SH-SY5Y細胞基因表達譜芯片的制備及其應(yīng)用研究
發(fā)布時間:2022-01-10 02:41
20世紀90年代,在生命科學(xué)領(lǐng)域中出現(xiàn)了一門新興的尖端技術(shù)----基因芯片技術(shù),它綜合了分子生物學(xué)、微電子學(xué)、物理、化學(xué)等領(lǐng)域的最新科學(xué)技術(shù),經(jīng)過幾年的發(fā)展,目前已經(jīng)廣泛應(yīng)用于人類基因研究中。然而在基因芯片的研究過程中,一些技術(shù)細節(jié)上需要進一步的摸索。此外在神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域中,神經(jīng)元的分化機理一直是研究熱點。全反式維甲酸作為臨床上一種具有良好抗腫瘤作用的藥物,它可誘導(dǎo)SH-SY5Y細胞向神經(jīng)元分化,并抑制其生長,這一模型一直是研究神經(jīng)元分化的經(jīng)典模型。由于參與這一過程的機制比較復(fù)雜,因而需要采用基因芯片技術(shù)進一步研究。本課題根據(jù)這一線索,采用馬文麗、鄭文嶺等建立的RD技術(shù)制備SH-SY5Y細胞基因表達譜芯片,在基因芯片的制備上做了一些研究,同時應(yīng)用自制的基因表達譜芯片,研究了RA誘導(dǎo)SH-SY5Y細胞分化的基因表達變化。 研究內(nèi)容分為三部分: 1、應(yīng)用RD技術(shù)構(gòu)建SH-SY5Y細胞基因片段文庫。收集大量的基因探針,這是基因芯片制作的前提。在文庫構(gòu)建過程中,對其中的一些技術(shù)細節(jié),如在DNA銀染與RD技術(shù)結(jié)合、PCR產(chǎn)物純化、探針數(shù)據(jù)的管理、EST的生物信息學(xué)分析等方面進行了探索。...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
數(shù)據(jù)庫軟件的界面
圖6arrayl比值的頻率分布圖Fig6frequeneyofratioinarraylRAIPairIMean(loc日GC)門匕。圖7別比ayZ比值的頻率分布圖
只八1Pal閑巴an({ocBGC)門七。圖6arrayl比值的頻率分布圖Fig6frequeneyofratioinarraylRAIPairIMean(loc日GC)門匕。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基因芯片診斷病毒性乙型、丙型肝炎[J]. 孫朝暉,馬文麗,鄭文嶺. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2003(04)
[2]Agilent2100 Bioanalyzer在人乳頭瘤病毒檢測中的應(yīng)用[J]. 劉翠華,馬文麗,石嶸,歐陽謙,彭翼飛,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2003(03)
[3]限制性顯示技術(shù)分離差異表達基因——Mac30[J]. 馮春瓊,馬文麗,宋艷斌,吳清華,郭秋野,祝驥,張寶,鄭文嶺. 中華血液學(xué)雜志. 2002(12)
[4]利用基因芯片技術(shù)篩選HIV-1F亞型基因限制性顯示探針[J]. 李凌,馬文麗,祝驥,石嶸,鄭文嶺. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2002(05)
[5]應(yīng)用限制性顯示PCR技術(shù)構(gòu)建細菌poly(A)化mRNA的cDNA文庫[J]. 胡子有,馬文麗,宋艷斌,張寶,鄭文嶺. 生物技術(shù)通訊. 2002(04)
[6]RD-PCR技術(shù)在酵母基因表達譜研究中的應(yīng)用[J]. 劉莉揚,馬文麗,宋艷斌,張寶,鄭文嶺. 西安交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2002(03)
[7]大腸桿菌poly(A)化mRNA基因片段的RD-PCR克隆[J]. 胡子有,馬文麗,宋艷斌,張寶,吳清華,郭秋野,彭翼飛,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2002(03)
[8]一種限制性cDNA文庫的構(gòu)建[J]. 祝驥,馬文麗,李凌,姚汝華,鄭文嶺. 遺傳. 2002(02)
[9]應(yīng)用RD-PCR技術(shù)制備HIV基因芯片探針[J]. 李凌,馬文麗,祝驥,朱利娜,宋艷斌,吳清華,郭秋野,鄭文嶺. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2002(01)
[10]K562細胞經(jīng)氯化高鐵血紅素誘導(dǎo)后分化相關(guān)基因的篩選[J]. 姜立,馬文麗,鄭文嶺,薛社普. 解剖學(xué)報. 2001(04)
本文編號:3579903
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:113 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
數(shù)據(jù)庫軟件的界面
圖6arrayl比值的頻率分布圖Fig6frequeneyofratioinarraylRAIPairIMean(loc日GC)門匕。圖7別比ayZ比值的頻率分布圖
只八1Pal閑巴an({ocBGC)門七。圖6arrayl比值的頻率分布圖Fig6frequeneyofratioinarraylRAIPairIMean(loc日GC)門匕。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基因芯片診斷病毒性乙型、丙型肝炎[J]. 孫朝暉,馬文麗,鄭文嶺. 解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2003(04)
[2]Agilent2100 Bioanalyzer在人乳頭瘤病毒檢測中的應(yīng)用[J]. 劉翠華,馬文麗,石嶸,歐陽謙,彭翼飛,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2003(03)
[3]限制性顯示技術(shù)分離差異表達基因——Mac30[J]. 馮春瓊,馬文麗,宋艷斌,吳清華,郭秋野,祝驥,張寶,鄭文嶺. 中華血液學(xué)雜志. 2002(12)
[4]利用基因芯片技術(shù)篩選HIV-1F亞型基因限制性顯示探針[J]. 李凌,馬文麗,祝驥,石嶸,鄭文嶺. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2002(05)
[5]應(yīng)用限制性顯示PCR技術(shù)構(gòu)建細菌poly(A)化mRNA的cDNA文庫[J]. 胡子有,馬文麗,宋艷斌,張寶,鄭文嶺. 生物技術(shù)通訊. 2002(04)
[6]RD-PCR技術(shù)在酵母基因表達譜研究中的應(yīng)用[J]. 劉莉揚,馬文麗,宋艷斌,張寶,鄭文嶺. 西安交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2002(03)
[7]大腸桿菌poly(A)化mRNA基因片段的RD-PCR克隆[J]. 胡子有,馬文麗,宋艷斌,張寶,吳清華,郭秋野,彭翼飛,鄭文嶺. 第一軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2002(03)
[8]一種限制性cDNA文庫的構(gòu)建[J]. 祝驥,馬文麗,李凌,姚汝華,鄭文嶺. 遺傳. 2002(02)
[9]應(yīng)用RD-PCR技術(shù)制備HIV基因芯片探針[J]. 李凌,馬文麗,祝驥,朱利娜,宋艷斌,吳清華,郭秋野,鄭文嶺. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2002(01)
[10]K562細胞經(jīng)氯化高鐵血紅素誘導(dǎo)后分化相關(guān)基因的篩選[J]. 姜立,馬文麗,鄭文嶺,薛社普. 解剖學(xué)報. 2001(04)
本文編號:3579903
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