目的分析寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)在東南亞地區(qū)的感染傳播情況,探討其分子水平上的進化特征。方法用關鍵詞和主題詞檢索ZIKV在東南亞地區(qū)暴發(fā)感染流行情況。在GenBank中獲取ZIKV東南亞病毒株全基因序列,采用BIOEDIT軟件進行比對;利用MEGA 7. 0軟件繪制系統(tǒng)進化樹;將結構蛋白核苷酸翻譯獲得其相應的氨基酸序列,分析突變情況;統(tǒng)計不同株型間結構蛋白核苷酸突變和氨基酸替代位點;預測包膜蛋白第三結構域(envelop domainⅢ,ED-Ⅲ)的二級結構。結果 ZIKV在東南亞國家均有血清學感染或回顧性檢測陽性報道,其中越南、泰國和新加坡ZIKV感染病例較多,疾病負擔較為嚴重。系統(tǒng)進化樹表明,東南亞ZIKV株均屬于亞洲型,2016年新加坡株(序列號:KY241788)與2015年巴西株親緣關系最近,1966年分離的馬來西亞株與其他東南亞株親緣關系較遠。東南亞ZIKV各株型間衣殼蛋白(capsid protein,C)的堿基突變點為22處,突變率為6. 36%,造成非同義氨基酸突變點為19處,突變率為16. 52%。前膜蛋白(pre-membrane protein...

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【文章目錄】：
1 資料與方法
    1.1 ZIKV東南亞流行情況分析
    1.2 東南亞ZIKV流行毒株分子進化分析
    1.3 結構蛋白突變分析及E蛋白第三結構域（enve-lop domainⅢ，ED-Ⅲ）二級結構預測
2 結果
    2.1 ZIKV東南亞流行情況
    2.2 東南亞ZIKV流行毒株分子進化分析
    2.3 結構蛋白突變分析及ED-Ⅲ二級結構預測
3 討論



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