1.目的:鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma;NPC)是具有地區(qū)性流行趨勢的我國常見惡性腫瘤疾病之一,且在耳鼻喉科常見惡性腫瘤疾病中,鼻咽癌的發(fā)病率更是高居榜首。鼻咽癌多數(shù)發(fā)生于鼻咽部頂后壁、側(cè)壁等隱匿部位,侵襲性強而轉(zhuǎn)移早�？紤]多數(shù)鼻咽癌患者就醫(yī)時已處于中晚期狀態(tài)并有遠處轉(zhuǎn)移,治療效果多數(shù)欠佳,而早診斷、早治療能明顯改善其預(yù)后。因此尋找鼻咽癌的診治生物標(biāo)志物而為臨床早診斷提供相關(guān)依據(jù),將有效改善患者的生存質(zhì)量。本研究在全轉(zhuǎn)錄組高通量測序?qū)嶒灮A(chǔ)上,通過實時熒光定量PCR方法檢測lncRNA CASC15:4在鼻咽癌組織中的表達及其與多種臨床病理因素特征的相關(guān)性,借此發(fā)現(xiàn)鼻咽癌診治過程中的新興腫瘤標(biāo)志物,以便為鼻咽癌患者早期診斷提供理論指導(dǎo)依據(jù)。2.方法:(1)收集南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院門診耳鼻喉科醫(yī)師行鼻內(nèi)窺鏡下活檢術(shù)的殘余組織樣本,獲得首診鼻咽部非癌癥組織20例和鼻咽部癌癥組織30例。所有的活檢組織均由南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院病理科證實為鼻咽癌組織或鼻咽慢性炎癥組織。所有的臨床相關(guān)信息來自于被檢患者填寫的信息采集表。(2)選取6例病理結(jié)果分別確診為鼻咽癌及鼻咽炎癥的組...

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【學(xué)位級別】：碩士

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圖4.1堿基質(zhì)量分布圖

第4章實驗結(jié)果4.1鼻咽癌組織和鼻咽部非癌組織樣本測序及結(jié)果分析4.1.1本實驗原始數(shù)據(jù)質(zhì)量評估1）本實驗原始數(shù)據(jù)堿基質(zhì)量評估

圖4.2序列質(zhì)量得分注：橫軸為quality，縱軸是reads數(shù)目3）比對結(jié)果質(zhì)控

162)本實驗原始數(shù)據(jù)序列質(zhì)量評估圖4.2序列質(zhì)量得分注：橫軸為quality，縱軸是reads數(shù)目3)比對結(jié)果質(zhì)控一個高質(zhì)量的數(shù)據(jù)rRNA百分比應(yīng)小于5%，當(dāng)其大于5%時意味著實驗過程中rRNA去除不完全。如果有大于50%的基因間區(qū)域的序列數(shù)，則意味著基因組序列的污染。本實驗原....

圖4.3差異表達lncRNA熱圖

222）組間比較顯著性差異表達lncRNA熱圖利用R軟件將樣本lncRNA基因進行了聚類，此熱圖中每一列代表一個樣本，每一行代表一個基因，紅色示意為趨勢上調(diào)，綠色示意為趨勢下調(diào)。圖4.3差異表達lncRNA熱圖

圖4.4差異表達lncRNA火山圖

233）組間比較顯著性差異表達lncRNA火山圖火山圖清晰的展示了lncRNA的差異表達分布。其中，紅色的點示意為趨勢上調(diào)的lncRNA,綠色的點示意為趨勢下調(diào)的lncRNA，而藍色為表達不顯著改變。圖4.4差異表達lncRNA火山圖4.1.4lncRNA順勢調(diào)控編碼基因的功能富....

本文編號：4014983