【摘要】： 病理性近視眼是一種具有遺傳異質(zhì)性的重要致盲性眼病,迄今未找到明確的致病基因。病程晚期以伴發(fā)的眼底后極部萎縮變性、后鞏膜葡萄腫等為特征。本研究從分子遺傳學(xué)角度,采用候選基因驗證和全基因組掃描的方法探尋病理性近視眼的易感候選基因。 目的：旨在探討病理性近視眼病理生理相關(guān)候選基因PAX6基因、COL2A1基因及TGF-β1基因是否與病理性近視眼相關(guān)聯(lián)。 方法：按嚴(yán)格入選標(biāo)準(zhǔn)收集187例散發(fā)病理性近視眼患者,記錄患者臨床數(shù)據(jù)包括屈光度、眼軸長度及最佳矯正視力。抽取外周血5ml,提取基因組DNA。另取136位健康人作為正常對照。使用PCR技術(shù)檢測187例患者與136例對照的PAX6基因SNPs位點rs667773、rs3026390、rs3026393, COL2A1基因SNP位點rs1635529和TGF-β1基因SNP位點rs4803455的基因型頻率及等位基因頻率是否有差異以驗證基因PAX6、COL2A1及TGF-β1是否與病理性近視眼關(guān)聯(lián)。 結(jié)果：187例患者平均屈光度右眼為-17.19±5.78D,左眼為-17.03±5.56 D,平均眼軸長度右眼為30.09±2.52 mm,左眼為30.03±2.48mm ;平均最佳矯正視力logMAR BCVA右眼為0.52±0.37,左眼為0.50±0.39,雙眼間的臨床數(shù)據(jù)均不存在顯著統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05),所有患者都伴有輕度以上的雙眼眼底病變。在對PAX6基因的三個SNPs位點的關(guān)聯(lián)分析中,rs667773中基因型C/C、C/T、T/T頻率及等位基因C、T頻率在患者組及對照組間無顯著統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05),rs3026390基因型A/A、A/G、G/G頻率及等位基因A、G頻率在患者組及對照組間也不存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05),同樣患者組及對照組中SNP位點rs3026393基因型G/G、G/T、T/T頻率及等位基因G、T頻率也均不存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。COL2A1的SNP位點rs1635529上的基因型A/A、A/C、C/C頻率及等位基因A、C頻率在患者組及對照組中不存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05)。TGF-β1的SNP位點rs4803455基因型G/G、G/T、T/T頻率及等位基因G、T頻率在患者組及對照組間也不存在統(tǒng)計學(xué)差異(P0.05) 結(jié)論：候選基因PAX6基因、COL2A1基因及TGF-β1基因與病理性近視眼的關(guān)聯(lián)性在本研究中未被證實,有待于進(jìn)一步探究。 目的：旨在探究病理性近視眼致病的新候選基因,利用核心家系進(jìn)行全基因組掃描,篩查拷貝數(shù)變異區(qū)域中的基因。 方法：收集31個漢族病理性近視眼患者核心家系,抽取每個家系成員外周血5ml,提取基因組DNA,利用核心家系中的正常健康人作為對照,采用Affymetrix Human SNP Assay 6.0基因芯片對所有樣本進(jìn)行全基因組掃描,以CNVs作為遺傳學(xué)標(biāo)記進(jìn)行分析,尋找在病人的基因組中新生的拷貝數(shù)變化,在拷貝數(shù)變化的熱區(qū)尋找致病基因,對掃描結(jié)果進(jìn)行基于家系和基于數(shù)據(jù)庫正常人的比對分析。對于分析所得的重要候選區(qū)域,進(jìn)一步采用Real-time PCR驗證以排除假陽性結(jié)果。 結(jié)果：本研究共收集到31個病理性近視眼核心家系共96名成員。核平滑算法、HMM算法及Segmentation算法三種計算方法均指向兩個重要的CNV缺失區(qū)域,在一個核心家系中患病的母親和患兒在4q23有現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中沒有記錄的一段100kb左右的CNV缺失區(qū)域,這個區(qū)域也是已報道的高度近視眼位點MYP11所在的區(qū)域,缺失區(qū)域內(nèi)包含了一個候選基因CandidateⅠ;另一個核心家系中患者在9p24.3上出現(xiàn)了一段其未患病父母沒有,數(shù)據(jù)庫中也沒有記錄的新生CNV缺失區(qū)域,約350kb大小,缺失區(qū)域內(nèi)也僅包含了一個候選基因CandidateⅡ。HMM及Segmentation兩種算法同時指出了一個核心家系中患者在Xq25上出現(xiàn)了一段其未患病父母沒有,數(shù)據(jù)庫中也沒有記錄的新生CNV缺失區(qū)域,約100kb大小,該區(qū)域位于高度近視眼位點MYP13所在區(qū)域中,缺失區(qū)域內(nèi)包含了候選基因ACTRT1。通過Real-time PCR對以上三個重要的CNV缺失區(qū)域進(jìn)行進(jìn)一步的驗證,確定了患者中的CNV缺失確實存在,排除了假陽性的可能。 結(jié)論：CandidateⅠ、CandidateⅡ及ACTRT1是三個有希望的病理性近視眼的候選基因,但這些候選基因所在的CNV缺失區(qū)域在檢測的患者中沒有相互重疊,致病基因的確定有待于進(jìn)一步在大樣本的散發(fā)人群中進(jìn)行驗證及功能研究。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2010
【分類號】：R778.11

【共引文獻(xiàn)】

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1 初憲華,張俊華,滕克雨;結(jié)晶狀視網(wǎng)膜變性的臨床與遺傳學(xué)調(diào)查[J];濱州醫(yī)學(xué)院學(xué)報;1998年02期

2 張秀玲,王錦岐;Leber病2家系報告[J];美中國際眼科雜志;2002年02期

3 莫亞;王明芳;周綠綠;;近視病因研究進(jìn)展[J];國際眼科雜志;2010年02期

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5 溫臣婷;徐克勤;李國保;雷琦峰;;雙眼先天性無虹膜合并眼部六聯(lián)征一家系2例[J];國際眼科雜志;2011年01期

6 王平;葉志純;陶利娟;高喜容;謝麗華;楊惠玲;王曦瑯;;高度近視兒童中未檢測到TIGR基因突變(英文)[J];國際眼科雜志;2011年02期

7 韋偉;楊曉釗;李軍;軒趁喜;朱秀萍;;西安市在校青少年學(xué)生用眼衛(wèi)生狀況調(diào)查[J];國際眼科雜志;2011年02期

8 周波;龍華;;先天性小瞼裂綜合征家系分析及手術(shù)治療[J];國際眼科雜志;2011年05期

9 單明華;李楊;;結(jié)晶樣視網(wǎng)膜變性研究進(jìn)展[J];國際眼科縱覽;2006年04期

10 劉旭陽;Leber氏病發(fā)病機(jī)理研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué).眼科學(xué)分冊;1994年02期

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1 姜波;中國漢族人群PAX6基因多態(tài)性與高度近視的關(guān)聯(lián)研究[D];浙江大學(xué);2011年

2 江潔慈;泗濱砭石療法治療青少年假性近視的臨床研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2011年

3 于志強(qiáng);病理性近視的家系研究和基因的初步定位[D];復(fù)旦大學(xué);2003年

4 李寧東;兩個常染色體顯性遺傳視網(wǎng)膜色素變性家系連鎖分析[D];天津醫(yī)科大學(xué);2004年

5 鄭建秋;先天性遺傳性核性白內(nèi)障致病基因的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2005年

6 查屹;中國漢族人群轉(zhuǎn)化生長因子β1和β3基因多態(tài)性與高度近視的關(guān)聯(lián)研究[D];浙江大學(xué);2008年

7 公小蕾;X-連鎖視網(wǎng)膜色素變性三個家系基因突變篩查[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);2008年

8 陳強(qiáng);一個遺傳性白內(nèi)障家系致病基因的突變檢測及其致病機(jī)制研究[D];武漢大學(xué);2010年

9 王潔月;DAT對豚鼠形覺剝奪性近視眼視網(wǎng)膜色素上皮bFGF表達(dá)作用的研究[D];中南大學(xué);2010年

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3 陳兵;瞳孔異位與白斑兩種突變小鼠的基因定位和白斑候選基因的序列分析[D];揚州大學(xué);2005年

4 杜培潔;Leber遺傳性視神經(jīng)病突變位點的研究[D];鄭州大學(xué);2005年

5 邵宇;虹膜識算法的研究與實現(xiàn)[D];蘭州大學(xué);2006年

6 林楠;綜合療法治療青少年近視眼療效的影響因素研究[D];大連醫(yī)科大學(xué);2006年

7 王才名;虹膜特征提取的算法研究[D];國防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2006年

8 張小平;年齡相關(guān)性黃斑變性與遠(yuǎn)視的相關(guān)性初探[D];山東中醫(yī)藥大學(xué);2008年

9 范加利;基于DM642的嵌入式虹膜識別系統(tǒng)設(shè)計[D];哈爾濱工程大學(xué);2008年

10 張馨方;視網(wǎng)膜色素變性患者RP1基因突變特征及其表型的研究[D];寧夏醫(yī)學(xué)院;2008年

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本文編號：2336157