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抑癌基因單核苷酸多態(tài)性與鼻咽癌遺傳易感性研究

發(fā)布時間:2019-02-13 19:55
【摘要】:背景與目的 鼻咽癌是我國的高發(fā)腫瘤,也是我區(qū)高發(fā)腫瘤之一,其病因包括EB病毒的感染、化學(xué)致癌因素及遺傳易感因素等,然而在同一地區(qū)同樣的暴露條件下的不同人群并不都患腫瘤,其中必然存在個體差異,即遺傳易感性。單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide Polymorphisms, SNPs)是人類可遺傳的變異中最常見的一種,占所有已知多態(tài)性的90%以上,是近年來腫瘤研究熱點之一。本項目的主要目的是研究相關(guān)抑癌基因的單核苷酸多態(tài)性與鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,為鼻咽癌的診治提供相關(guān)理論基礎(chǔ)。選擇與鼻咽癌相關(guān)的多個抑癌基因,包括p53、p16及Rb基因,通過對鼻咽癌患者與正常對照人群相關(guān)抑癌基因重要的SNP位點進(jìn)行對比研究,期望闡明遺傳易感性在鼻咽癌發(fā)生發(fā)展中的作用,也可以應(yīng)用于鼻咽癌高危人群的篩選,為鼻咽癌的早期干預(yù)提供理論基礎(chǔ)。 本研究計劃對鼻咽癌與正常對照人群p53、p16及Rb基因6個重要的SNP位點進(jìn)行對比研究,期望闡明相關(guān)抑癌基因p53、p16及Rb基因在廣西鼻咽癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用及其相互關(guān)系,為進(jìn)一步開發(fā)基因芯片實現(xiàn)高通量檢測打下基礎(chǔ),對鼻咽癌的診治提供新的思路,進(jìn)一步降低鼻咽癌發(fā)生率和死亡率,以更好地為廣大患者服務(wù)。 材料與方法 1.樣本與資料的收集 應(yīng)用病例-對照研究的方法在廣西南寧人群中,收集了2010年6月到2011年4月臨床資料完整的在廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院放療科住院患者的血液標(biāo)本200例,男性100例,女性100例;正常對照組200例:男性100例,女性100例。兩組人群血液標(biāo)本都來源于廣西南寧,均為南寧本地居民。鼻咽癌組和對照人群組界定標(biāo)準(zhǔn):鼻咽癌組:經(jīng)臨床和病理學(xué)均確診為癌,每位患者住院之前均未接受過化學(xué)治療、放射治療或生物治療等治療措施的干預(yù)。對照人群組:來源于同期身體健康的志愿獻(xiàn)血者。 2.實驗方法 用試劑盒法提取得到血液的DNA,經(jīng)過定量分析后置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆。用聚合酶鏈(zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性方法(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)及測序方法分析基因多態(tài)性及其基因突變分布頻率。 結(jié)果 本實驗研究主要對常見的抑癌基因的多態(tài)性與鼻咽癌的遺傳易感性的關(guān)系進(jìn)行的初步研究,所得的結(jié)果如下: 1.p53、p16及Rb基因多態(tài)性與鼻咽癌遺傳易感性的關(guān)聯(lián)分析 1.1 p53基因 1.1.1在鼻咽癌組與對照人群組p53基因rs 117562731位點攜帶變異等位基因的頻率分別為30.0%(60/200)和8.0%(16/200)。兩組之間基因型分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=31.449,P=0.000)。 1.1.2在鼻咽癌組與對照人群的p53基因rs 114831472位點攜帶變異等位基因的頻率分別為12.5%(25/200)和7.5%(15/200)。兩組之間基因分布比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=2.778,P=0.096)。 1.2 p16基因 1.2.1在鼻咽癌組與對照人群的p16基因rs 80235406位點攜帶變異等位基因的頻率分別為26.5%(53/200)和9.0%(18/200)。兩組之間基因分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=20.977,P=0.000)。 1.2.2在鼻咽癌組與對照人群的p16基因rs 121434309位點攜帶變異等位基因的頻率分別為22.5%(45/200)和8.5%(17/200)。兩組之間基因分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=14.965,P=0.000)。 1.3 Rb基因 1.3.1在鼻咽癌組與對照人群的Rb基因rs 117538467位點攜帶變異等位基因的頻率分別為34.5%(69/200)和11.5%(23/200)。兩組之間基因分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=29.870,P=0.000)。 1.3.2在鼻咽癌組與對照人群的Rb基因rs 117538467位點攜帶變異等位基因的頻率分別為28.0%(56/200)和12.5%(25/200)。兩組之間基因分布比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=14.877,P=0.000)。 2.p53、p16及Rb基因多態(tài)性與鼻咽癌臨床表型的關(guān)聯(lián)研究 2.1與AA基因型比較,p53基因rs114831472位點的GG基因型的頻率在T1組中高于T2-4組(7.9% VS 1.2%),差異有顯著性,提示GG基因型與局部侵襲(T分期)有顯著性關(guān)聯(lián)(p=0.017)。 p53基因rs117562731 SNP位點CT基因型的頻率與CC基因型頻率比較,在M1組中高于Mo組(44.4% VS 15.7%),差異有顯著性,提示CT基因型與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(M分期)有顯著性關(guān)聯(lián)(p=0.030)。2.2 p16基因rs80235406 SNP位點TT基因型的頻率與CC基因型頻率比較,在No-1組中明顯低于N2-N3組(1.6% VS 9.4%),差異有顯著性,說明TT基因型與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(N分期)有顯著性關(guān)聯(lián)(p=0.011)。 p16基因rs80235406 SNP位點TT基因型的頻率與CC基因型頻率比較,在Mo組中明顯低于M1組(3.1% VS 33.3%),p16基因rs121434309 SNP位點GG基因型的頻率與AA基因型頻率比較,在M1組中高于Mo組(22.2% VS 2.1%),差異有顯著性,說明這兩個基因型與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(M分期)均有顯著性關(guān)聯(lián)(p=0.000和p=0.001)。2.3 Rb基因rs117538467 SNP位點GG基因型的頻率與CC基因型頻率比較,在M0組中明顯低于M1組(4.2% VS 33.3%),Rb基因rs117209587 SNP位點GG基因型的頻率與AA基因型頻率比較,在M1組中高于Mo組(22.2% VS 3.1%),差異有顯著性,說明這兩個基因型與遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(M分期)均有顯著性關(guān)聯(lián)(p=0.023和p=0.002)。 結(jié)論 1.鼻咽癌組與正常對照人群的p53基因rs 114831472位點基因突變與分布無明顯差異,說明p53基因rs 114831472位點基因突變與鼻咽癌的發(fā)生無顯著相關(guān)性。 2.鼻咽癌組與正常對照人群的p53基因rs 117562731位點基因突變與分布有明顯差異,說明p53基因rs 117562731位點基因突變與鼻咽癌的發(fā)生有顯著相關(guān)性。 3.鼻咽癌組與正常對照人群的p16基因rs 80235406位點和rs121434309位點基因突變與分布有明顯差異,說明p16基因的兩個位點基因突變與鼻咽癌的發(fā)生有顯著相關(guān)性。 4.鼻咽癌組與對照人群的Rb基因rs 117538467位點和rs 117538467位點基因突變與分布有明顯差異,說明Rb基因的兩個位點基因突變與鼻咽癌的發(fā)生有顯著相關(guān)性。 5.p53、p16及Rb基因多態(tài)性與鼻咽癌臨床表型及疾病進(jìn)展有顯著相關(guān)性。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R739.63

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2421803

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