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申克孢子絲菌PalI和PalI樣蛋白生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-02-19 19:09
  為初步了解申克孢子絲菌Sporothrixschenckii基因組中真菌特有蛋白PalI和PalI樣蛋白的生物學(xué)特征,利用在線生物信息學(xué)分析軟件,對(duì)兩蛋白理化特征、功能域、二級(jí)結(jié)構(gòu)、抗原表位等進(jìn)行分析預(yù)測(cè)。發(fā)現(xiàn)兩蛋白理論分子量分別為24.6kDa和75.6kDa,等電點(diǎn)均偏堿性;屬于同一蛋白家族,具有相同的功能域和多個(gè)PKC磷酸化位點(diǎn);兩蛋白在近氨基端區(qū)域相似度較高,并與其他模式真菌中同源蛋白有很高相似度;同時(shí),兩蛋白都有跨膜區(qū),氨基端序列三級(jí)結(jié)構(gòu)極為相似,并有豐富的抗原表位。通過(guò)生物信息學(xué)分析對(duì)申克孢子絲菌PalI和PalI樣蛋白生物學(xué)特征有了初步的認(rèn)識(shí),為后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究提供有力支持。 

【文章來(lái)源】:菌物學(xué)報(bào). 2019,38(08)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 序列來(lái)源
    1.2 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 基本理化特征
    2.2 蛋白結(jié)構(gòu)
    2.3 功能域及修飾
    2.4 亞細(xì)胞定位
    2.5 抗原表位
3 討論



本文編號(hào):3633461

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