HBV相關(guān)疾病遺傳易感性研究及功能驗證
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《北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院》 2012年
HBV相關(guān)疾病遺傳易感性研究及功能驗證
忻振慧
【摘要】:研究背景 在世界范圍內(nèi)超過3.5億人是慢性乙肝病毒(hepatitis B virus, HBV)攜帶者。部分慢性乙肝患者(chronic hepatitis B patients, CHB)會進(jìn)一步發(fā)展成終末期肝病,包括肝硬化和肝癌。肝硬化(liver cirrhosis, LC)是慢性肝病在發(fā)展過程中持續(xù)性的肝損傷-愈合反應(yīng)導(dǎo)致而成的。肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是世界范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一。研究表明,病毒因素、環(huán)境因素以及宿主的遺傳因素相互作用,影響HBV感染的結(jié)局。其中,宿主細(xì)胞內(nèi)一些重要信號通路的異常已成為疾病發(fā)生機(jī)制的研究熱點。 轉(zhuǎn)換生長因子β(transforming growth factor beta, TGF-B)信號通路可調(diào)節(jié)多種細(xì)胞生物學(xué)過程,如細(xì)胞增殖、分化、凋亡、纖維化、腫瘤發(fā)生、血管生成以及免疫應(yīng)答等。TGF-β1及其三個受體,即轉(zhuǎn)化生長因子β受體I(TβRI),受體Ⅱ(TBRII),受體Ⅲ(TBRIII)在慢性乙肝發(fā)展進(jìn)程中發(fā)揮著重要的作用。此外,血管內(nèi)皮生長因子A(vascular endothelial growth factor A, VEGFA)可在體內(nèi)誘導(dǎo)血管新生,并且可以增加血管通透性,因此它在腫瘤的生長、轉(zhuǎn)移過程中扮演著至關(guān)重要的角色。本研究采用病例-對照的研究方法,以TGF-β信號通路上的4個核心家族成員,即TGF-β1、TfiRⅠ、TβRIⅡ、TβRⅢ為候選基因,以探討HBV相關(guān)疾病遺傳易感性。并通過對本實驗室已篩出的肝癌易感基因VEGFA,進(jìn)行進(jìn)一步的功能驗證,將有助于尋找更為合適而有效的治療靶點。 研究方法 以347例肝癌患者、243例肝硬化患者、708例慢肝患者和881例未感染過HBV且乙肝五項全陰的人群為研究對象,采用病例-對照的研究方法,利用PCR-RFLP/TaqMan的檢測方法分析TGF-β1及其三個受體基因潛在功能區(qū)域上的16個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)位點(TGF-β1基因上的rs2317130,rs4803457, rs56719111, rs1800469和□rs1800470; TβRI基因上的rs334348,rs334349,rs3739798和rs1590;TβRⅡ基因上的rs2228048;TβRⅢ基因上的rs1805109,rs1805110,rs2810904,rs1805112,rs284878和rs1804506)與HBV相關(guān)疾病遺傳易感性的關(guān)聯(lián)性。并通過雙熒光素酶報告基因?qū)嶒、凝膠遷移率實驗(electrophoretic mobility shift assay, EMSA)以及實時熒光定量PCR實驗對肝癌易感基因VEGFA啟動子區(qū)SNPs影響基因轉(zhuǎn)錄活性進(jìn)行進(jìn)一步的功能驗證。 研究結(jié)果 1.分別進(jìn)行三組病例-對照研究,分析TGF-β1及其3個受體基因多態(tài)性與HBV相關(guān)疾病的關(guān)聯(lián)性。 1)以CHB為病例,未感染過HBV且乙肝五項全陰的人群為對照進(jìn)行研究 單位點分析未發(fā)現(xiàn)與CHB易感性相關(guān)聯(lián)的SNPs。 2)以LC為病例,未感染過HBV且乙肝五項全陰的人群為對照進(jìn)行研究 單位點分析未發(fā)現(xiàn)與LC易感性相關(guān)聯(lián)的SNPs。 3)以HCC為病例,未感染過HBV且乙肝五項全陰的人群為對照進(jìn)行研究 單位點分析結(jié)果顯示,TβRⅢ基因上的rs1805110的T等位基因頻率在病例組中顯著高于對照組,二者呈現(xiàn)顯著的統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.034)。 性別分層后分析結(jié)果顯示,在男性中,rs1805110位點的T等位基因頻率在病例組與對照組的統(tǒng)計學(xué)差異更為顯著(P=0.005),但這種統(tǒng)計學(xué)差異在女性中不存在。進(jìn)一步進(jìn)行單倍型分析結(jié)果顯示,TβRⅢ基因的5個SNPs位點組成的單倍型C-C-G-C-A在病例組中的分布頻率顯著低于對照組(P=0.001),而單倍型T-C-G-C-A的分布頻率在病例組中顯著高于對照組(P=0.036)。 2.HCC發(fā)生的易感基因VEGFA的功能驗證 1) VEGFA基因啟動子區(qū)多態(tài)性位點對啟動子活性的影響 已成功構(gòu)建的4個表達(dá)質(zhì)粒pGL3-VEGFA-啟動子區(qū)域(-1661~+279bp),在瞬時轉(zhuǎn)染HepG2細(xì)胞后,雙熒光素酶報告基因?qū)嶒灆z測結(jié)果顯示,rs833061C-rsl570360A質(zhì)粒的表達(dá)活性是rs833061T-rs1570360G表達(dá)活性的2.59倍,二者呈現(xiàn)顯著的統(tǒng)計學(xué)差異(P=0.00005)。 2) VEGFA基因18bp插入等位基因與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點 EMSA實驗結(jié)果表明,18bp插入等位基因產(chǎn)生一個與Spl轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的位點。 3) VEGFA的mRNA表達(dá)水平 實時熒光定量PCR實驗結(jié)果顯示,HCC患者VEGFA的mRNA表達(dá)水平是CHB患者的5.16倍,是乙肝病毒表面抗原(HBsAg)為陰性的健康人群的6.95倍,在三者間呈現(xiàn)顯著的統(tǒng)計學(xué)差異(P=1.15e-10)。 研究結(jié)論 1.HBV相關(guān)疾病遺傳易感性的研究結(jié)果提示,在男性中,位于TβRⅢ基因上的rs1805110-T等位基因是HBV相關(guān)肝癌發(fā)生的危險因素。 2.對肝癌易感基因VEGFA功能驗證結(jié)果提示,EGFA啟動子區(qū)的SNPs可能會通過改變啟動子的活性來促進(jìn)肝癌的發(fā)生。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R735.7;R512.62
【目錄】:
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【共引文獻(xiàn)】
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本文編號:210123
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