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重組大腸桿菌中1,2,4-丁三醇合成途徑的構(gòu)建和優(yōu)化

發(fā)布時間:2017-05-09 15:08

  本文關(guān)鍵詞:重組大腸桿菌中1,2,4-丁三醇合成途徑的構(gòu)建和優(yōu)化,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:1,2,4-丁三醇(1,2,4-butanetriol,簡稱BT)是一種重要的非天然多元醇,在醫(yī)藥、軍工等領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用價值。醫(yī)藥方面,丁三醇可被用作陽離子脂質(zhì)體和多種手性藥物的合成前體。丁三醇最有潛力的應(yīng)用是作為1,2,4-丁三醇三硝酸酯(1,2,4-butanetriol trinitrate,BTTN)的合成前體,后者可代替硝化甘油作為推進劑和含能增塑劑,并具有更優(yōu)的理化性質(zhì)。此外,丁三醇還可用于合成聚氨酯泡沫、卷煙添加劑和彩色顯影劑,等等。目前1,2,4-丁三醇的商業(yè)生產(chǎn)多采用化學(xué)合成法,存在反應(yīng)條件苛刻、環(huán)境污染嚴重、生產(chǎn)危險性大、副產(chǎn)物多等弊端。近年來,越來越多的人將目光投向了利用成本低廉的原料,以反應(yīng)條件溫和、對環(huán)境友好且安全高效的生物合成法。目前已有研究者成功建立了用大腸桿菌轉(zhuǎn)化木糖生產(chǎn)1,2,4-丁三醇的菌株和工藝。但從已有報道來看,用重組E.coli轉(zhuǎn)化木糖生產(chǎn)丁三醇的催化效率較低,這導(dǎo)致丁三醇產(chǎn)量遠無法滿足工業(yè)規(guī)模生產(chǎn)的需求。如果要進一步提高1,2,4-丁三醇的轉(zhuǎn)化效率,首先必須對丁三醇的合成途徑進行系統(tǒng)的優(yōu)化,找出催化限速步驟,精確調(diào)節(jié)催化各個步驟酶的表達量,以實現(xiàn)最大的轉(zhuǎn)化通量。本文首先通過yag E、yjh H、yia E、ycd W和xyl AB等旁路基因的敲除,以及來自新月柄桿菌(Caulobacter crescentus)的D-木糖脫氫酶的編碼基因xdh和來自惡臭假單胞菌(Pseudomonas putida)的苯甲酰甲酸脫羧酶編碼基因mdl C在E.coli BW25113中的異源表達,成功構(gòu)建了能夠利用D-木糖合成0.30 g/L 1,2,4-丁三醇的重組菌株BW-011。為提高1,2,4-丁三醇的產(chǎn)量,我們分析了此合成途徑的限速步驟,并針對途徑中的第三步——3-脫氧-D-甘油-戊酮糖酸脫羧反應(yīng)進行了新的不同來源2-酮酸脫羧酶的篩選和表達。搖瓶轉(zhuǎn)化結(jié)果顯示,對于上述目標(biāo)反應(yīng),來自乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)的α-酮異戊酸脫羧酶(Kiv D)具有比Mdl C有更高的催化效率,表達Kiv D的重組菌株BW-025的丁三醇產(chǎn)量也達到了BW-011的3倍。之后我們對Kiv D進行了理性設(shè)計,旨在進一步提高Kiv D對目標(biāo)反應(yīng)的催化活性。與此同時,我們分別調(diào)節(jié)了BW-025的1,2,4-丁三醇合成途徑中各個步驟酶的表達量,以實現(xiàn)途徑轉(zhuǎn)化通量的提高,并發(fā)掘途徑中新的限速步驟。通過誘導(dǎo)型過表達xdh,我們最終獲得了1,2,4-丁三醇產(chǎn)量較BW-025提高了48.62%的重組菌株BW-074。此外,本文還探究了不同轉(zhuǎn)化條件對重組菌株1,2,4-丁三醇合成的影響。通過對培養(yǎng)基、溫度、初始菌量、p H和供氧等轉(zhuǎn)化條件的優(yōu)化,BW-025轉(zhuǎn)化72 h丁三醇的最高產(chǎn)量被提升至2.38 g/L。通過以上工作,本研究顯著提高了重組菌株利用木糖合成1,2,4-丁三醇的效率,并為之后生物法合成丁三醇的工作奠定了基礎(chǔ)并提供了一種方向。
【關(guān)鍵詞】:D-木糖 1 2 4-丁三醇 大腸桿菌 2-酮酸脫羧酶 理性設(shè)計 途徑優(yōu)化
【學(xué)位授予單位】:江南大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R914.5
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-7
  • 第一章 緒論7-13
  • 1.1 1,2,4-丁三醇7-10
  • 1.1.1 1,2,4-丁三醇的理化性質(zhì)7
  • 1.1.2 1,2,4-丁三醇的用途7
  • 1.1.3 1,2,4-丁三醇的化學(xué)法合成7-8
  • 1.1.4 1,2,4-丁三醇的生物法合成8-10
  • 1.2 代謝工程10
  • 1.3 研究意義及主要研究內(nèi)容10-13
  • 1.3.1 研究意義10-11
  • 1.3.2 研究內(nèi)容11-13
  • 第二章 大腸桿菌中 1,2,4-丁三醇合成途徑的初步構(gòu)建和表達13-35
  • 2.1 實驗材料14-16
  • 2.1.1 質(zhì)粒和菌株14
  • 2.1.2 引物14-15
  • 2.1.3 培養(yǎng)基15-16
  • 2.1.4 酶與試劑16
  • 2.2 實驗方法16-27
  • 2.2.1 常規(guī)分子實驗操作16-20
  • 2.2.2 BW-004的構(gòu)建20-22
  • 2.2.3 BW-010的構(gòu)建22-25
  • 2.2.4 重組大腸桿菌BW-011的構(gòu)建25-26
  • 2.2.5 菌株的培養(yǎng)和轉(zhuǎn)化26-27
  • 2.2.6 代謝產(chǎn)物的檢測分析27
  • 2.3 實驗結(jié)果27-33
  • 2.3.1 BW-004的構(gòu)建27-30
  • 2.3.2 BW-010的構(gòu)建30-31
  • 2.3.3 BW-011的構(gòu)建31-32
  • 2.3.4 BW-011的搖瓶轉(zhuǎn)化32-33
  • 2.4 本章小結(jié)33-35
  • 第三章 大腸桿菌合成 1,2,4-丁三醇的途徑優(yōu)化35-53
  • 3.1 實驗材料35-37
  • 3.1.1 質(zhì)粒和菌株35
  • 3.1.2 引物35-36
  • 3.1.3 培養(yǎng)基36-37
  • 3.1.4 酶與試劑37
  • 3.2 實驗方法37-43
  • 3.2.1 對新 2-酮酸脫羧酶的篩選37
  • 3.2.2 KivD的理性設(shè)計37
  • 3.2.3 重組質(zhì)粒的構(gòu)建37-42
  • 3.2.4 重組菌株的構(gòu)建42
  • 3.2.5 質(zhì)粒的化學(xué)轉(zhuǎn)化42
  • 3.2.6 菌株的培養(yǎng)和轉(zhuǎn)化42-43
  • 3.3 實驗結(jié)果43-50
  • 3.3.1 對新 2-酮酸脫羧酶的篩選43
  • 3.3.2 KivD的理性設(shè)計43-49
  • 3.3.3 1,2,4-丁三醇合成途徑中各步酶的表達量的精確調(diào)節(jié)49-50
  • 3.4 本章小結(jié)50-53
  • 第四章 轉(zhuǎn)化條件對 1,2,4-丁三醇合成的影響53-64
  • 4.1 實驗材料53
  • 4.1.1 菌株53
  • 4.1.2 培養(yǎng)基53
  • 4.1.3 試劑53
  • 4.2 實驗方法53-55
  • 4.2.1 菌株的培養(yǎng)和轉(zhuǎn)化53-54
  • 4.2.2 代謝產(chǎn)物的檢測分析54
  • 4.2.3 菌株生長情況分析54
  • 4.2.4 SDS-PAGE54-55
  • 4.3 實驗結(jié)果55-63
  • 4.3.1 不同轉(zhuǎn)化體系對 1,2,4-丁三醇合成的影響55-57
  • 4.3.2 不同轉(zhuǎn)化條件對 1,2,4-丁三醇合成的影響57-62
  • 4.3.3 優(yōu)化條件下的 1,2,4-丁三醇合成情況62-63
  • 4.4 本章小結(jié)63-64
  • 主要結(jié)論與展望64-66
  • 主要結(jié)論64-65
  • 展望65-66
  • 致謝66-68
  • 參考文獻68-72
  • 附錄: 作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文72-73
  • 附錄: 論文中主要基因序列73-81

【參考文獻】

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  本文關(guān)鍵詞:重組大腸桿菌中1,2,4-丁三醇合成途徑的構(gòu)建和優(yōu)化,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:352707

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