本文選題：鼻咽癌 + 分化�。� 參考：《中南大學(xué)》2010年博士論文

【摘要】： 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)具有顯著的地理和種族分布特征,是我國南方及東南亞地區(qū)最常見的惡性腫瘤之一,具有發(fā)病部位隱匿,早期癥狀不明顯,容易延誤診斷等臨床特點(diǎn),發(fā)病率和死亡率均居頭頸部惡性腫瘤之首。其病理組織學(xué)類型以低分化或未分化癌多見,約占NPC初診病例的97%以上。目前的研究結(jié)果認(rèn)為NPC的發(fā)病與遺傳因素、EB病毒感染和環(huán)境因素有關(guān),但不同分化程度的NPC發(fā)病機(jī)制仍不清楚。 蛋白質(zhì)組學(xué)作為一種高通量研究手段,能廣泛覆蓋研究對象某個(gè)病理生理階段下的蛋白質(zhì)組,獲得全面的新的信息；比較同一研究對象不同狀態(tài)下的蛋白質(zhì)組差異,能為研究病因發(fā)病學(xué)和尋找新的有效的診斷和治療標(biāo)志物提供新的手段。長久以來,鼻咽癌組織的蛋白質(zhì)組學(xué)研究局限于正常鼻咽上皮和單一組織學(xué)類型的低分化或未分化鼻咽癌組織間的比較分析。高分化鼻咽癌的新鮮組織標(biāo)本在短時(shí)期內(nèi)難以收集,成為研究NPC分化機(jī)制的瓶頸。 近年興起的以福爾馬林固定-石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedded, FFPE)組織為研究對象的蛋白質(zhì)組學(xué)打破了長久以來蛋白質(zhì)組學(xué)以新鮮冰凍組織標(biāo)本為研究對象的傳統(tǒng)模式,創(chuàng)新性地提出“FFPE組織標(biāo)本可以替代新鮮組織用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究,進(jìn)行腫瘤標(biāo)志物和治療靶標(biāo)的搜尋工作”。FFPE組織標(biāo)本與新鮮組織標(biāo)本相比,最大的優(yōu)勢在于豐富的庫存資源和完善的診斷治療預(yù)后等臨床資料,因此,FFPE蛋白質(zhì)組學(xué)具有傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)不可比擬的優(yōu)越性。 本研究借助FFPE組織豐富的庫存優(yōu)勢,首次針對三種不同分化類型的鼻咽癌組織進(jìn)行了定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究,建立了鼻咽癌不同分化類型的差異蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫。采用的是SDS組織裂解液萃取FFPE組織蛋白質(zhì),結(jié)合iTRAQ標(biāo)記定量技術(shù)和2D LC-MS／MS蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線。這也是首次將iTRAQ標(biāo)記技術(shù)應(yīng)用于SDS裂解液萃取的FFPE組織來源的蛋白質(zhì)組。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,所得到的鼻咽癌FFPE組織的蛋白質(zhì)組與新鮮組織來源的無明顯差異。經(jīng)免疫組化和Western blot驗(yàn)證,iTRAQ標(biāo)記定量技術(shù)與FFPE組織來源的蛋白質(zhì)兼容,并且定量數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠。研究得到了730個(gè)非冗余蛋白質(zhì),其中531個(gè)有定量信息,隨鼻咽癌分化程度降低而表達(dá)上調(diào)的141個(gè),表達(dá)下調(diào)的140個(gè),呈波動(dòng)性變化的157個(gè)。運(yùn)用Cytoscape軟件從中篩選出146個(gè)與“cancer AND differentiation”密切相關(guān)的差異蛋白質(zhì),并得到鼻咽癌分化相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)圖。根據(jù)GO分類將定量蛋白質(zhì)按細(xì)胞組份、分子功能、生物學(xué)過程進(jìn)行分類,將三類不同分化程度的鼻咽癌組織中表達(dá)的蛋白質(zhì)串聯(lián)成一幅動(dòng)態(tài)變化的圖譜,發(fā)現(xiàn)隨著NPC分化變差,細(xì)胞生長增殖加速、細(xì)胞凋亡減少、免疫防御機(jī)制減弱、DNA修復(fù)失效、能量代謝更旺盛。另外,根據(jù)差異蛋白質(zhì)編碼基因的染色體定位分類,能找到參與鼻咽癌分化過程最活躍的染色體區(qū)域。其中12號染色體上聚集了最多的隨鼻咽癌分化程度降低而表達(dá)升高的蛋白質(zhì)編碼基因,約占表達(dá)升高組的10.6%。 本研究首次以鼻咽癌FFPE組織為研究對象建立了鼻咽癌分化相關(guān)的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫,為研究鼻咽癌分化的分子機(jī)理和挖掘鼻咽癌治療靶標(biāo)奠定了基礎(chǔ)。FFPE組織蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)路線的成功建立為鼻咽癌蛋白質(zhì)組學(xué)研究開拓了更廣闊的研究領(lǐng)域。
[Abstract]:Nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) is characterized by significant geographic and ethnic distribution . It is one of the most common malignant tumors in the South and Southeast Asia region . The morbidity and mortality rate of NPC is more than 97 % of the primary malignant tumor of the head and neck . The pathological and histological type of NPC is more than 97 % of the primary malignant tumor of NPC . The present study results suggest that NPC ' s pathogenesis is related to genetic factor , Epstein - Barr virus infection and environmental factor , but the pathogenesis of NPC is still unclear .



Proteomics , as a high - throughput research method , can be widely used to study the proteome in a certain pathological stage of the subject , so as to obtain a comprehensive new information ;
To compare the differences of protein groups in different states of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) , it is possible to provide new means to study the pathogenesis of NPC and to find new and effective markers for diagnosis and treatment . For a long time , the proteomic study of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) has been limited to the comparative analysis between normal nasopharyngeal epithelium and single histological type of low differentiation or undifferentiated nasopharyngeal carcinoma .



Proteomics , which was developed in recent years in formalin - fixed paraffin - embedded ( FFPE ) tissue , has broken the traditional model for the study of tissue specimens from fresh frozen tissue .



A quantitative proteomic study was conducted on three different types of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) tissues by means of FFPE . The results showed that there were no significant differences between the proteins of different differentiation types in nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) .



For the first time , we have established a database of protein groups related to the differentiation of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) from FFPE tissue of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) , which lays a foundation for the study of molecular mechanism of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) and the treatment of nasopharyngeal carcinoma ( NPC ) .

【學(xué)位授予單位】：中南大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2010
【分類號】：R739.63

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 陳主初;腫瘤蛋白質(zhì)組學(xué)的研究進(jìn)展[J];癌癥;2004年02期

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本文編號：1748684