彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類的耐藥發(fā)生與適應(yīng)性研究
發(fā)布時(shí)間:2022-08-23 21:08
彎曲桿菌(Campylobacter),尤其是空腸彎曲桿菌(Campylobacter jejuni)是一種非常重要的食源性致病菌。氟喹諾酮類和大環(huán)內(nèi)酯類藥物是治療彎曲桿菌感染的首選藥物。由于彎曲桿菌對(duì)氟喹諾酮類藥物的耐藥問題日益嚴(yán)重,大環(huán)內(nèi)酯類藥物對(duì)彎曲桿菌的治療就顯得尤為重要。作為世界第三大類藥物,大環(huán)內(nèi)酯類藥物,尤其是泰樂菌素(動(dòng)物飼料添加劑)和紅霉素(治療用藥)被廣泛用于獸醫(yī)和人醫(yī)臨床。目前,一些流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)顯示,彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物的耐藥率呈現(xiàn)上升趨勢(shì),若不加以防范,就有可能使人彎曲桿菌病的治療陷入無藥可用的境地。因此控制大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的產(chǎn)生、擴(kuò)散和流行勢(shì)在必行。為從源頭上控制耐藥菌的產(chǎn)生,我們必須研究彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯耐藥性的產(chǎn)生規(guī)律和機(jī)制;為有效控制耐藥菌的擴(kuò)散和流行,我們必須研究耐藥菌的適應(yīng)性及其機(jī)制,因?yàn)槟退幘倪m應(yīng)性是決定其在環(huán)境中擴(kuò)散和流行的基本因素。 鑒于高水平大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的危害性,本研究首先建立了一種基于TaqMan探針的實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法,用于特異性鑒別和定量分析彎曲桿菌23SrRNA基因突變,并對(duì)臨床菌的耐藥突變進(jìn)行了初步調(diào)...
【文章頁數(shù)】:189 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
目錄
摘要
Abstract
縮略語表
1 前言
1.1 立題依據(jù)
1.2 彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯耐藥性和適應(yīng)性研究進(jìn)展
1.3 研究內(nèi)容和目標(biāo)
2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯耐藥突變
2.1 引言
2.2 材料方法
2.2.1 藥品與試劑
2.2.2 主要儀器設(shè)備
2.2.3 菌株、培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件
2.2.4 彎曲桿菌的藥物敏感性測定
2.2.5 細(xì)菌基因組提取
2.2.6 彎曲桿菌耐藥相關(guān)突變點(diǎn)的測序鑒定
2.2.7 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的構(gòu)建與確證
2.2.8 TaqMan real-time PCR方法的建立
2.2.9 TaqMan real-time PCR的特異性考查
2.2.10 TaqMan real-time PCR的靈敏性考查
2.2.11 彎曲桿菌分離株的突變分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的序列確證
2.3.2 TaqMan real-time PCR的特異性
2.3.3 TaqMan real-time PCR的靈敏性
2.3.4 彎曲桿菌分離株的耐藥突變特性
2.4 討論
3 高水平大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的體外獲取和適應(yīng)性分析
3.1 引言
3.2 材料方法
3.2.1 藥物
3.2.2 主要儀器設(shè)備
3.2.3 菌種和培養(yǎng)條件
3.2.4 彎曲桿菌對(duì)泰樂菌素的MIC、MPC和MSW的測定
3.2.5 固定濃度誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)和穩(wěn)定性考察
3.2.6 耐藥相關(guān)突變分析
3.2.7 耐藥菌體外適應(yīng)性分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 兩株敏感菌對(duì)泰樂菌素的MIC、MPC和MSW值
3.3.2 體外誘導(dǎo)耐藥菌的表型和基因突變類型
3.3.3 高水平耐藥菌的體外相對(duì)適應(yīng)性
3.4 討論
4 大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的逐步產(chǎn)生過程及其適應(yīng)性變化
4.1 引言
4.2 材料方法
4.2.1 藥物
4.2.2 主要儀器設(shè)備
4.2.3 菌種和培養(yǎng)條件
4.2.4 彎曲桿菌對(duì)紅霉素和泰樂菌素的MIC、MPC和MSW的測定
4.2.5 體外誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)
4.2.6 耐藥相關(guān)突變分析
4.2.7 耐藥菌體外適應(yīng)性分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 兩株敏感菌對(duì)紅霉素和泰樂菌素的MIC、MPC和MSW值
4.3.2 體外誘導(dǎo)過程中耐藥菌的MIC和靶基因突變類型
4.3.3 耐藥菌的體外相對(duì)適應(yīng)性結(jié)果
4.4 討論
5 大環(huán)內(nèi)酯耐藥空腸彎曲桿菌的基因表達(dá)差異分析
5.1 引言
5.2 材料方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)相關(guān)試劑
5.2.2 主要儀器設(shè)備
5.2.3 菌株和背景
5.2.4 細(xì)菌總RNA提取和純化
5.2.5 差異表達(dá)基因的檢測(基因芯片)
5.2.6 差異表達(dá)基因的數(shù)據(jù)分析(基因芯片)
5.2.7 部分差異基因的確證(Real-time RT-PCR、Western-blot)
5.3 結(jié)果
5.3.1 細(xì)菌總RNA的質(zhì)量和純度鑒定
5.3.2 基因芯片的質(zhì)量和數(shù)據(jù)處理的可靠性
5.3.3 68E3系列中耐藥菌的基因表達(dá)差異
5.3.4 76E6系列中耐藥菌的基因表達(dá)差異
5.3.5 68E3和76E6系列中差異基因的比較分析
5.4 討論
5.4.1 彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物的耐藥新機(jī)制
5.4.2 彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯類耐藥相關(guān)適應(yīng)性機(jī)制
6 全文創(chuàng)新性總結(jié)
7 彎曲桿菌對(duì)抗生素耐藥性和適應(yīng)性研究進(jìn)展(綜述)
7.1 彎曲桿菌對(duì)重要抗生素的耐藥性流行情況
7.2 彎曲桿菌對(duì)重要抗生素的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.1 彎曲桿菌對(duì)氟喹諾酮類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.2 彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.3 彎曲桿菌對(duì)四環(huán)素類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.4 彎曲桿菌的多重耐藥機(jī)制
7.3 耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性研究
7.3.1 氟喹諾酮類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.3.2 大環(huán)內(nèi)酯類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.3.3 四環(huán)素類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
答辯主要問題及回答
本文編號(hào):3678484
【文章頁數(shù)】:189 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
目錄
摘要
Abstract
縮略語表
1 前言
1.1 立題依據(jù)
1.2 彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯耐藥性和適應(yīng)性研究進(jìn)展
1.3 研究內(nèi)容和目標(biāo)
2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯耐藥突變
2.1 引言
2.2 材料方法
2.2.1 藥品與試劑
2.2.2 主要儀器設(shè)備
2.2.3 菌株、培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件
2.2.4 彎曲桿菌的藥物敏感性測定
2.2.5 細(xì)菌基因組提取
2.2.6 彎曲桿菌耐藥相關(guān)突變點(diǎn)的測序鑒定
2.2.7 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的構(gòu)建與確證
2.2.8 TaqMan real-time PCR方法的建立
2.2.9 TaqMan real-time PCR的特異性考查
2.2.10 TaqMan real-time PCR的靈敏性考查
2.2.11 彎曲桿菌分離株的突變分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的序列確證
2.3.2 TaqMan real-time PCR的特異性
2.3.3 TaqMan real-time PCR的靈敏性
2.3.4 彎曲桿菌分離株的耐藥突變特性
2.4 討論
3 高水平大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的體外獲取和適應(yīng)性分析
3.1 引言
3.2 材料方法
3.2.1 藥物
3.2.2 主要儀器設(shè)備
3.2.3 菌種和培養(yǎng)條件
3.2.4 彎曲桿菌對(duì)泰樂菌素的MIC、MPC和MSW的測定
3.2.5 固定濃度誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)和穩(wěn)定性考察
3.2.6 耐藥相關(guān)突變分析
3.2.7 耐藥菌體外適應(yīng)性分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 兩株敏感菌對(duì)泰樂菌素的MIC、MPC和MSW值
3.3.2 體外誘導(dǎo)耐藥菌的表型和基因突變類型
3.3.3 高水平耐藥菌的體外相對(duì)適應(yīng)性
3.4 討論
4 大環(huán)內(nèi)酯耐藥彎曲桿菌的逐步產(chǎn)生過程及其適應(yīng)性變化
4.1 引言
4.2 材料方法
4.2.1 藥物
4.2.2 主要儀器設(shè)備
4.2.3 菌種和培養(yǎng)條件
4.2.4 彎曲桿菌對(duì)紅霉素和泰樂菌素的MIC、MPC和MSW的測定
4.2.5 體外誘導(dǎo)實(shí)驗(yàn)
4.2.6 耐藥相關(guān)突變分析
4.2.7 耐藥菌體外適應(yīng)性分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 兩株敏感菌對(duì)紅霉素和泰樂菌素的MIC、MPC和MSW值
4.3.2 體外誘導(dǎo)過程中耐藥菌的MIC和靶基因突變類型
4.3.3 耐藥菌的體外相對(duì)適應(yīng)性結(jié)果
4.4 討論
5 大環(huán)內(nèi)酯耐藥空腸彎曲桿菌的基因表達(dá)差異分析
5.1 引言
5.2 材料方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)相關(guān)試劑
5.2.2 主要儀器設(shè)備
5.2.3 菌株和背景
5.2.4 細(xì)菌總RNA提取和純化
5.2.5 差異表達(dá)基因的檢測(基因芯片)
5.2.6 差異表達(dá)基因的數(shù)據(jù)分析(基因芯片)
5.2.7 部分差異基因的確證(Real-time RT-PCR、Western-blot)
5.3 結(jié)果
5.3.1 細(xì)菌總RNA的質(zhì)量和純度鑒定
5.3.2 基因芯片的質(zhì)量和數(shù)據(jù)處理的可靠性
5.3.3 68E3系列中耐藥菌的基因表達(dá)差異
5.3.4 76E6系列中耐藥菌的基因表達(dá)差異
5.3.5 68E3和76E6系列中差異基因的比較分析
5.4 討論
5.4.1 彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物的耐藥新機(jī)制
5.4.2 彎曲桿菌大環(huán)內(nèi)酯類耐藥相關(guān)適應(yīng)性機(jī)制
6 全文創(chuàng)新性總結(jié)
7 彎曲桿菌對(duì)抗生素耐藥性和適應(yīng)性研究進(jìn)展(綜述)
7.1 彎曲桿菌對(duì)重要抗生素的耐藥性流行情況
7.2 彎曲桿菌對(duì)重要抗生素的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.1 彎曲桿菌對(duì)氟喹諾酮類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.2 彎曲桿菌對(duì)大環(huán)內(nèi)酯類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.3 彎曲桿菌對(duì)四環(huán)素類藥物的耐藥性產(chǎn)生和耐藥機(jī)制
7.2.4 彎曲桿菌的多重耐藥機(jī)制
7.3 耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性研究
7.3.1 氟喹諾酮類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.3.2 大環(huán)內(nèi)酯類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.3.3 四環(huán)素類耐藥彎曲桿菌的適應(yīng)性
7.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
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答辯主要問題及回答
本文編號(hào):3678484
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