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SD大鼠下丘的蛋白提取和分析

發(fā)布時間:2017-06-12 07:10

  本文關鍵詞:SD大鼠下丘的蛋白提取和分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:研究聽覺傳導通路中下丘(Inferior colliculus, IC)的蛋白質(zhì)表達情況,找出下丘區(qū)域特異性蛋白,并進一步分析其基因組成,以及各基因間的相互關系,從而探索IC在中樞聽覺信息整合及處理中的作用及機制,為進一步研究中樞聽覺處理障礙(Central auditory processingdi sorders,CAPD)的發(fā)病機制提供一定的理論基礎。方法:對出生后60天體重230g左右的雄性SD大鼠的IC、耳蝸核(Cochlear Nucleus, CN)、上橄欖核復合體(Superior Oliver Complex, SOC)、端腦包括大腦皮層和小腦(Rest)這四個區(qū)域細胞質(zhì)和細胞膜的蛋白質(zhì)組學進行研究。(1)細胞質(zhì)蛋白采用熒光差異雙向電泳技術(shù)(Two dimension difference gel electrophoresis,2D-DIGE)進行分離。(2)細胞膜蛋白采用同位素標記相對和絕對定量(isobarictagsfor relative and absolute quantitation, iTRAQ)的方法進行鑒定。采用質(zhì)譜分析對各蛋白點進行定性定量分析,找出IC區(qū)域特異性蛋白,再對其進行基因本體(Gene Ontology, GO)分析、京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析以及蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析,探索這些區(qū)域特異性蛋白的功能以及其在各通路中所起的作用,篩選出聽覺處理障礙相關的目標蛋白。結(jié)果:本實驗最終通過2-D DIGE方法供檢測出4種IC區(qū)域特異性細胞質(zhì)蛋白,通過iTRAQ的方法共檢測出53種IC區(qū)域特異性膜蛋白。通過對這些蛋白進行GO分析發(fā)現(xiàn)IC區(qū)域特異性蛋白主要起到了轉(zhuǎn)運及蛋白定位,進而調(diào)節(jié)神經(jīng)元生長發(fā)育以及信息整合的作用。通過KEGG通路分析的方法對這些區(qū)域特異性蛋白所參與的通路進行分析,可以看出其主要參與氧化磷酸化(Oxidativephosphorylation) ,興奮性突觸(Glutamatergic synapse)、抑制性突觸(GABAergic synapse).通過蛋白質(zhì)相互作用分析,發(fā)現(xiàn)CaMK2D,SV2A這兩種蛋白主要起到調(diào)節(jié)興奮性、抑制性神經(jīng)遞質(zhì)傳導及釋放功能。結(jié)論:(1)IC區(qū)域特異性蛋白主要參與興奮性突觸、抑制性突觸,維持興奮性-抑制性神經(jīng)遞質(zhì)平衡可能是IC進行聽覺處理、信息整合的關鍵。(2) CaMK2D,SV2A在IC中表達水平增高,二者起到維持下丘興奮性-抑制性神經(jīng)遞質(zhì)平衡的作用,這也是IC進行信息整合的基礎。蛋白質(zhì)組學研究是基礎性研究,需進一步進行功能驗證其與CAPD的關系。
【關鍵詞】:中樞聽覺處理 下丘 蛋白質(zhì)組學 熒光差異雙向電泳 同位素標記相對和絕對定量
【學位授予單位】:南京醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R764
【目錄】:
  • 中文摘要5-7
  • Abstract7-9
  • 引言9-11
  • 材料與方法11-19
  • 結(jié)果19-30
  • 討論30-36
  • 結(jié)論36-37
  • 參考文獻37-41
  • 文獻綜述41-57
  • 參考文獻50-57
  • 附錄1.攻讀學位期間發(fā)表論文情況57-58
  • 附錄2.致謝58

【參考文獻】

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中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

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