本文選題：未分型流感嗜血桿菌　切入點(diǎn)：中耳炎　出處：《中華耳科學(xué)雜志》2017年01期

【摘要】：目的利用基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(GEO)查找小鼠中耳炎表達(dá)譜基因芯片原始數(shù)據(jù),建立中耳炎基因互作網(wǎng)絡(luò)圖。方法從公共數(shù)據(jù)庫(kù)GEO中下載小鼠中耳炎相關(guān)數(shù)據(jù)集,采用Affymetrix Expression Console軟件和Tran-scriptome Analysis Console(TAC)軟件篩選差異表達(dá)基因,將差異基因?qū)隨TRING在線數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行分析,繪制差異基因互作網(wǎng)絡(luò)圖,并將互作網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.4.0軟件中,篩選網(wǎng)絡(luò)中心節(jié)點(diǎn),并取其中相對(duì)獨(dú)立、作用較為集中且與炎癥基因相關(guān)子網(wǎng)絡(luò),采用David在線工具對(duì)其進(jìn)行功能注釋富集分析。結(jié)果共篩選出1166個(gè)差異表達(dá)基因,其中表達(dá)上調(diào)793個(gè),表達(dá)下調(diào)373個(gè),經(jīng)STRING在線工具篩選后共有459個(gè)小鼠中耳炎差異基因編碼的蛋白存在相互作用,并得到相應(yīng)蛋白互作網(wǎng)絡(luò),分析其中與炎癥相關(guān)子網(wǎng)絡(luò)。結(jié)論本研究利用生物信息學(xué)技術(shù)構(gòu)建了中耳炎差異基因互作網(wǎng)絡(luò),其中的網(wǎng)絡(luò)中心節(jié)點(diǎn)基因,對(duì)于中耳炎分子機(jī)制研究及靶向治療具有指導(dǎo)作用。
[Abstract]:Objective to search the original gene chip data of mouse otitis media expression profile using gene expression database (GEO), and to establish the gene interaction network map of otitis media.Methods the mouse otitis media related data set was downloaded from the common database GEO. The differentially expressed genes were screened by Affymetrix Expression Console and Tran-scriptome Analysis Consolesis-TACsoftware. The differentially expressed genes were transferred into STRING online database for analysis, and the network map of the interaction of differentially expressed genes was drawn.The interaction network data were imported into Cytoscape 3.4.0 software to screen the network center nodes, and the relatively independent, concentrated and inflammatory gene related subnetworks were selected. The David online tools were used to analyze the function of the network nodes.Results A total of 1166 differentially expressed genes were screened, of which 793 were up-regulated and 373 were down-regulated. A total of 459 proteins encoded by differential genes of otitis media in mice were screened by STRING online, and corresponding protein interaction networks were obtained.The subnetworks associated with inflammation were analyzed.Conclusion in this study, the differential gene interaction network of otitis media was constructed by using bioinformatics technology. The network center node gene is useful for the study of molecular mechanism and targeted therapy of otitis media.
【作者單位】： 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院耳鼻咽喉科;重慶醫(yī)科大學(xué)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院臨床檢驗(yàn)診斷學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;重慶市第六人民醫(yī)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(csfc81373151) 重慶市自然科學(xué)基金(cstc2012jj A10014) 重慶市教委科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(科建設(shè)項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)基金資助衛(wèi)辦醫(yī)政函KJ130313) 國(guó)家臨床重點(diǎn)專[2012]649號(hào)~~
【分類號(hào)】：R764.21

【參考文獻(xiàn)】

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1 谷麗;郭其云;狄國(guó)華;陳婷婷;劉丹;;兒童分泌性中耳炎手術(shù)治療后生活質(zhì)量的評(píng)估[J];中華耳科學(xué)雜志;2016年03期

2 柯嘉;姜立偉;潘滔;馬芙蓉;;兒童及青少年中耳炎聽(tīng)力損失相關(guān)因素分析[J];中華耳科學(xué)雜志;2016年01期

3 薛鑫;陳星星;王冠;郭喬楠;劉明永;趙建華;;甲�；氖荏w1對(duì)BV-2細(xì)胞遷移的影響及機(jī)制的體外研究[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2016年01期

【共引文獻(xiàn)】

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1 黃灼良;張學(xué)斌;胡瑩;;咽鼓管用藥聯(lián)合鼻內(nèi)鏡下鼓膜穿刺治療分泌性中耳炎臨床效果觀察[J];黑龍江醫(yī)學(xué);2017年06期

2 蓋建青;孫寶霞;艾建偉;張虹;王俊閣;;中藥耳凈散治療慢性化膿性中耳炎活動(dòng)期的應(yīng)用研究[J];中華耳科學(xué)雜志;2017年02期

3 劉佳麗;王維;王子萌;范芳梅;馬毓蓉;余林;何於娟;;小鼠急性未分型流感嗜血桿菌中耳炎差異基因的互作網(wǎng)絡(luò)特征分析[J];中華耳科學(xué)雜志;2017年01期

4 董曉斌;柏正群;李曼;;鼻內(nèi)鏡下腺樣體切除+鼓膜置管治療兒童分泌性中耳炎[J];中國(guó)現(xiàn)代藥物應(yīng)用;2016年23期

5 陶佳;羅仁忠;劉碧霞;李玉云;;改良咽鼓管吹張治療兒童分泌性中耳炎的短期療效評(píng)估[J];中華耳科學(xué)雜志;2016年05期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 金雪玲;張劍;羅五根;馮琨;;鼓室硬化的病因及治療[J];臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志;2014年22期

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3 郝欣平;李永新;于子龍;鄭雅麗;;純音聽(tīng)力測(cè)試對(duì)慢性化膿性中耳炎患者聽(tīng)骨鏈狀態(tài)的評(píng)估價(jià)值[J];中國(guó)耳鼻咽喉頭頸外科;2012年04期

4 柯嘉;馬芙蓉;杜晨;潘滔;張珂;;兒童及青少年慢性化膿性中耳炎臨床特點(diǎn)[J];中國(guó)耳鼻咽喉頭頸外科;2011年07期

5 譚沛;陳陽(yáng);邱建華;陳俊;高偉;許敏;;慢性化膿性中耳炎手術(shù)前后患者生活質(zhì)量的調(diào)查分析[J];中華耳科學(xué)雜志;2011年02期

6 錢(qián)怡;胡國(guó)華;;兒童中耳先天性膽脂瘤的診斷和預(yù)后[J];臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志;2010年13期

7 朱富高;孫美紅;華輝;;慢性化膿性中耳炎的聽(tīng)骨鏈病變及對(duì)聽(tīng)力的影響[J];臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志;2008年07期

8 梁象逢,區(qū)永康,陳穗俊,鄭億慶,丁健慧,許耀東,楊芳,陳玲;兒童與成人慢性化膿性中耳炎聽(tīng)力學(xué)分析[J];聽(tīng)力學(xué)及言語(yǔ)疾病雜志;2004年05期

9 ;兒童中耳炎診斷和治療指南(草案)[J];中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志;2008年12期

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3 楊永弘,王亞娟,姚德秀,燕潤(rùn)菊,王春連,幺遠(yuǎn),Anne Jaakkola,Maija Leinonen,Didier Leboulleux,Heikki Peltola;b型流感嗜血桿菌在兒童急性下呼吸道感染中的地位[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2000年05期

4 王紅霞,曹愛(ài)芳;流感嗜血桿菌所致的呼吸道感染的臨床分析[J];齊魯護(hù)理雜志;2000年04期

5 胡熙金;腹水中分離出流感嗜血桿菌[J];華南國(guó)防醫(yī)學(xué)雜志;2000年03期

6 高薇,胡翼云,甄景惠,俞桑潔,楊永弘;流感嗜血桿菌抗生素敏感性檢測(cè)及方法比較[J];河北醫(yī)學(xué);2001年12期

7 萬(wàn)成松,余清;流感嗜血桿菌的基因組學(xué)研究進(jìn)展[J];生命科學(xué)研究;2002年S2期

8 方靜,李小寧,王明華;皖南地區(qū)流感嗜血桿菌分離培養(yǎng)與藥敏結(jié)果分析[J];皖南醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2004年03期

9 姜敏;楊永弘;;中國(guó)b型流感嗜血桿菌研究歷程[J];中華流行病學(xué)雜志;2006年05期

10 臧煥平;賴國(guó)祥;;老年人流感嗜血桿菌相關(guān)呼吸道疾病研究進(jìn)展[J];醫(yī)學(xué)綜述;2007年02期

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1 姜敏;胡翼云;高薇;沈敘莊;俞桑潔;楊永弘;;巢式多聚酶鏈反應(yīng)技術(shù)在流感嗜血桿菌b型檢測(cè)中的應(yīng)用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十四次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

2 徐志豪;徐峰;沈華浩;李蘭娟;;不可分型流感嗜血桿菌致病機(jī)制的研究進(jìn)展[A];華東地區(qū)第6屆中青年呼吸醫(yī)師論壇暨浙江省第29屆呼吸疾病學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2007年

3 祝婧燁;沈堅(jiān);秦潔;馬相虎;王維;瞿愛(ài)東;;ELISA檢測(cè)b型流感嗜血桿菌多糖方法的建立[A];第五次全國(guó)免疫診斷暨疫苗學(xué)術(shù)研討會(huì)論文匯編[C];2011年

4 劉嵐;景春梅;諶容;謝偉;;240株兒童感染流感嗜血桿菌的耐藥性及莢膜基因分型研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議資料匯編[C];2008年

5 姜敏;胡翼云;沈敘莊;高薇;袁林;俞桑潔;楊永弘;;巢式多聚酶鏈反應(yīng)技術(shù)在b型流感嗜血桿菌檢測(cè)中的應(yīng)用[A];第6次全國(guó)微生物學(xué)與免疫學(xué)大會(huì)論文摘要匯編[C];2004年

6 閔小春;羅少鋒;王威;劉東華;;流感嗜血桿菌的臨床分布及耐藥性分析[A];2013年湖北省暨武漢微生物學(xué)會(huì)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2013年

7 邊興艷;于愛(ài)民;黃燕;;兒童急性上呼吸道感染流感嗜血桿菌的分離及耐藥性分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議資料匯編[C];2008年

8 周昭彥;秦亮;胡必杰;渡邊浩;;社區(qū)呼吸道感染相關(guān)流感嗜血桿菌遺傳特征及抗菌藥物敏感性分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第七次全國(guó)中青年檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2012年

9 張?jiān)?劉家會(huì);繆順莊;;流感嗜血桿菌引起陰道炎2例報(bào)道[A];玉溪市第八屆檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)暨科技成果推廣會(huì)論文匯編[C];2005年

10 陳中舉;朱旭慧;李麗;張蓓;簡(jiǎn)翠;田磊;王斌;朱琴;孫自鏞;;2006年-2008年武漢同濟(jì)醫(yī)院流感嗜血桿菌耐藥性監(jiān)測(cè)[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第八次全國(guó)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨中華醫(yī)學(xué)會(huì)檢驗(yàn)分會(huì)成立30周年慶典大會(huì)資料匯編[C];2009年

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1 李天舒;b型流感嗜血桿菌疾病應(yīng)予關(guān)注[N];健康報(bào);2007年

2 白常樂(lè);秋冬要防流感嗜血桿菌[N];健康報(bào);2002年

3 ;急性細(xì)菌性上呼吸道感染(二)[N];農(nóng)村醫(yī)藥報(bào)（漢）;2007年

4 徐述湘;提高認(rèn)識(shí)重視預(yù)防[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2005年

5 郭姜寧 王曉光;甘肅評(píng)出去年十件科技大事[N];科技日?qǐng)?bào);2005年

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1 王東;流感嗜血桿菌形成生物被膜與慢性阻塞性肺疾患急性發(fā)作相關(guān)性的研究[D];中國(guó)人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院;2009年

2 徐志豪;不可分型流感嗜血桿菌（NTHI）致宿主細(xì)胞炎癥反應(yīng)的分子發(fā)病機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2008年

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1 辛運(yùn)超;氨溴索抗流感嗜血桿菌生物膜機(jī)制的初步研究[D];河北北方學(xué)院;2015年

2 劉恩;不可分型流感嗜血桿菌F蛋白與脂蛋白（a）的相互作用[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

3 李文龍;脂蛋白(a)與重組不可分型流感嗜血桿菌天冬氨酸酶的相互作用[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

4 雷錦堂;流感嗜血桿菌BAM復(fù)合物的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究[D];上海交通大學(xué);2014年

5 桂和翠;流感嗜血桿菌的耐藥性及同源性研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2012年

6 吳軍華;流感嗜血桿菌在蘇州地區(qū)兒童急性呼吸道感染中的地位及耐藥情況探討[D];蘇州大學(xué);2009年

7 尹夢(mèng)夢(mèng);b型流感嗜血桿菌多糖制備工藝及其D蛋白原核可溶性表達(dá)研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2013年

8 高雪;氨溴索對(duì)流感嗜血桿菌生物膜的作用研究[D];河北北方學(xué)院;2014年

9 張燭仙;兒童流感嗜血桿菌分離株的耐藥性分析和血清分型研究[D];浙江大學(xué);2008年

10 趙娜娜;b型流感嗜血桿菌多糖結(jié)合疫苗制備工藝的研究[D];昆明醫(yī)科大學(xué);2014年

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本文編號(hào)：1729803