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人呼吸道合胞病毒蘭州株全基因組序列測定及分析

發(fā)布時間:2024-04-21 23:51
  目的為了解人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytium virus,HRSV)蘭州株(HRSV LZ01/09)的遺傳特征及分子進化規(guī)律,進一步豐富RSV基因組數據庫,對HRSV LZ01/09的全基因組序列進行測定及分析。方法通過RT-PCR法對HRSV LZ01/09全基因組片段進行擴增及序列測定,利用分子生物學軟件對測序結果進行拼接,并與GenBank登錄的RSV實驗參比株和各基因型代表株進行分子進化分析。結果 HRSV LZ01/09全基因組全長為15 204 bp,基因組的結構為NS1-NS2-N-P-M-SH-G-F-M2-1-M2-2-L,與報道的RSV實驗參比株相同;全基因組序列比對分析表明,HRSV LZ01/09蘭州株基因組序列與RSV RSS2株的同源性最高,為96. 7%,與其他RSV-A亞型毒株同源性次之,為94. 9%~95. 2%,與RSV-B亞型9320株同源性最低,為80. 9%;依據RSV-G基因的第2個可變區(qū)進行系統(tǒng)進化樹分析,HRSV LZ01/09蘭州株基因組與NA1病毒分離株屬于同一個分支。結論 HRSV LZ01...

【文章頁數】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 毒株、載體及細胞
    1.2 主要試劑及儀器
    1.3 引物設計及合成
    1.4 目的基因的擴增
    1.5 克隆質粒的構建
    1.6 序列分析及病毒全基因組和G基因的高變區(qū)系統(tǒng)進化樹分析
    1.7 核苷酸和氨基酸變異位點的分布
2 結果
    2.1 HRSV LZ01/09株基因組的分段擴增、測序及拼接
    2.2 HRSV LZ01/09株基因組的結構特征
    2.3 HRSV LZ01/09株基因組全序列系統(tǒng)進化樹分析
    2.4 HRSV LZ01/09株基因組全序列同源性分析
    2.5 核苷酸和氨基酸變異位點的分布
    2.6 HRSV LZ01/09株基因型分析
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本文編號:3961629

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