先天性青光眼患者CYP1B1及LTBP2基因突變篩查的研究
發(fā)布時間:2020-11-08 22:13
目的通過對中國漢族一個先天性青光眼家系及9例散發(fā)的先天性青光眼病例CYP1B1及LTBP2基因突變篩查,研究并確定其致病性,為中國漢族人群先天性青光眼的分子遺傳學(xué)發(fā)病機(jī)制提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。方法收集青島大學(xué)附屬醫(yī)院2007年2017年的1個先天性青光眼家系、9例散發(fā)病例及50位正常人,采集受試者靜脈血10ml,提取外周血全基因組DNA,聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增目的片段(CYP1B1基因編碼區(qū)及LTBP2基因的14個外顯子及鄰近內(nèi)含子)。瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,進(jìn)行直接測序。應(yīng)用Chromas和DNAman軟件篩查突變并與正常人對照,確定突變致病性。結(jié)果在先天性青光眼患者ZTC中發(fā)現(xiàn)了CYP1B1基因兩個錯義突變:c.988GT,c.989CT,p.A330F和c.1169GA,p.R390H。其中p.A330F在中國漢族人群中是首次報道,正常對照組未檢出。此外,發(fā)現(xiàn)該基因4種已報道的單核苷酸多態(tài)性(SNP):c.142CG,p.R48W;c.355GT,p.A119S;c.1347TC,p.D449D;c.1294CG,p.L432V。對LTBP2基因篩查發(fā)現(xiàn)家系患病父子及散發(fā)病例GYY內(nèi)含子序列點(diǎn)突變:g.74991741 AT(rs862032),位于Intron15-16,與疾病表型分離;在其他患者中檢查到另外3個內(nèi)含子突變:g.75022538TC(rs57176747);g.75019157AG(rs11622992)和g.74967541 AC,其中g(shù).74967541 AC無SNP編號,為首次報道,其位于編碼區(qū)后第46位核苷酸,屬于3'端UTR突變。在LTBP2基因編碼區(qū)鑒定出5個單核苷酸多態(tài)性(SNP),其中2個錯義突變:c.956CA,p.P319Q和c.4286GA,p.R1429Q,正常對照組亦檢出;3個同義突變:c.1287GA,p.L429L、c.2406TC,p.T802T和c.2502TC,p.T834T。其中p.L429L只在PCG患者中檢出,p.T802T和p.T834T在患者及正常對照組均存在;颊吆蛯φ战M都存在的內(nèi)含子突變?yōu)?g.74992861TG和g.74991959 AG。結(jié)論1.p.A330F突變在我國PCG患者中首次發(fā)現(xiàn),其與p.R390H形成的復(fù)合雜合突變使CYP1B1的結(jié)構(gòu)發(fā)生了顯著變化,是導(dǎo)致嚴(yán)重青光眼表型的致病性突變。2.LTBP2基因點(diǎn)突變g.74991741 AT與該家系發(fā)病相關(guān),其與g.74967541 AC、g.75022538 TC和g.75019157 AG都參與先天性青光眼發(fā)病。
【學(xué)位單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R775.4
【文章目錄】:
摘要
abstract
引言
材料與方法
1 研究對象
2 患者臨床資料
3 實(shí)驗(yàn)材料
4 主要儀器及設(shè)備
5 實(shí)驗(yàn)方法
5.1 標(biāo)本采集
5.2 配置溶液
5.3 外周血DNA的提取
5.4 PCR引物的設(shè)計與合成
5.5 PCR反應(yīng)步驟
5.5.1 PCR擴(kuò)增體系
5.5.2 PCR循環(huán)條件
5.6 瓊脂糖凝膠電泳
5.7 PCR產(chǎn)物測序
結(jié)果
1 患者的臨床特征
2 分子遺傳學(xué)研究結(jié)果
2.1 CYP1B1基因篩查結(jié)果
2.2 LTBP2基因篩查結(jié)果
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】
本文編號:2875427
【學(xué)位單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R775.4
【文章目錄】:
摘要
abstract
引言
材料與方法
1 研究對象
2 患者臨床資料
3 實(shí)驗(yàn)材料
4 主要儀器及設(shè)備
5 實(shí)驗(yàn)方法
5.1 標(biāo)本采集
5.2 配置溶液
5.3 外周血DNA的提取
5.4 PCR引物的設(shè)計與合成
5.5 PCR反應(yīng)步驟
5.5.1 PCR擴(kuò)增體系
5.5.2 PCR循環(huán)條件
5.6 瓊脂糖凝膠電泳
5.7 PCR產(chǎn)物測序
結(jié)果
1 患者的臨床特征
2 分子遺傳學(xué)研究結(jié)果
2.1 CYP1B1基因篩查結(jié)果
2.2 LTBP2基因篩查結(jié)果
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:2875427
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