反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)對(duì)丙型肝炎病毒可視化分型檢測(cè)
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【摘要】:目的應(yīng)用反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(RT-LAMP)可視化檢測(cè)丙型肝炎病毒(HCV)1b和2a基因型,為RTLAMP技術(shù)應(yīng)用于現(xiàn)場(chǎng)或基層醫(yī)院提供初步探索經(jīng)驗(yàn)。方法首先,收集臨床陽性樣本并用熒光定量PCR分型檢測(cè),把樣本基本分為1型和非1型。然后分別根據(jù)HCV 1b和2a基因型設(shè)計(jì)RT-LAMP引物并優(yōu)化反應(yīng)條件,通過互換模板實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證這2套引物的特異性,并通過檢測(cè)稀釋的模板以驗(yàn)證引物的靈敏度。同時(shí)用鈣黃綠素進(jìn)行產(chǎn)物顯色,使HCV分型檢測(cè)可視化。最后用RT-LAMP方法檢測(cè)臨床樣本,并計(jì)算陽性率,應(yīng)用配對(duì)卡方檢驗(yàn)比較RT-LAMP和熒光定量PCR的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)果優(yōu)化好的RT-LAMP體系的特異性好,對(duì)HCV 1b型的檢測(cè)靈敏度為103 IU/mL,2a型的檢測(cè)靈敏度為104 IU/mL。另外,利用鈣黃綠素進(jìn)行產(chǎn)物檢測(cè)的效果和電泳結(jié)果相當(dāng)。通過對(duì)臨床樣本分型檢測(cè),HCV 1b型樣本的RTLAMP檢測(cè)結(jié)果和熒光定量PCR差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),HCV 2a型樣本的RT-LAMP檢測(cè)結(jié)果和熒光定量PCR差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),但是未檢出的樣本中有2例為HCV 2b型。結(jié)論 RT-LAMP對(duì)HCV的可視化分型檢測(cè)具有較好的特異性和靈敏度,操作簡便,具有在現(xiàn)場(chǎng)或基層醫(yī)院的應(yīng)用前景。
【作者單位】: 承德醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室;中國人民解放軍白求恩國際和平醫(yī)院全軍肝病診治中心;
【關(guān)鍵詞】: 丙型肝炎病毒(HCV) 反轉(zhuǎn)錄環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(RT-LAMP) 分型檢測(cè)
【基金】:全軍醫(yī)藥衛(wèi)生科研基金項(xiàng)目(No.CBJ14C010)資助~~
【分類號(hào)】:R512.63;R440
【正文快照】: 丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)是僅次于乙型肝炎病毒引起慢性肝炎的主要病原體,如果不進(jìn)行正確治療,將有相當(dāng)比例的患者會(huì)發(fā)展為肝硬化甚至肝癌。根據(jù)HCV序列之間超過30%的差異,可將HCV主要分為6個(gè)基因型,每一型又可細(xì)分為不同的亞型。HCV基因分型檢測(cè)具有重要的臨床意
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本文編號(hào):732168
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