中國北京漢族人群ABCA4基因的SNPs研究
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【摘要】:目的:研究北京漢族人群中ABCA4基因單核苷酸多態(tài)性,為病因學研究提供依據(jù)。方法:選取國際人類基因組單體型圖計劃(Hap Map)公布的北京漢族人群(Han Chinese in Beijing,China,CHB)ABCA4基因SNPs基因型數(shù)據(jù),利用Haploview4.2軟件對其進行分析。結果:Hapmap提供的343個ABCA4基因的SNPs中,有129個(37.6%)純合基因型SNPs和214個(62.39%)合格SNPs。本研究共確定95個標簽SNPs,構建了3個單體域,各單體域均以前2種單體型為主,累計頻率在91.1%~94.0%之間。結論:通過分析北京漢族人群ABCA4基因SNPs數(shù)據(jù),得到了標簽SNPs、單體域和主要單體型,為進一步的病因學研究打下了基礎。
【作者單位】: 北京大學公共衛(wèi)生學院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學系;
【關鍵詞】: 單核苷酸多態(tài)性(SNPs) ABCA基因 Hap Map Haploview 最小等位基因頻率(MAF) 單體型頻率 Hardy-Weinberg平衡
【基金】:國家自然科學基金(編號:81273164)
【分類號】:R36
【正文快照】: ABCA4基因位于人類1號染色體長臂22區(qū)1帶(1p22.1),全長95 513 bp(http://genome.ucsc.edu/)。ABCA4是三磷酸腺苷結合盒轉運體基因亞家族A中的一員,又被稱為輻射蛋白和ABCR,分為2個區(qū)域,每個區(qū)域有跨膜區(qū)、糖基化胞外域和核苷酸結合結構域各一個,在1997年首次被克隆。單核苷酸
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