gòu)建融合蛋白,稱之為肽體(peptibody)。肽體可以有效地延長多肽分子的血清半衰期,改善穩(wěn)定性和溶解度等特性,制備工藝和純化流程簡單,可以有效降低藥物成本。眼底新生血管性疾病是一類因視網(wǎng)膜和脈絡(luò)膜中血管畸形增生而引發(fā)的眼科疾病,新生血管性年齡相關(guān)性黃斑病變(age-related macular degeneration,AMD)是造成50歲以上老年人視力下降甚至失明的重要原因。...

【文章頁數(shù)】：113 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第一章 緒論
    1.1 計算機輔助藥物設(shè)計
    1.2 多肽與醫(yī)學(xué)應(yīng)用
    1.3 肽體
    1.4 肽體藥物設(shè)計
        1.4.1 功能多肽的獲取
        1.4.2 Fc片段選擇和設(shè)計
        1.4.3 融合方式選擇
        1.4.4 免疫原性評估
        1.4.5 小結(jié)
    1.5 眼底新生血管性疾病
        1.5.1 新生血管性年齡相關(guān)性黃斑變性AMD
        1.5.2 血管內(nèi)皮生長因子
        1.5.3 抗VEGF藥物現(xiàn)狀
        1.5.4 小結(jié)
    1.6 本文的主要研究內(nèi)容及結(jié)構(gòu)安排
第二章 抗新生血管多肽的篩選和驗證
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 材料
        2.2.2 生物淘選
        2.2.3 噬菌體ELISA實驗
        2.2.4 VEGFR-Fc結(jié)合肽合成和鑒定
        2.2.5 人臍靜脈內(nèi)皮細胞增殖實驗
        2.2.6 雞胚絨毛尿囊膜實驗
        2.2.7 體內(nèi)抗血管新生作用的驗證
        2.2.8 數(shù)據(jù)分析和統(tǒng)計
    2.3 實驗結(jié)果
        2.3.1 與VEGFR-Fc融合蛋白結(jié)合的噬菌體的親和性選擇和序列分析
        2.3.2 HRH多肽抑制人臍靜脈內(nèi)皮細胞的增殖
        2.3.3 HRH抑制雞胚絨毛尿囊膜的血管生成
        2.3.4 HRH抑制堿灼傷大鼠角膜新生血管模型中的新血管生成
        2.3.5 HRH抑制縫線誘導(dǎo)大鼠角膜新生血管模型中的新生血管生成
    2.4 本章討論
        2.4.1 HRH多肽抗血管新生功能及機制的研究
        2.4.2 生物淘選在HRH多肽篩選中的應(yīng)用
        2.4.3 抗血管新生肽HRH的應(yīng)用前景
    2.5 本章小結(jié)
第三章 HRH肽體藥物的設(shè)計與評估
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 設(shè)計模板
        3.2.2 分子動力學(xué)模擬
        3.2.3 結(jié)合自由能分析
    3.3 實驗結(jié)果
        3.3.1 HRH多肽結(jié)構(gòu)建模
        3.3.2 PbHRH肽體的結(jié)構(gòu)建模
        3.3.3 PbHRH-VEGFR-1 復(fù)合體結(jié)構(gòu)建模
        3.3.4 PbHRH-VEGFR-1 復(fù)合體結(jié)合自由能分析
        3.3.5 HRH-VEGFR-1 復(fù)合體分析
    3.4 本章討論
        3.4.1 PbHRH肽體的構(gòu)建
        3.4.2 PbHRH肽體的結(jié)構(gòu)及作用機制研究
    3.5 本章小結(jié)
第四章 PbHRH肽體免疫原性評估
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 MHC-Ⅰ類分子親和力預(yù)測
        4.2.2 MHC-Ⅱ類分子親和力預(yù)測
        4.2.3 MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ免疫原性預(yù)測
    4.3 實驗結(jié)果
        4.3.1 PbHRH和羅米司亭MHC-Ⅰ類分子親和力預(yù)測結(jié)果
        4.3.2 PbHRH和羅米司亭MHC-Ⅱ類分子親和力預(yù)測結(jié)果
        4.3.3 PbHRH和羅米司亭MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ免疫原性預(yù)測結(jié)果
        4.3.4 PbHRH預(yù)測表位HLA等位基因人群分布分析
        4.3.5 AMG819免疫原性評估結(jié)果
        4.3.6 Ang2 肽體免疫原性評估結(jié)果
    4.4 本章討論
        4.4.1 PbHRH肽體免疫原性評估
        4.4.2 MHC分子親和力預(yù)測及免疫原性預(yù)測
        4.4.3 肽體藥物免疫原性評估的有效流程
    4.5 本章小結(jié)
第五章 全文總結(jié)與展望
    5.1 全文總結(jié)
    5.2 后續(xù)工作展望
致謝
參考文獻
附錄
    附錄Ⅰ
    附錄Ⅱ
攻讀博士學(xué)位期間取得的成果



本文編號：3777126