【摘要】：目的通過比較干眼患者和健康受試者眼表宏基因組的異同探討眼表微生物組的改變在干眼發(fā)病機制中的作用。方法在解放軍總醫(yī)院眼科和中山大學(xué)中山眼科中心收集干眼患者20例及健康受試者90名。對所有受試者雙眼進行結(jié)膜印跡細胞樣本采集,提取核酸后進行宏基因組測序。通過計算Shannon指數(shù)比較兩者微生物群落α多樣性的差異;對兩者微生物種群的相對豐度及代謝途徑進行生物信息學(xué)分析。并對微生物中的抗生素抗性基因進行比對。結(jié)果干眼患者眼表微生物的α多樣性與健康受試者相比差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.13)。干眼患者眼表15種微生物的相對豐度較高,健康受試者10種微生物的相對豐度較高,且在代謝途徑上存在著差異。干眼患者眼表微生物中的抗生素抗性基因明顯多于健康受試者。結(jié)論雖然干眼患者眼表微生物的多樣性與健康受試者相似,但某些特定微生物種群的相對豐度及代謝途徑存在特征性的改變,表明這些特定的微生物種群可能與干眼的發(fā)病機制有關(guān)。
[Abstract]:Objective to investigate the role of microorganism in the pathogenesis of dry eye by comparing the difference of macrogenome between dry eye patients and healthy subjects. Methods Twenty patients with dry eye and 90 healthy subjects were collected from ophthalmology center of PLA General Hospital and Zhongshan Ophthalmology Center of Sun Yat-sen University. Conjunctival imprinted cell samples were collected from the eyes of all subjects. The difference of 偽 -diversity of microbe community was compared by calculating Shannon index, and the relative abundance and metabolic pathway of microbe population were analyzed by bioinformatics. The antibiotic resistance genes in microorganisms were compared. Results there was no significant difference in 偽-diversity of microbes between dry eye patients and healthy subjects (P < 0. 13). The relative abundance of 15 microbes on the surface of dry eyes was higher than that of 10 microbes in healthy subjects, and there were differences in metabolic pathways. Antibiotic resistance genes in ocular surface microbes in dry eye patients were significantly higher than those in healthy subjects. Conclusion although the diversity of microbes in dry eye patients is similar to that in healthy subjects, the relative abundance and metabolic pathway of some specific microbial populations have characteristic changes. These specific microbial populations may be related to the pathogenesis of dry eyes.
【作者單位】： 解放軍總醫(yī)院眼科;中山大學(xué)中山眼科中心 眼科學(xué)國家重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金面上項目(編號:31271400、31470065) 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(編號:2013CB967001)~~
【分類號】：R777.34

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7 陳小t，

本文編號：2252880